lncRNA,组织特异性与泛癌差异-20200826

​        许多老师会通过RNAseq寻找差异表达的lncRNA, mRNA进行机制研究,但RNAseq会筛选出非常多的差异分子,这就遇到一个普遍的问题,如何从众多分子出找出一个合适的基因进行后续研究。小编从事RNAseq实验分析服务多年,常被问起这个问题。挑选分子要挑选有重要功能的,与机制关联起来的分子。那么如何判断这个基因是否有重要功能呢?

          本期我们跟大家聊聊组织特异性分析和泛癌差异分析,比如以下的图是文章中常出现的组织特异性分析:

许多基因尤其是lncRNA具体很强的组织特异性表达,仅能在特定的组织中检测到表达,提示可能在该组织中发挥重要功能。

如果老师是研究肿瘤的,为了说明基因的重要性也可以做一下该基因是否在多肿瘤中都有差异表达,如果多肿瘤有差异,提示其可能有重要功能,如下图:

为了方便老师们使用数据,我们整理了lncRNA,mRNA的组织特异性表达图,泛癌差异图,以供挑选分子参考。

本期主要讨论内容:

(1)组织特异性和泛癌分析说明lncRNA重要功能?

(2)高分文章是如何展示lncRNA组织特异性的?

(3)如何做lncRNA、基因的组织特异性分析?


以下是视频录屏链接,有需要的老师可以观看。

B站 超清链接 :https://www.bilibili.com/video/BV1Gh411R78s

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