Day 4 生信小组学习笔记 御风而行

今日任务：R语言基础

1 R语言基础环境配置

无需云服务器，直接在windows操作系统进行
注意避免中文安装路径，否则无法识别
（已提前安装成功）
Rstudio
调节镜像源 Rstudio内可直接调节默认设置
安装R packages
install packages("xlsx") 普通包的安装
安装生物数据分析包

安装BioManager
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(version = "3.12")
调用BioManager，安装Bioconductor仓库特定包
BiocManager::install(c("GenomicFeatures", "AnnotationDbi"))

2 R语言实战

1. R project项目建立，便于工作管理

2.基本命令

setwd() /getwd() 设置/获取当前工作目录
dir() 显示文件列表
x<-a 赋值
rm(a) 清除变量
rm(list=ls()) 清除global environment中所有变量
history() 列出历史记录
ctrl+L 一键清屏（Console）

3.绘图

plot(rnorm(50)) 绘出以0为平均值，1为标准差的符合正态分布随机数50个
默认rnorm(n, mean = 0, sd = 1)

boxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species,col =c("lightblue", "lightyellow", "lightpink"))
利用R中自带数据集iris中的Sepal.Length列和Species列作图，Length为y轴，Species为x轴，用色为蓝、黄、粉