单细胞转录组数据分析课件||9. Cell type identification in scRNA-seq data

本课件介绍了单细胞转录组数据分析的一个分析点：细胞类型识别。

• 注意区分细胞类型与细胞状态
• 目前大部分细胞类型的定义只能定义出已知的细胞类型，出现定义不了的细胞很正常
• 大部分细胞类型定义工具都是需要先验知识的，也就是监督的学习
• 细胞类型与细胞聚类之间的差异。
• 本文介绍了几款分析工具，主要介绍SingleR的原理其他的没有介绍，不代表不重要。你需要多尝试几款工具，并在这个过程中理解细胞定义的一般思路。

---

---

This lecture by Paulo Czarnewski (NBIS, ELIXIR-SE) is part of the course "Single cell RNA-seq data analysis with R" (27.-29.5.2019). Please see https://www.csc.fi/web/training/-/scr... for the full course description and all the materials.