FeatureExtract--extracts sequences and feature annotation from genbank format file

最近一直在看和植物叶绿体基因组有关的知识，其中有一项内容是分析叶绿体基因组的密码子偏向性，这就要求我们首先要拿到基因的CDS序列，在NCBI的organelle genome数据库中我们通常可以下载到叶绿体全基因组的fasta文件，genbank文件；gff3文件，但是没有把gene和CDS序列单独列出来的文件（如果有的话自己目前也不知道在哪个地方下载）这就需要我们利用现有的文件来提取，今天找到了一个小工具FeatureExtract,网页版和命令行版本都可以使用，用法非常简单，只需上传genbank格式的文件然后选择自己要提取的特征即可。

网址FeatureExtract 1.2L Server

命令行版本用python2.4，还没搞懂各个参数的意思，有时间研究一下再来记录。