高通量数据上传SRA

注：不同类型数据上传不同数据库，此处微生物多样性的上传SRA。测序报告书上有。

https://mp.weixin.qq.com/s/CUGkuaNnAZZ3W5IpPyaS-A

具体步骤看上边链接

以下是弯路和细节补充：

官网NCBI，注册，注册完一定要去邮箱信息激活！！

页面点击My submission，下拉可以看到SRA三个字，点进去。new  submission.

接下来分为8个步骤。

第一步就是信息注册。

第二步你已经有bioproject和biosample了吗，我没有，选择NO。释放时间随意。后来可以再data  management中查看

第三步描述一下，类似于论文题目摘要，简短点。

第四步类型：此处选择metagenome  and environmental  sample

第五步，容易报错。样本名字自己起，加一列ID  123456……!!! 其他的按照上边链接填写 例如soil metagenome等

第六步按照上边链接填写。我第一次没按照上边填写，报错了。双端，filenme  filename2填上。我的Nts1.1 .fq  另一端Nts1.2.fq。原始数据raw.split.fq要按照这个重新命名。双端后缀.1.  .2.区分一下

上传数据，我是用的傻瓜上传。就是网页上点击下载了Aspera软件，然后，点击上传，所有数据一起shift一起选中上传了。我的总共4g，上传用了1小时。

补充：之后上传了宏基因组数据，数据大，使用Aspera指令上传

安装好，找到安装位置，一般是loca之类的，然后把文件名Aspera connect中间的空格去掉。

好了，下一步利用cmd命令

可能用到的文章链接

https://blog.csdn.net/qq_40905198/article/details/101909201

cd C:\Users\18195\AppData\Local\Programs\Aspera\AsperaConnect \bin

ascp -i C:\Users\18195\Downloads\aspera.openssh -QT -l100m -k1 -d C:\files\ [email protected]:uploads/wangqian184_mails.ucas.ac.cn_sjSF4t59