学习小组Day3笔记--呛

day3学习笔记

先供上思维导图，比较详细

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然后是文字版的笔记

conda相当于linux 的应用商店，只是没有图，只有名字
1.打开linux，确认服务器的版本型号，uname -a，
2.百度“miniconda 清华”，找到对应的服务器的最新版，复制url
3.代码：wget 网址url（然后linux会自动下载）
4.代码：ls后可看到你下载的sh脚本，然后bash加名字开始安装，enter键阅读license等东西，最后按照提示输入yes
5.安装完成后要激活conda , 代码：source ~/.bashrc
6.添加conda镜像，加快下载速度

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

至此安装结束
怎么使用呢？
linux没有图形，所以我们必须手动写入链接（就像windows系统每个图片背后都有链接一样）
常用的几个操作
1.打开商店界面：conda list
2.搜索软件 conda search 软件
3.安装软件 conda install fastqc -y （-y是下载后自动安装，建议这个省事）
4.输入软件名字检查能不能用
5卸载软件conda remove 软件 -y（已定价-y，这个装了了一步到位）
若有不明白的指令，可以conda create --help，查看指令意思
大致如上，思维导图里还有切换操作环境的介绍，由于网速问题我的操作一直没成功，就不在这记录了。