集群应用方法2020.12.24

实验室小伙伴已经安装好docker，每个人都有自己的文件夹。

需要软件：
  Xshell 7（终端控制）
  Xftp 7（文件上传）

1.登录（用Xshell 7）

• 1.打开Xshell 7进入终端；
• 2.输入ssh XXX@IP；（XXX是名字的拼音，IP为IP地址）
• 3.输入密码；即可进入终端（直接进入自己的文件夹内）
• 4.进入base环境命令：source ~/anaconda3/bin/activate root
• 5.进入终端后就和正常Linux终端相同。

2.常用指令（用Xshell 7）

• 1.打开编辑文件并进行保存指令们
    1）vim+地址/文件名
    2）直接点击i 就会进入编辑模式，根据按键上的上下左右进行光标的移动
    3）编辑完成后点击Esc退出编辑模式
    4）输入 :wq（有冒号）
• 2.想打开多个终端
    直接双击
  
• 3.查看GPU使用情况
    watch -n 10 nvidia-smi （参数-n之后的10为查看的周期 这句语句代表每隔10秒进行一次GPU使用情况的更新，如果是0，则表示实时更新GPU使用情况）
    nvidia-smi 代表只查看一次GPU使用情况
• 4.中断程序或退出指令
    Ctrl+C
• 5.退出Python模式
    exit（）
• 6.显示内存使用情况
     free -g（表示自己当前的文件夹的内存使用情况GB为单位，如果想以Byte、KB、MB为单位，将-g改为-b、-k、-m即可）
• 7.列出当前文件夹下的所有子目录
    ls
• 8.复制文件（文件夹）
     1）如果想复制文件就用cp 源文件 目标
     2） 如果想复制文件夹就用cp -r 源文件夹 目标
• 9.移动文件（文件夹）
     如果想移动文件就用mv 源文件 目标
• 10.删除文件（文件夹）
     rm -rf 文件名

3.镜像（用Xshell 7）

   清华镜像：https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

4.切换cuda版本

   cd /usr/local
   sudo rm -rf cuda
   sudo ln -s /usr/local/cuda-XX /usr/local/cuda
   XX表示你要切換的cuda的版本

5.文件上传（用Xftp 7）

   在Xshell 7页面点击图标

   打开界面左侧为自己的本地文件夹目录，右侧为集群文件夹内容，想上传文件直接从左侧拉入右侧文件夹内即可。如下图。

6 新建环境（用anaconda）

1.首先安装anaconda
2.bash Anaconda安装包
3.在终端输入anaconda（确保已经安装完成）
4.终端输入vim ~/.bashrc
5.点击i
6.在最后一行输入export PATH=/home/XXX/anaconda3/bin:$PATH
7.按 Esc :wq保存退出
8. 在终端输入source ~/.bashrc 更新配置文件
9. 新建环境：在命令行输入conda create -n 虚拟环境名 python=2.7/3.6…（conda install --yes --file requirements.txt）
10. 激活环境：source activate 虚拟环境名
11. 查看所有环境：终端输入 conda env list