利用KEGG查询多个基因的信号通路

我们可以利用KEGG数据库中的KEGG Mapper工具查询多个基因信号通路。根据基因表达差异列表，利用KEGG Mapper进行转换。示意图如下。

首先，我们将需要查询的基因名称在Uniprot网址上进行ID转换（见前一篇文章），形成的Excel文件中Entry那一栏就是我们查询到的基因Uniprot ID了。

根据表达差异，将含Uniprot ID 和Expression对应，值得注意的是部分基因查询不到对应的Uniprot，或者一个基因对应多个Uniprot，根据自己的内容选择对应的。

可以设置颜色对表达上调或下调进行颜色区分，在Entry一栏旁设置一栏color，我们可以上调设置为“red”,下调设置为“blue”。（颜色必须用英文小写字母，大写不能识别）。然后将Entry 和color两栏复制，输入“Enter objects one per line followed by bgcolor, fgcolor”,点击“Exec”。

根据查询结果，选择你需要的结果。我们选择第一个，TGF-beta信号通路（human）。

这样我们很清晰的看到我们查询的基因在TGF-Beta信号通路中位置和关联。并且通过颜色即可识别该基因上调还是下调。