pythonnet-C#调用python脚本-含matplotlib+biopython

本地环境：
win10，.NET Core 6，Python 3.9.13，pythonnet 3.0.3
测试的包：biopython 1.82，matplotlib 3.5.2

参考：

GitHub - pythonnet/pythonnet: Python for .NET is a package that gives Python programmers nearly seamless integration with the .NET Common Language Runtime (CLR) and provides a powerful application scripting tool for .NET developers.
https://github.com/pythonnet/pythonnet

Python for .NET — pythonnet 2.4.0 文档
https://dev.listera.top/docs/pythonnet/pythonnet.github.io.html

C#/.net程序调用python - 步、步、为营 - 博客园
https://www.cnblogs.com/qsnn/p/17168273.html

Python报错"it could not find or load the Qt platform plugin “windows”-CSDN博客
https://blog.csdn.net/u011732358/article/details/103065543

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问题描述

为了跟同事对接，需要在C#里调用python脚本。

之前写过一篇C#调用python的，但是IronPython调用第三方库有问题，当时是使用远程调用的办法。
c#远程调用linux服务器的Python脚本_c#远程登录其他服务器执行脚本-CSDN博客
https://blog.csdn.net/pxy7896/article/details/121473815

现在有了一个更好的工具pythonnet。

它的优势是可以直接在C#代码里调用本地python脚本，而这个脚本可以放在任何位置，并且可以使用第三方库。我测试用的脚本用到biopython包解析文件，然后使用matplotlib包绘制图像，输出完全符合预期。

安装

在.Net 项目中使用NuGet安装包：

使用

在项目的入口里写：

    static void Main() {
        string pathToVirtualEnv = "D:\\ProgramData\\Anaconda3";
        Runtime.PythonDLL = Path.Combine(pathToVirtualEnv, "python39.dll");
        PythonEngine.PythonHome = Path.Combine(pathToVirtualEnv, "python.exe");
        PythonEngine.PythonPath = "path/to/脚本;xxx/xxx/xxx";
        PythonEngine.Initialize();
        using (Py.GIL())
        {
        	// 基础测试
            //dynamic hello = Py.Import("test");
            //hello.hello();
            
            // 测试numpy
            //dynamic np = Py.Import("numpy");
            //Console.WriteLine(np.cos(np.pi * 2));
            
            // 真实测试
            dynamic draw = Py.Import("drawABI");
            draw.drawGraph("path/to/ab1/xx.ab1", "313", "path/to/out.png");
        }
	}

注意：

1. pathToVirtualEnv是python解释器所在的位置，可以使用虚拟环境，方便管理；
2. PythonEngine.PythonPath里写的是：a)要执行的脚本的位置；b)python包的位置。如果有找不到包的情况，我的解决方案是把sys.path里所有的路径都加到这里。路径之间用;分割；
3. 基础测试里，我是将一个叫test.py的脚本放在path/to/脚本路径下，其内容如下：

   def hello():
   	import sys
   	print(sys.path)
   

   所以正确执行的话，控制台会打印sys.path
4. numpy就是调用numpy做计算，正确执行的话，输出1.0
5. 真实测试是，我有一个脚本叫drawABI，也放在path/to/脚本路径下，其中包含一个函数drawGraph，接收三个参数，最终输出一副图像out.png。

报错

找不到包

首先检查是否正确安装了。如果c#外可以正常执行，那么可以考虑将sys.path里所有路径都加入PythonEngine.PythonPath。

正常来说是将Lib和Lib\site-packages加入就可以了，不过我把所有加入了才解决问题。。可能是我的biopython装得位置比较奇怪。

cannot find or load the Qt platform plugin

这个一般是PyQt5没装好。

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple pyqt5

查找python包的安装位置

# 没安装好
pip show PyQt5
WARNING: Package(s) not found: PyQt5

# 安装好了
(base) C:\Users\xxx>pip show biopython
Name: biopython
Version: 1.82
Summary: Freely available tools for computational molecular biology.
Home-page: https://biopython.org/
Author: The Biopython Contributors
Author-email: [email protected]
License:
Location: c:\users\xxxx\site-packages
Requires: numpy
Required-by: