Bryan Ding
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python版：使用TotalSegmentator可在1分钟内自动分割全身117个器官，附批量技巧

TotalSegmentator是在大型数据集上使用nnUNet V2训练的一个AI模型，可以在CT数据上自动分割全身117个器官（见文末）！同时还可以分割部分血管，脑出血，胸腔积液等（后面会介绍）。主打一个快准狠！排版问题，代码进入上方csdn号查看

TotalSegmentator用于对 CT 图像中超过 117 个类别进行分割的工具。它接受了各种不同 CT 图像（不同扫描仪、机构、协议等）的训练，因此应该适用于大多数图像。大部分训练数据集可以从Zenodo下载（1228 个主题）。您还可以在totalsegmentator.com上在线试用该工具。

python版：使用TotalSegmentator可在1分钟内自动分割全身117个器官，附批量技巧_第1张图片

TotalSegmentator v2版本

一句话概要：TotalSegmentator是在大型数据集上使用nnUNet V2训练的一个AI模型，可以在CT数据上自动分割全身117个器官（见文末）！同时还可以分割部分血管，脑出血，胸腔积液等（后面会介绍）。

本文目录

  • Totalsegmentator 版本

  • Totalsegmentator python版安装

    • 如何安装

  • Totalsegmentator 快速使用

  • Totalsegmentator 高级使用

    • 1. 除了上述器官分割外，还可以分割下面的一些子任务

    • 2. 分割单一器官或几个器官

    • 3.预览分割结果

    • 4.所有器官分割结果存在一个文件里面

    • 5.批量处理所有图像

    • 6. 在python中运行totalsegmentator

  • Totalsegmentator可以分割哪些器官

Totalsegmentator 版本

一共有两个版本，各有千秋，选择适合自己的版本

  • 3D Slicer版本: 之前已经介绍过了，并且获得了广大朋友的喜欢。也是迄今为止Tina姐最受欢迎的教程。它的优势是提供了可视化的界面，自动分割完后，可以对结果进行实时修改。缺点是可调参数比python版少，只能one by one, 没法批量操作。且受网速影响，有的朋友在3D Slicer中并不能顺畅使用。

快准狠！在3D Slicer中，使用Total Segmentator可在1分钟内分割全身117个器官

  • python版本: 它的特点是一次安装好后，即可在终端使用少量命令进行批处理。也可以设置想要的分割哪些器官，不用全部分割。对编程能力有一定要求，且分割完的结果需要手动审阅修改。

接下来是 python 版本实战

Totalsegmentator python版安装

如何安装

TotalSegmentator

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