利用 Python 绘制和弦图:用途、代码详解与应用场景(第四天)

一、引言

在数据可视化的世界里,和弦图(Chord Diagram)是一种独特且强大的工具。它能够清晰地展示多个实体之间的相互关系和流量,以一种直观而富有艺术感的方式呈现复杂的数据结构。

在当今数据爆炸的时代,我们面临着海量的数据,如何从这些数据中提取有价值的信息并以易懂的方式呈现出来,是数据分析师和研究者们面临的重要挑战。和弦图以其独特的可视化方式,为我们提供了一种有效的解决方案。

本文将深入探讨和弦图的用途,使用 Python 的 plotly 库来绘制和弦图,并对代码进行详细讲解,帮助你掌握这一实用的可视化技巧。

二、和弦图的用途

2.1 展示数据关联

和弦图最主要的用途之一是展示多个实体之间的关联关系。例如,在社交网络分析中,可以用和弦图展示不同用户之间的互动频率。每个用户作为一个实体,用户之间的互动次数可以用线条的粗细来表示。

在国际贸易中,和弦图能够呈现不同国家之间的商品贸易流量。国家作为实体,贸易额的大小反映在和弦图中线条的粗细上。通过和弦图,我们可以直观地看到哪些实体之间的联系更为紧密,以及联系的强度如何。

2.2 发现数据模式

通过观察和弦图中线条的粗细和颜色分布,我们可以发现数据中的潜在模式。比如,某些实体之间可能存在频繁的双向交流,在和弦图中表现为较粗的双向线条。

而另一些实体之间的联系则相对较弱,线条较细。这些模式可以帮助我们深入理解数据背后的逻辑和规律,例如在分析生物基因相互作用时,发现某些基因之间存在紧密的关联,可能暗示着它们在生物功能上的协同作用。

2.3 数据对比

和弦图也适用于对比不同时间段或不同条件下的实体关系。例如,对比不同年份的国际贸易数据,观察贸易格局的变化。

可以绘制不同年份的和弦图,对比线条粗细和颜色的变化,从而清晰地看到哪些国家之间的贸易关系增强了,哪些减弱了。或者对比不同地区的社交网络互动情况,找出差异和特点,为制定针对性的营销策略或社交政策提供依据。

三、Python 绘制和弦图的代码实现

3.1 准备工作

在开始之前,我们需要安装 plotly 库,可以使用以下命令进行安装:

pip install plotly

plotly 是一个功能强大的 Python 可视化库,支持多种图表类型,包括和弦图。它提供了简洁易用的 API,能够帮助我们快速创建高质量的可视化图表。

3.2 示例代码及详细讲解

import plotly.graph_objects as go
import pandas as pd

# 示例数据
# 这里我们创建一个简单的 4x4 矩阵,表示 4 个实体之间的关系强度
data = [
    [0, 10, 20, 30],
    [10, 0, 15, 25],
    [20, 15, 0, 20],
    [30, 25, 20, 0]
]

# 定义实体名称
entities = ['A', 'B', 'C', 'D']

# 创建 DataFrame
df = pd.DataFrame(data, index=entities, columns=entities)

# 创建和弦图
fig = go.Figure(data=go.Chord(
    # 矩阵数据,用于表示实体之间的关系强度
    matrix=df.values.tolist(),
    # 实体名称列表
    labels=df.index.tolist(),
    # 颜色设置,这里我们使用默认颜色
    colorscale='Viridis'
))

# 更新布局
fig.update_layout(
    # 设置图表标题
    title_text='示例和弦图',
    # 自动调整图表大小以适应容器
    autosize=True,
    # 移除图例
    showlegend=False
)

# 显示图表
fig.show()

代码解释

1. 导入必要的库
import plotly.graph_objects as go
import pandas as pd
  • import plotly.graph_objects as go:导入 plotly 的图形对象模块,用于创建各种类型的图表。graph_objects 提供了丰富的图形对象类,我们可以使用这些类来构建具体的图表。
  • import pandas as pd:导入 pandas 库,用于数据处理和创建 DataFramepandas 是 Python 中常用的数据处理库,它提供了高效的数据结构和数据操作方法,方便我们对数据进行整理和分析。
2. 准备数据
# 示例数据
# 这里我们创建一个简单的 4x4 矩阵,表示 4 个实体之间的关系强度
data = [
    [0, 10, 20, 30],
    [10, 0, 15, 25],
    [20, 15, 0, 20],
    [30, 25, 20, 0]
]

# 定义实体名称
entities = ['A', 'B', 'C', 'D']

# 创建 DataFrame
df = pd.DataFrame(data, index=entities, columns=entities)
  • data:定义一个二维列表,表示 4 个实体之间的关系强度矩阵。矩阵的对角元素通常为 0,表示实体自身与自身没有关联。在实际应用中,这个矩阵可以根据具体的数据进行填充。
  • entities:定义实体的名称列表,用于在和弦图中标识各个实体。
  • df = pd.DataFrame(data, index=entities, columns=entities):将数据转换为 DataFrame,方便后续处理。DataFrame 是 pandas 中常用的数据结构,类似于 Excel 表格,具有行索引和列索引,便于数据的操作和展示。
3. 创建和弦图
# 创建和弦图
fig = go.Figure(data=go.Chord(
    # 矩阵数据,用于表示实体之间的关系强度
    matrix=df.values.tolist(),
    # 实体名称列表
    labels=df.index.tolist(),
    # 颜色设置,这里我们使用默认颜色
    colorscale='Viridis'
))
  • fig = go.Figure(data=go.Chord(...)):使用 go.Chord 函数创建和弦图对象,并将其添加到 Figure 中。Figure 是 plotly 中表示图表的对象,它可以包含一个或多个图形元素。
  • matrix=df.values.tolist():将 DataFrame 的值转换为列表,作为和弦图的矩阵数据。df.values 可以获取 DataFrame 中的数值数据,tolist() 方法将其转换为列表形式。
  • labels=df.index.tolist():将 DataFrame 的索引转换为列表,作为和弦图的实体标签。这样在和弦图中就可以显示出各个实体的名称。
  • colorscale='Viridis':设置和弦图的颜色比例尺,这里使用 Viridis 颜色方案。颜色比例尺可以控制和弦图中线条和区域的颜色,不同的颜色可以表示不同的数值范围或属性。
4. 更新布局
# 更新布局
fig.update_layout(
    # 设置图表标题
    title_text='示例和弦图',
    # 自动调整图表大小以适应容器
    autosize=True,
    # 移除图例
    showlegend=False
)
  • fig.update_layout(...):更新图表的布局设置。update_layout 方法可以修改图表的各种布局属性,如标题、大小、图例等。
  • title_text='示例和弦图':设置图表的标题,方便用户快速了解图表的主题。
  • autosize=True:自动调整图表大小以适应容器。这样可以确保图表在不同的显示环境中都能正常显示。
  • showlegend=False:移除图例。在某些情况下,图例可能会占用图表的空间,影响整体的美观度,因此可以选择移除。
5. 显示图表
# 显示图表
fig.show()

fig.show():显示绘制好的和弦图。show 方法会在浏览器中打开一个新窗口,展示生成的图表。

四、和弦图的解读

4.1 实体标签

和弦图周围的标签表示不同的实体。在我们的示例中,标签为 ABCD,代表 4 个不同的实体。这些标签可以帮助我们快速识别每个实体,理解它们在数据关系中的角色。

4.2 线条粗细

线条的粗细表示实体之间的关系强度。线条越粗,说明两个实体之间的关联越紧密;线条越细,则关联越弱。例如,在我们的示例中,如果 A 和 D 之间的线条比 A 和 B 之间的线条粗,说明 A 和 D 之间的关系强度更大。通过观察线条粗细的变化,我们可以直观地比较不同实体之间关系的强弱。

4.3 颜色

颜色通常用于区分不同的实体或表示关系的某种属性。在我们的示例中,使用 Viridis 颜色比例尺,颜色的深浅可以反映关系强度的大小。颜色较深的线条可能表示关系强度较大,颜色较浅的线条则表示关系强度较小。颜色的设置可以增强和弦图的可视化效果,帮助我们更清晰地理解数据。

五、实际应用案例

5.1 音乐领域

在音乐分析中,和弦图可以展示不同音乐元素(如音符、和弦)之间的转换关系。通过观察和弦图,音乐家可以发现音乐中的和声模式和规律。

例如,在一首歌曲中,某些音符或和弦之间的转换频率较高,在和弦图中表现为较粗的线条。音乐家可以根据这些模式进行创作和演奏,为音乐作品增添更多的创意和变化。

5.2 交通领域

在交通流量分析中,和弦图可以展示不同地点之间的人员或车辆流动情况。例如,展示城市中不同区域之间的通勤流量。

通过和弦图,交通规划者可以清晰地看到哪些区域之间的通勤流量较大,哪些区域之间的联系相对较弱。这有助于他们优化交通路线和资源分配,提高交通效率,缓解交通拥堵。

5.3 生物信息学

在生物信息学中,和弦图可以用于展示基因之间的相互作用关系。通过分析和弦图,生物学家可以了解基因网络的结构和功能。

例如,某些基因之间存在紧密的关联,可能暗示着它们在生物功能上的协同作用。这为疾病研究和药物开发提供了线索,帮助科学家更好地理解疾病的发病机制,开发更有效的治疗方法。

六、总结

和弦图是一种强大而直观的数据可视化工具,能够有效地展示多个实体之间的关联关系和流量。通过 Python 的 plotly 库,我们可以轻松地创建高质量的和弦图。

在实际应用中,我们可以根据具体需求调整数据和图表的参数,如颜色比例尺、线条样式等,以获得最佳的可视化效果。同时,我们需要结合具体的业务场景和数据特点,深入解读和弦图所传达的信息,为决策提供有力支持。

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