- rdkit&networkx | smiles与graph与邻接矩阵相互转换
ASKCOS
AIDDCADD化学生物
fromrdkitimportrdBase,Chemfromrdkit.ChemimportAllChem,Drawfromrdkit.Chem.DrawimportrdMolDraw2DfromIPython.displayimportSVGfrommatplotlib.colorsimportColorConverterimportnetworkxasnximportargparse
- Draw2D 教程(一)
ioriogami
eclipseswt图形程序开发shell平台
1、理解Draw2dDraw2d是SWT平台上的图形库,你可以用它定制属于自己的、不依赖于特定操作系统本地组件的上层组件;也可以用它开发基于图形的应用程序。一般来说,基础代码编写者/GUI组件提供者们使用前一个功能,像译者这样开发应用程序的人则使用后者更多一些。Draw2d库依赖于SWT(不依赖JFace),提供了完整的图形应用程序开发包,使用它你几乎可以作出任意的图形,但是除了简单的几何图形以外
- Draw2D教程(二)
ioriogami
eclipseswtbutton图形importshellswing
2、Draw2dFigures构建一个Draw2dGUI需要写很多代码。但是,区别于SWT/JFace的GUI元素,Draw2d的组件支持移动以及其他各种操作,这些组件都是Figure的子类实例。Figure的这些子类构成Draw2dGUI的可视部分。图C.3列出了其中的一部分子类,它们都是很重要的。图C.3列出的子类普遍应用于我们的flowchart中,尤其是那些和Connection、Laye
- 用Python生成化学结构式
叙利亚瓜哥
python前端
fromrdkitimportChemfromrdkit.Chem.DrawimportrdMolDraw2Dprint("欢迎使用化学式绘制工具!")while1:#绘制主链print("示例:CCC(C)CC是第三个碳原子上有有一个碳链,这个碳链由一个碳原子构成。")model=input("输入化学式:")ifmodel=="exit":exit()#mol=Chem.MolFromSmil
- draw2d根据两点位置画圆弧
哭哭啼
draw2dSWTjava开发语言
可以说圆的中心是(x0,y0),圆弧包含您的两个点(x1,y1)和(x2,y2)。然后半径为:r=sqrt((x1-x0)(x1-x0)+(y1-y0)(y1-y0))。一、已知两点画圆弧publicvoiddrawArc(Pointp1,Pointp2,Objectobject){intxCenter=p1.x;if(p1.x>p2.x)xCenter=p2.x+((p1.x-p2.x)/2);
- ClearCase完全攻略(十二) CCRC客户端安装和插件安装
hhg208
ClearCase
CCRC的环境配置说起来简单,其实折腾人。首先确认下开发工具IDE和CCRC的版本对应关系SystemRequirementsfortheClearCaseRemoteClient,这个至少可以解决一般的安装问题。接下来就是Eclipse可能需要提示缺少org.eclipse.draw2d插件,所以需要手工安装GEF这个插件,下载地址。注意版本对应。Clearcase好像版本上下不兼容,CCRC2
- GEF入门系列(一、Draw2D)
kernel_engine
关于Java2D相信大家都不会陌生,它是基于AWT/Swing的二维图形处理包,JDK附带的示例程序向我们展示了Java2D十分强大的图形处理能力。在Draw2D出现以前,SWT应用程序在这方面一直处于下风,而Draw2D这个SWT世界里的Java2D改变了这种形势。可能很多人还不十分了解GEF和Draw2D的关系:一些应用程序是只使用Draw2D,看起来却和GEF应用程序具有相似的外观。原因是什
- Draw2D教程(二)
iteye_19278
Eclipse
原文:http://dev.csdn.net/author/ioriogami/b06d02e470ff483ba02c2fefe804072d.html2、Draw2dFigures构建一个Draw2dGUI需要写很多代码。但是,区别于SWT/JFace的GUI元素,Draw2d的组件支持移动以及其他各种操作,这些组件都是Figure的子类实例。Figure的这些子类构成Draw2dGUI的可视
- 图形布局-Layout 之js设计实现
iteye_3606
前言定位browser的chart,VML,SVG,HTML5Canvas使用的方式各不一样。如果使用现有的jslibrary(各种实现js图表的library汇总与比较),调用的API方式也肯定不同。举个例子:draw2d使用addFigure和setPosition都可以设置图的位置。混在特定技术或是特定library里去layout,很明显不是一个明智之举。切分开来,layout的功能对于任
- iOS Dev 绘图_在屏幕上画一条线
那个小五先生
移动开发_iOS学习笔记
前段时间,忽然想学一下关于在屏幕上绘制图形,我的书上有,但是没怎么看,之后想找一个最简单的例子看一看,发现像这样的博客很多很多,但是我按照他们所说的做了,同样添加了一个Draw2D.h和Draw2D.m文件并继承自UIView,并且重写了drawRect:方法-(void)drawRect:(CGRect)rect{CGContextRefcontext=UIGraphicsGetCurrentC
- draw2d 使用心得
henrydlwang
GEF
可以不用显式创建lightweightsystem类就可以展现图形。层次结构:Display->Shell->FigureCanvas->Figures(需要展现的Figure),代码框架见最后的代码示例。其中特别需要注意的是,如果FigureCanvas没有指定大小(setSize()),其包括的图形不会正常展现。怀疑是没有建立坐标,无法画出子图。另外很奇怪的一点,如果在上面的content使用
- 【原创】轻量级图形组件系统Draw2d(二十二)
congqiongtang9427
Draw2d提供了在SWT的Canvas上展现和布局的能力,GEF通过Draw2d实现GEF的视图(GEF的视图和插件的视图是完全不同的概念)。Draw2d简介Draw2d是基于SWT的轻量级组件系统。Draw2d的实例由SWT的组件、Lightweight-System和Draw2d的figures组成。SWT的组件是Draw2d的容器,figures是Draw2d中的图形,Lightweigh
- 理解 Draw2d Connection
ssusriqpl_java
classimport框架
在前面的代码里,我们不止一次地看到了FixedAnchor这个类,它继承了AbstractConnectionAnchor,使得你可以可以给两个Figure之间添加连线。由于Connection创建组件之间的联系,所以它们在系统模型和图表中担任重要角色。管理Connection以及它们的ConnectionAnchor比较复杂,因此理解它们的机制是非常重要的。5.1、使用ConnectionAnc
- Draw2d Label
ssusriqpl_java
在Draw2d中,IFigure对象代表图形,IFigure对象还能包含其他的IFigure对象,所有的IFigure对象组合成用户指定的图形通常用户可以继承Figure类实现自己的图形。Figure实现了IFigure接口我下面写了个实例,实现了一个Figure,并设置边框为LineBorder(边框类似为连线),而且还给它加了颜色,好像是淡绿色,对颜色没啥研究,另外还添加了以个Label作为显
- Draw2d 学习笔记五 布局管理器 ScrollPaneLayout ScrollPane
iteye_7333
JavaDraw2d
关键字:Draw2dScrollPaneLayoutScrollPane布局管理器滚动条publicclassHelloWorld{publicstaticvoidmain(Stringargs[]){Shellshell=newShell();shell.setText("Draw2dHelloWorld");shell.setSize(300,300);shell.open();//creat
- 一招搞定可视化工作流设计器开发 巧用draw2d绝战可视化工作流设计器 友好的开源协议MIT
Lancker
workflow
技术岛公众号工作流通常会使用xml进行管理与配置,之间流转关系使用不同的xml节点进行配置,看着xml文件,很难直接Get到流程之间的流转关系。如果使用可视化的呈现来展现工作流,则很好的解决这个问题。更好的管理与维护。可视化呈现,自然离不开图形的操作。Github上找以2个非常有价值的工程,分别是:https://github.com/jifuwei/workflow-designer-webht
- RDKit | 基于RDKit绘制带原子和键的索引、注释和立体化学
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基于RDKit绘制带原子和键的索引、注释和立体化学导入库fromrdkitimportChemfromrdkit.ChemimportDrawfromrdkit.Chem.DrawimportrdMolDraw2Dfromrdkit.ChemimportrdDepictorrdDepictor.SetPreferCoordGen(True)fromrdkit.Chem.DrawimportIPyt
- RDKit | 将rdMolDraw2D和RDKit生成的结构图输出到Excel
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RDKit化学信息学与AI
环境Windows10Python3.6.8RDKit2020.03.3导入库fromrdkitimportChemfromrdkit.ChemimportDraw,AllChemfromrdkit.Chem.DrawimportrdMolDraw2DfromIPython.displayimportSVGfromrdkit.ChemimportPandasToolsimportpandasasp
- RDKit | 基于RDKit的指定原子或键高亮
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RDKit化学信息学与AI
基于RDKit的指定原子或键高亮指定原子或键高亮HilightChemAtom.pyfromrdkitimportChemfromrdkit.Chem.DrawimportrdMolDraw2DfromIPython.displayimportSVGfromioimportBytesIOfromPILimportImagefromcairosvgimportsvg2pngimportargpars
- RDKit | 基于RDKit通过SMARTS定义反应模式来生成反应产物
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RDKit化学信息学与AI
简介RDKit中,通过SMARTS定义一个反应模式,并根据该模式从反应物中生成产物。环境Windows10proRDkit2019.09.1化学反应尝试碳原子的羟基化反应。SMARTS:[C:1]>>[C:1][OH]反应物代码示例导入库fromrdkit.ChemimportAllChemfromrdkit.Chem.DrawimportrdMolDraw2DfromioimportBytesI
- RDKit | 基于RDKit绘制化学反应
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RDKit化学信息学与AI
基于RDKit绘制化学反应导入库fromrdkitimportRDConfigimportunittestimportrandomfromrdkitimportChemfromrdkit.ChemimportDraw,AllChemfromrdkit.Chem.DrawimportrdMolDraw2DfromrdkitimportGeometry%matplotlibinlinefromnump
- RDKit | 基于Ward方法对化合物进行分层聚类
qq2648008726
RDKit化学信息学与AI
从许多化合物构建结构多样的化合物库:聚类方法基于距离的方法基于分类的方法使用优化方法的方法通过使用Ward方法进行聚类从化合物库中选择“各种”化合物,Ward方法是分层聚类方法之一。导入库fromrdkitimportrdBase,Chem,DataStructsfromrdkit.ChemimportAllChemfromrdkit.Chem.DrawimportrdMolDraw2D,IPyt
- 几个可以画网络拓扑图的开源库
iteye_773
Swing&SWTSwing
之前做个监控系统,需要在GUI客户端有个网络拓扑结构图,实时显示被监控节点的连接情况,支持动态增减监控节点,能够在拓扑图上自动布局。找到了三个比较合适的库:SWT的ZEST:基于draw2D库封装的,增加了一些事件处理,动画效果和几个常见布局;是个比较粗糙的类库,图节点都被一个矩形框包围,就算是自己定义了透明背景的icon,周围也必须被一个方框包围,要命的是如果你的图节点的名字和icon都在哪个矩
- Activiti工作流web设计器v2.0版正式发布
lisonghua2010
ActivitiJqueryEasyUI工作流设计器
阅读更多基于Draw2dTouch实现的Activiti工作流Web设计器,本设计器完全使用JQuery语法开发,集成Easyui前端框架,支持目前多种主流浏览器。示例:特性多浏览器支持支持Activiti5语法结构采用目前比较流行的JS库-JQuery符合BPMN2.0标准可视化定制代码简洁易维护依赖Draw2DV6.1.66JqueryV1.12.0EasyUIV1.4.5安装部署直接导入Ec
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- Activiti工作流web设计器v2.0版发布预览
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ActivitiEasyUIJQuery工作流设计器
阅读更多很久没有发表文章了!一直忙于公司的事情,现在终于有时间更新一下自己的项目,这次更新由于变化比较大,所以项目名称和版本都做了修改,以前的项目链接如下:http://lisonghua2010.iteye.com/admin/blogs/1490165以前关注过我的项目的小伙伴应该还记得这个项目,这里不做过多的介绍只介绍一下此次更新内容:升级Draw2D脚本库为6.1.66(目前最新版本)升级
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- 基础知识漫谈(2):从设计UI框架开始
蔡羽
说UI能延展出一丢丢的东西来,光java就有swing,swt/jface乃至javafx等等UItoolkit,在桌面上它们甚至都不是主流,在web端又有canvas、svg等等。基于这些UI工具包\框架,又产生了大量通用的或者业务性的UI框架,比如Draw2d、GEF、easyUI乃至国内的EChart、白鹭等等。这些框架的业务范围各异,一个程序员的时间和精力有限,你不可能全部都掌握,又不能预
- [置顶] Eclipse GEF UMLClass(1)
u010392759
eclipseUMLgef
通过两篇文章对GEF进行了介绍,为了自己加深对GEF的理解和学习,从网上找了一下开源的amaterasuml的uml工具,并把其中对内容转换提取成。Figure:第一篇文章其实是对amaterasuml中ClassFigure的简化,真实的UML类图如下:EntityFigure:实体Figure,用于获取Label和获取矩形编辑域,代码如下:importorg.eclipse.draw2d.IF
- 统一思想认识
永夜-极光
思想
1.统一思想认识的基础,才能有的放矢
原因:
总有一种描述事物的方式最贴近本质,最容易让人理解.
如何让教育更轻松,在于找到最适合学生的方式.
难点在于,如何模拟对方的思维基础选择合适的方式. &
- Joda Time使用笔记
bylijinnan
javajoda time
Joda Time的介绍可以参考这篇文章:
http://www.ibm.com/developerworks/cn/java/j-jodatime.html
工作中也常常用到Joda Time,为了避免每次使用都查API,记录一下常用的用法:
/**
* DateTime变化(增减)
*/
@Tes
- FileUtils API
eksliang
FileUtilsFileUtils API
转载请出自出处:http://eksliang.iteye.com/blog/2217374 一、概述
这是一个Java操作文件的常用库,是Apache对java的IO包的封装,这里面有两个非常核心的类FilenameUtils跟FileUtils,其中FilenameUtils是对文件名操作的封装;FileUtils是文件封装,开发中对文件的操作,几乎都可以在这个框架里面找到。 非常的好用。
- 各种新兴技术
不懂事的小屁孩
技术
1:gradle Gradle 是以 Groovy 语言为基础,面向Java应用为主。基于DSL(领域特定语言)语法的自动化构建工具。
现在构建系统常用到maven工具,现在有更容易上手的gradle,
搭建java环境:
http://www.ibm.com/developerworks/cn/opensource/os-cn-gradle/
搭建android环境:
http://m
- tomcat6的https双向认证
酷的飞上天空
tomcat6
1.生成服务器端证书
keytool -genkey -keyalg RSA -dname "cn=localhost,ou=sango,o=none,l=china,st=beijing,c=cn" -alias server -keypass password -keystore server.jks -storepass password -validity 36
- 托管虚拟桌面市场势不可挡
蓝儿唯美
用户还需要冗余的数据中心,dinCloud的高级副总裁兼首席营销官Ali Din指出。该公司转售一个MSP可以让用户登录并管理和提供服务的用于DaaS的云自动化控制台,提供服务或者MSP也可以自己来控制。
在某些情况下,MSP会在dinCloud的云服务上进行服务分层,如监控和补丁管理。
MSP的利润空间将根据其参与的程度而有所不同,Din说。
“我们有一些合作伙伴负责将我们推荐给客户作为个
- spring学习——xml文件的配置
a-john
spring
在Spring的学习中,对于其xml文件的配置是必不可少的。在Spring的多种装配Bean的方式中,采用XML配置也是最常见的。以下是一个简单的XML配置文件:
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<beans xmlns="http://www.springframework.or
- HDU 4342 History repeat itself 模拟
aijuans
模拟
来源:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=4342
题意:首先让求第几个非平方数,然后求从1到该数之间的每个sqrt(i)的下取整的和。
思路:一个简单的模拟题目,但是由于数据范围大,需要用__int64。我们可以首先把平方数筛选出来,假如让求第n个非平方数的话,看n前面有多少个平方数,假设有x个,则第n个非平方数就是n+x。注意两种特殊情况,即
- java中最常用jar包的用途
asia007
java
java中最常用jar包的用途
jar包用途axis.jarSOAP引擎包commons-discovery-0.2.jar用来发现、查找和实现可插入式接口,提供一些一般类实例化、单件的生命周期管理的常用方法.jaxrpc.jarAxis运行所需要的组件包saaj.jar创建到端点的点到点连接的方法、创建并处理SOAP消息和附件的方法,以及接收和处理SOAP错误的方法. w
- ajax获取Struts框架中的json编码异常和Struts中的主控制器异常的解决办法
百合不是茶
jsjson编码返回异常
一:ajax获取自定义Struts框架中的json编码 出现以下 问题:
1,强制flush输出 json编码打印在首页
2, 不强制flush js会解析json 打印出来的是错误的jsp页面 却没有跳转到错误页面
3, ajax中的dataType的json 改为text 会
- JUnit使用的设计模式
bijian1013
java设计模式JUnit
JUnit源代码涉及使用了大量设计模式
1、模板方法模式(Template Method)
定义一个操作中的算法骨架,而将一些步骤延伸到子类中去,使得子类可以不改变一个算法的结构,即可重新定义该算法的某些特定步骤。这里需要复用的是算法的结构,也就是步骤,而步骤的实现可以在子类中完成。
 
- Linux常用命令(摘录)
sunjing
crondchkconfig
chkconfig --list 查看linux所有服务
chkconfig --add servicename 添加linux服务
netstat -apn | grep 8080 查看端口占用
env 查看所有环境变量
echo $JAVA_HOME 查看JAVA_HOME环境变量
安装编译器
yum install -y gcc
- 【Hadoop一】Hadoop伪集群环境搭建
bit1129
hadoop
结合网上多份文档,不断反复的修正hadoop启动和运行过程中出现的问题,终于把Hadoop2.5.2伪分布式安装起来,跑通了wordcount例子。Hadoop的安装复杂性的体现之一是,Hadoop的安装文档非常多,但是能一个文档走下来的少之又少,尤其是Hadoop不同版本的配置差异非常的大。Hadoop2.5.2于前两天发布,但是它的配置跟2.5.0,2.5.1没有分别。 &nb
- Anychart图表系列五之事件监听
白糖_
chart
创建图表事件监听非常简单:首先是通过addEventListener('监听类型',js监听方法)添加事件监听,然后在js监听方法中定义具体监听逻辑。
以钻取操作为例,当用户点击图表某一个point的时候弹出point的name和value,代码如下:
<script>
//创建AnyChart
var chart = new AnyChart();
//添加钻取操作&quo
- Web前端相关段子
braveCS
web前端
Web标准:结构、样式和行为分离
使用语义化标签
0)标签的语义:使用有良好语义的标签,能够很好地实现自我解释,方便搜索引擎理解网页结构,抓取重要内容。去样式后也会根据浏览器的默认样式很好的组织网页内容,具有很好的可读性,从而实现对特殊终端的兼容。
1)div和span是没有语义的:只是分别用作块级元素和行内元素的区域分隔符。当页面内标签无法满足设计需求时,才会适当添加div
- 编程之美-24点游戏
bylijinnan
编程之美
import java.util.ArrayList;
import java.util.Arrays;
import java.util.HashSet;
import java.util.List;
import java.util.Random;
import java.util.Set;
public class PointGame {
/**编程之美
- 主页面子页面传值总结
chengxuyuancsdn
总结
1、showModalDialog
returnValue是javascript中html的window对象的属性,目的是返回窗口值,当用window.showModalDialog函数打开一个IE的模式窗口时,用于返回窗口的值
主界面
var sonValue=window.showModalDialog("son.jsp");
子界面
window.retu
- [网络与经济]互联网+的含义
comsci
互联网+
互联网+后面是一个人的名字 = 网络控制系统
互联网+你的名字 = 网络个人数据库
每日提示:如果人觉得不舒服,千万不要外出到处走动,就呆在床上,玩玩手游,更不能够去开车,现在交通状况不
- oracle 创建视图 with check option
daizj
视图vieworalce
我们来看下面的例子:
create or replace view testview
as
select empno,ename from emp where ename like ‘M%’
with check option;
这里我们创建了一个视图,并使用了with check option来限制了视图。 然后我们来看一下视图包含的结果:
select * from testv
- ToastPlugin插件在cordova3.3下使用
dibov
Cordova
自己开发的Todos应用,想实现“
再按一次返回键退出程序 ”的功能,采用网上的ToastPlugins插件,发现代码或文章基本都是老版本,运行问题比较多。折腾了好久才弄好。下面吧基于cordova3.3下的ToastPlugins相关代码共享。
ToastPlugin.java
package&nbs
- C语言22个系统函数
dcj3sjt126com
cfunction
C语言系统函数一、数学函数下列函数存放在math.h头文件中Double floor(double num) 求出不大于num的最大数。Double fmod(x, y) 求整数x/y的余数。Double frexp(num, exp); double num; int *exp; 将num分为数字部分(尾数)x和 以2位的指数部分n,即num=x*2n,指数n存放在exp指向的变量中,返回x。D
- 开发一个类的流程
dcj3sjt126com
开发
本人近日根据自己的开发经验总结了一个类的开发流程。这个流程适用于单独开发的构件,并不适用于对一个项目中的系统对象开发。开发出的类可以存入私人类库,供以后复用。
以下是开发流程:
1. 明确类的功能,抽象出类的大概结构
2. 初步设想类的接口
3. 类名设计(驼峰式命名)
4. 属性设置(权限设置)
判断某些变量是否有必要作为成员属
- java 并发
shuizhaosi888
java 并发
能够写出高伸缩性的并发是一门艺术
在JAVA SE5中新增了3个包
java.util.concurrent
java.util.concurrent.atomic
java.util.concurrent.locks
在java的内存模型中,类的实例字段、静态字段和构成数组的对象元素都会被多个线程所共享,局部变量与方法参数都是线程私有的,不会被共享。
- Spring Security(11)——匿名认证
234390216
Spring SecurityROLE_ANNOYMOUS匿名
匿名认证
目录
1.1 配置
1.2 AuthenticationTrustResolver
对于匿名访问的用户,Spring Security支持为其建立一个匿名的AnonymousAuthenticat
- NODEJS项目实践0.2[ express,ajax通信...]
逐行分析JS源代码
Ajaxnodejsexpress
一、前言
通过上节学习,我们已经 ubuntu系统搭建了一个可以访问的nodejs系统,并做了nginx转发。本节原要做web端服务 及 mongodb的存取,但写着写着,web端就
- 在Struts2 的Action中怎样获取表单提交上来的多个checkbox的值
lhbthanks
javahtmlstrutscheckbox
第一种方法:获取结果String类型
在 Action 中获得的是一个 String 型数据,每一个被选中的 checkbox 的 value 被拼接在一起,每个值之间以逗号隔开(,)。
所以在 Action 中定义一个跟 checkbox 的 name 同名的属性来接收这些被选中的 checkbox 的 value 即可。
以下是实现的代码:
前台 HTML 代码:
- 003.Kafka基本概念
nweiren
hadoopkafka
Kafka基本概念:Topic、Partition、Message、Producer、Broker、Consumer。 Topic: 消息源(Message)的分类。 Partition: Topic物理上的分组,一
- Linux环境下安装JDK
roadrunners
jdklinux
1、准备工作
创建JDK的安装目录:
mkdir -p /usr/java/
下载JDK,找到适合自己系统的JDK版本进行下载:
http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html
把JDK安装包下载到/usr/java/目录,然后进行解压:
tar -zxvf jre-7
- Linux忘记root密码的解决思路
tomcat_oracle
linux
1:使用同版本的linux启动系统,chroot到忘记密码的根分区passwd改密码 2:grub启动菜单中加入init=/bin/bash进入系统,不过这时挂载的是只读分区。根据系统的分区情况进一步判断. 3: grub启动菜单中加入 single以单用户进入系统. 4:用以上方法mount到根分区把/etc/passwd中的root密码去除 例如: ro
- 跨浏览器 HTML5 postMessage 方法以及 message 事件模拟实现
xueyou
jsonpjquery框架UIhtml5
postMessage 是 HTML5 新方法,它可以实现跨域窗口之间通讯。到目前为止,只有 IE8+, Firefox 3, Opera 9, Chrome 3和 Safari 4 支持,而本篇文章主要讲述 postMessage 方法与 message 事件跨浏览器实现。postMessage 方法 JSONP 技术不一样,前者是前端擅长跨域文档数据即时通讯,后者擅长针对跨域服务端数据通讯,p