1）根目录“/”
2）/bin
/bin
目录又称为二进制目录，包含了那些供系统管理员和普通用户使用的重要
linux命令的二进制映像。该目录存放的内容包括各种可执行文件，还有某些可执行文件的符号连接。常用的命令有：cp、dmesg、kill、login、rm、ping、chomd、bash、cat、echo、ls、 mail、vi等。
3）/boot
/boot
目录存放系统核心文件以及启动时必须读取的文件，包括Linux内核的二进制映像。
4）/dev
/dev
目录保存着外部设备代码的文件，这些文件比较特殊，实际上它们都指向所代表的外围设备，如终端、磁盘驱动器、光驱、打印机等。你可以访问这些外部设备，与访问一个文件或一个目录没有区别。如该目录下的子目录/dev/cdrom表示光驱目录；子目录/dev/console表示控制台；子目录 /dev/fd表示软驱；子目录/dev/hd表示硬盘上的一个分区；lp0表示打印机；ttyS0表示系统的串口设备；dsp表示系统的音箱设备。例如在系统中键入“cd /dev/cdrom”，就可以看到光驱中的文件；键入“cd /dev/mouse”即可看鼠标的相关文件。
/cdrom 该目录在刚安装系统时是空的，你可以将光驱文件系统挂在这个目录下， 例如“mount /dev/cdrom /cdrom”。
5）/etc
/etc
目录是整个Linux系统的中心，其中包含所有系统管理和维护方面的配置文件，如dhcpd.conf、host.conf、logrotate.conf、man.config、mke2fs.conf、modprobe.conf、resolv.conf、sysctl.conf、syslog.conf（或rsyslog.conf）、xinetd.conf和yum.conf等，其他的配置文件分别位于单独的子目录中。通常应注意备份这个目录中的重要配置文件，以便需要是能够快速的恢复系统。用于存放系统的配置文件和特定主机的相关文件。例如，记录用户帐号名称的 password 文件、投影密码的 shadow 文件等。该目录不包含任何二进制文件，并且该目录下的所有文件主要由管理员使用，普通用户只对其具有阅读权限。该目录还包含一些网络配置文件、文件系统、 x系统配置文件、设备配置信息、设置用户信息等。
/etc/cron.d
用于存储cron进程调度运行后台进程所用的配置和控制文件。其他目录包括/etc/crontab文件定义的cron.hourly、cron.daily、cron.weekly和cron.monthly等四个目录。
/etc/cups 用于存储通用UNIX打印系统（Commom UNIX Printing System，CUPS）使用的各种配置文件。
/etc/default 其中的文件用于提供部分工具软件（如useradd程序）使用的变量及其默认值。
/etc/httpd
Apache配置文件的根目录。Apache是一个通用的、高性能的HTTP服务器，也是世界上最流行的Web服务器。Apache采用模块化的设计方式，支持运行时的动态模块选择、虚拟主机，以及服务进程数量的动态调整等。
/etc/init.d 用于存储进入相应运行级时需要由init调度执行的脚本文件。在Fedora
Linux系统中，这只是一个符号链接文件，实际的目录应为/etc/rc.d/init.d。
/etc/ipsec.d 用于存储IPSee使用的配置文件等。
/etc/kde 其中含有部分KDE初始化文件和KDM配置文件。
/etc/pki 用于存储各种密匙，如用于安装软件包的密匙等。
/etc/ppp 用于存储PPP的脚本和配置文件。
/etc/profile.d 用于存储/etc/profile等使用的辅助初始化文件，如lang.sh脚本文件等。
/etc/rc.d 用于存储进入相应运行级是由init进程调度执行的脚本文件。其中含有init.d和rcN.d等子目录（其中的N为0、1、2、3、4、5和6，表示系统的运行级）。
/etc/samba Samba配置文件的根目录。Samba是一个网络共享软件的总称，Linux系统中实现的SMB协议，允许Linux系统为Windows系统提供文件和打印共享服务。
/etc/security 用户存储的基本安全控制文件，包括注册控制文件、控制访问控制文件，以及资源限制控制文件等。
/etc/selinux SElinux(Security Enhanced Linux，由美国国家安全部(National Security Agency)领导开发的GPL项目，它拥有一个灵活而强制性的访问控制结构，旨在提高Linux系统的安全性，提供强健的安全保证，可防御未知攻击，据称相当于B1级的军事安全性能。比MS
NT所谓的C2等高得多。应用SELinux后，可以减轻恶意攻击或恶意软件带来的灾难，并提供对机密性和完整性有很高要求的信息很高的安全保障。)配置文件的根目录。
/etc/skel 其中存有默认的初始化文件，如.bash_logout、.bash_profile、.bashrc、.emacs、.kde和.zshrc等。每当新增一个新用户时，系统将会把其中的部分初始化文件复制到用户的主目录中。注意：上述文件均为隐藏文件。(即以“.“开头的文件名)
/etc/ssh 这个目录含有系统配置过程，以及系统引导过程中需要用到的各种配置文件，也是chkconfig维护的各种后台服务进程配置文件的根目录。例如，其中的clock文件包含系统的时区设置，keyboard文件包含键盘的类型定义，init文件包含系统引导过程使用的参数定义等。
/etc/tomcat5 tomcat的根目录
/etc/vsftpd 包含FTP服务器的配置文件，其中包括vsftpd.conf、ftpusers和user_list等重要文件。
/etc/xinetd.d 其中包含xinetd服务进程控制的所有传统网络服务使用的配置文件，尤其包含telnet等网络应用的配置文件。在Linux系统中，原有的inetd已由功能更强的xinetd服务进程取代，原有的inetd.conf配置文件也由xinetd.d目录中的一系列单独的配置文件取代。
/etc/yum 其中包含yum软件更新工具使用的配置文件。
/etc/yum.repos.d其中包含每个软件仓库的配置文件。
6）/lib
/lib
目录下存放必要的运行库，主要是编程语言的库。典型的 Linux 操作系统中包含了C、C++和 Fortran 的库文件。用这些语言开发的应用程序可以使用这些编程语言库文件。这使
软件开发者能够利用那些预先写好并通过
测试的函数。库文件包含了标准的C库/lib/libc.so.*，数学库libm.so.*，共享的动态链接库/lib/ld/so以及目录/bin和/sbin下用到的其他共享库。/lib/modules目录存放系统的核心模块，某些可被模块化的部分并不需要在编译系统核心时放入核心本体，避免本体过于庞大而导致效率降低。
7）/lost+found
该目录存放所有和其它目录都没有关联的文件。系统出现错误或发生问题时，Fedora会自动扫描磁盘驱动器，修正错误，如果找到遗失或错误的片段，将这些片段转化成文件存放于此，等待管理员的进一步处理。
8）/mnt
该目录是默认的文件系统临时装载点，这是一个通用的安装点，可以临时安装任何文件系统或远程资源。系统管理员执行 mount
命令完成装载
工作。在系统中，该目录包含了光驱、磁盘和软驱的挂载点。
9）/proc
进程文件系统proc的根目录，其中的部分文件分别对应正在运行的进程，可用于访问当前进程的地址空间。它是一个非常特殊的虚拟文件系统，其中并不包含“实际的”文件，而是可用以引用当前运行系统的系统信息，如CPU、内存、运行时间、软件配置以及硬件配置的信息，这些信息是在内存中由系统自己产生的。
/proc/net 其中的文件分别表示各种网络协议（如TCP、UDP以及ARP等）的状态与统计信息。
/proc/sys 这个目录不仅存有各种系统信息，而且也包含系统内核与TCP/IP网络的可调参数。其中的kernel子目录含有共享内存和消息队列的可调参数，net子目录中含有TCP/IP的各种可调参数。例如，shmmax文件中含有系统的最大共享内存定义，如果使用“echo somevalue >
/proc/sys/kernel/shmmax”命令，可以直接修改运行系统的内核参数，而无需重新引导系统。这一做法要谨慎，有的文件可能包含多个数值，或不同类型的数值，因此，在修改以前一定要弄清参数的意义和实际的数值。为了在每次启动系统时都能使用定制的系统可调参数，可以设置sysctl.conf配置文件，或编写自己的Shell启动脚本。
10）/opt
/opt
目录用来安装附加软件包，用户调用软件包程序放在目录/opt/package_name/bin下，package_name是安装软件包的名称。
11）/root
超级用户root的主目录（在Linux系统中，斜杠字符“/”是整个系统的根目录，而非超级用户的主目录。）
12）/sbin
目录/sbin、/usr/sbin和/usr/local/sbin存放了该目录启动系统时需执行的程序，如管理工具、应用软件和通用的根用户权限命令等内容。如包含getty、init、update