瑞士军刀:文本处理工具Sed用法与实例详解

第一部分:sed基础

1)简介
sed 是一种在线编辑器,它一次处理一行内容。处理时,把当前处理的行存储在临时缓冲区中,称为“模式空间”(pattern space),接着用sed命令处理缓冲区中的内容,处理完成后,把缓冲区的内容送往屏幕。接着处理下一行,这样不断重复,直到文件末尾。文件内容并没有 改变,除非你使用重定向存储输出。Sed主要用来自动编辑一个或多个文件;简化对文件的反复操作;编写文本转换程序等。掌握好sed的用法,能够极大的提高我们各类文件处理工作的效率。
2)sed命令参数及选项
 命令  功能
 a\  在当前行后添加一行或多行。多行时除最后一行外,每行末尾需用“\”续行
 c\  用此符号后的新文本替换当前行中的文本。多行时除最后一行外,每行末尾需用”\”续行
 i\  在当前行之前插入文本。多行时除最后一行外,每行末尾需用”\”续行
 d  删除行
 h  把模式空间里的内容复制到暂存缓冲区
 H  把模式空间里的内容追加到暂存缓冲区
 g  把暂存缓冲区里的内容复制到模式空间,覆盖原有的内容
 G  把暂存缓冲区的内容追加到模式空间里,追加在原有内容的后面
 l  列出非打印字符
 p  打印行
 n  读入下一输入行,并从下一条命令而不是第一条命令开始对其的处理
 q  结束或退出sed
 r  从文件中读取输入行
 !  对所选行以外的所有行应用命令
 s  用一个字符串替换另一个
 g  在行内进行全局替换
 w  将所选的行写入文件
 x  交换暂存缓冲区与模式空间的内容
 y  将字符替换为另一字符(不能对正则表达式使用y命令)
选项  功能
 -e  进行多项编辑,即对输入行应用多条sed命令时使用
 -n  取消默认的输出
 -f  指定sed脚本的文件名

3)正则规则

身为一个强大的文本处理工具,支持正则表达式是必须的。sed使用的正则表达式是括在斜杠线”/”之间的模式。
元字符  功能  示例
 ^  行首定位符  /^my/  匹配所有以my开头的行
 $  行尾定位符  /my$/  匹配所有以my结尾的行
 .  匹配除换行符以外的单个字符  /m..y/  匹配包含字母m,后跟两个任意字符,再跟字母y的行
 *  匹配零个或多个前导字符  /my*/  匹配包含字母m,后跟零个或多个y字母的行
 []  匹配指定字符组内的任一字符  /[Mm]y/  匹配包含My或my的行
 [^]  匹配不在指定字符组内的任一字符  /[^Mm]y/  匹配包含y,但y之前的那个字符不是M或m的行
 \(..\)  保存已匹配的字符  1,20s/\(you\)self/\1r/  标记元字符之间的模式,并将其保存为标签1,之后可以使用\1来引用它。最多可以定义9个标签,从左边开始编号,最左边的是第一个。此例中,对第1到第20行进行处理,you被保存为标签1,如果发现youself,则替换为your。
 &  保存查找串以便在替换串中引用  s/my/**&**/  符号&代表查找串。my将被替换为**my**
 \<  词首定位符  /\<my/  匹配包含以my开头的单词的行
 \>  词尾定位符  /my\>/  匹配包含以my结尾的单词的行
 x\{m\}  连续m个x  /9\{5\}/ 匹配包含连续5个9的行
 x\{m,\}  至少m个x  /9\{5,\}/  匹配包含至少连续5个9的行
 x\{m,n\}  至少m个,但不超过n个x  /9\{5,7\}/  匹配包含连续5到7个9的行
4)10个小实例
sed命令的参数选项比较多,我们直接通过一些实例来了解sed的用法。
实例1.p命令
p命令用于输出文件内容,对于匹配模式的行,会被输出两次。
例如:

文件中包含Hello的行被输出了两次。

如果只想要输出匹配模式的行,则可以通过-n参数取消sed的默认行为来实现。

实例2. d命令

d命令用于删除特定行。
删除第1、2行

删除最后一行


删除包含字符串cricode的行


删除以com字符串结尾的行


实例3. S命令

s命令用于文本替换。
将文件中world替换成WORLD

可以发现 Hello,WORLD hello,world 中只有第一个world被替换了。

 通过g参数在全行进行替换,如下:

整行替换,将全文中包含特定单词的行替换成其他字符串。


实例4. e选项

-e即edit的意思,编辑命令,用于sed执行多个编辑任务的情况下。在下一行开始编辑前,所有的编辑动作将应用到模式缓冲区中的行上。

上述为sed命令使用选项-e进行多重编辑后得到的结果。第一重编辑删除第1、2行。第二重编辑将第1、2行外的所有包含cricode替换为大写CRICODE。因为是逐行进行这两项编辑(即这两个命令都在模式空间的当前行上执行),所以编辑命令的顺序会影响结果。

实例5.r命令
r命令是读命令。sed使用该命令将一个文本文件中的内容加到当前文件的特定位置上。这个命令在需要往文件中有规律的插入信息时特别有用。
在包含cricode单词的行后面加入一行注释。(注释内容写在sed1.txt中)

实例6. w命令


上述命令将sed.txt文件中包含模式cricode的行内容写入到tmp.txt

实例7.a\命令

a\命令将添加新文本到文件中当前行(即读入模式缓冲区中的行)的后面。所追加的文本行位于sed命令的下方另起一行。如果要追加的内容超过一行,则每一行都必须以反斜线结束,最后一行除外。最后一行将以引号和文件名结束。

在包含hello的行后插入一行内容:kidding??

其实第5点的r命令也能实现相同的功能。

实例8.i\命令

i\命令与a\命令相反,它是在匹配行的前面插入一行。

 在包含hello的行前插入一行内容:kidding??

实例9. c\命令

c\命令将匹配行修改成我们设定的内容。

将包含hello的行替换成kidding??

其实这个替换功能可以通过第3点中方法实现:通过正则匹配来实现全行替换。

实例10. y命令

y命令与UNIX/Linux中的tr命令类似,字符按照一对一的方式从左到右进行转换。例如,y/abc/ABC/将把所有小写的a转换成A,小写的b转换成B,小写的c转换成C。

将文本中小写字母hi分别替换为大写字母HI:

 第二部分:Sed脚本

通过编写脚本我们可以方便的批量执行命令。sed脚本就是写在文件中的一系列sed命令。sed脚本中,要求命令的末尾不能有任何多余的空格或文本。如果在一行中有多个命令,要用分号分隔。执行脚本 时,sed先将输入文件中第一行复制到模式缓冲区,然后对其执行脚本中所有的命令。每一行处理完毕后,sed再复制文件中下一行到模式缓冲区,对其执行脚 本中所有命令。使用sed脚本时,不再用引号来确保sed命令不被shell解释。

下面举个栗子。

我们现在来完成如下任务:

1)在sed.txt中的开头插入一行作者信息:#Author:Jay13  2013-08-25

2)将文章中所有cricode替换成CRICODE。

3)在文本末尾加入一行:good bye!

那么我们可以编写一个名为sedscript脚本,脚本具体内容如下:

然后再将sed脚本应用到sed.txt 文件上

第三部分:练习

学习了sed的基本知识,现在我们来实战一下。

1、Sed中如何替换多行中的有规律的数字字符串 

输入:

hello world balabala – . gene_id “240838 “; transcript_id “240838“;

hello world balabala again – . gene_id “240838 “; transcript_id “240838“;

balaba….

输出:

hello world balabala - . gene_id “zgg240838 “; transcript_id “zgg240838“;

hello world balabala again - . gene_id “zgg240838 “; transcript_id “zgg240838“;

balaba…

也即,将字符串gene_id“后接数字以及transcript_id “后接数字中的引号与数字之间插入zgg字符串。

解答:

脚本编写如下:

sed  ‘s/gene_id “\([0-9]\+\)”; transcript_id “\([0-9]\+\)”;/gene_id “zgg\1″; transcript_id “zgg\2″;/g’ test.txt

注:

1. 数字的匹配[0-9]

2.[0-9]后接\+表示匹配一个或多个数字

3.匹配部分加括号,引用匹配部分用\1,\2,….等等。

4.sed执行多个匹配用分号连接,整个命令用’’引在内部。

2、在文本中每一行添加行头行尾,在行投添加 Head单词,在行尾添加Tail单词。

解答:略

3、利用sed进行格式转换

比如需要将text.txt中如下内容

转换成xml格式如下:

则可以定义下面的sedscript文件:

第一行和第二行实现的功能就是在每个dn:开头的行前面加上一行<entity>。最后一行是碰到空行补上</entity>这 个结束标记。

另外,在执行替换的时候可以通过使用把被替换的字符串分组,在替换的部分里面用\1、\2这种方式引用被替换文字里面的相应的组。

用这种方法把ldif文件里面[:]前的东西删掉并且在两边增加相应的xml标记。
仔细想想,4行替换也许用下面的1行就能实现?
s/^\(.*\):[[:space:]]\(.*\)$/<\1>\2<\/\1>/g

=============================GAME OVER================================

参考:http://www.cnblogs.com/edwardlost/archive/2010/09/17/1829145.html

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