Linux平台下搭建Fortran并行编译环境(SLES10 )

SLES10 Linux（kernel-2.6.16.21-0.8）平台下搭建Fortran并行编译环境
一．Fortran编译器的安装
Linux安装盘一般都自带有Fortran编译器，在SuSe9.1以前均带有g77，在Suse9.2以后为gfortran。但是，相对来说，由于g77和gfortran的编译的程序运行效率不是很高，所以都会选择再安装专业的Fortran编译器。
主流的Fortran 90/95编译器有PGI Fortran、HP Fortran Compiler（由Fortran PowerStation进化过来的）和Intel Fortran Compiler等。因为Intel Fortran Compiler9.1是Intel提供的免费的Non-Commercial版本，且在Intel平台上，具有较高的编译效率。它的发行版有Windows和Linux两种。在此，主要介绍在SLES10.0 上安装 Intel Fortran Compiler 9.1 的过程。
1．下载安装包
本次安装包从ftp上下载，ifcliv91.bin，为光盘文件，可以直接拷贝到目录/home/hou/software/intel_fc_91下。
2．解压安装文件，命令如下：
编译器是安装在/opt/intel目录下，协议则在该目录下的licenses文件夹中。最后还要指定licenses的位置。具体命令如下：
#mkdir -p /opt/intel/licenses
#cp /home/hou/isoftware/intel_fc_91/Crack/i*.lic /opt/intel/licenses
# export INTEL_LICENSE_FILE=opt/intel/licenses
3．安装程序，命令如下：
#cd /home/hou/isoftware/intel_fc_91
#./install.sh
按照安装提示，逐步安装即可。一般情况下，可以顺利安装完毕，在此安装包中一共包含有以下编译器，可以全部安装，也可以选择安装其中之一。
Intel® Fortran Compiler for IA-32 Based Applications
? Intel® Fortran Compiler for Linux for IA-32 applications, version 9.1
? Intel® Debugger for IA-32 applications, version 9.1  
Intel® Fortran Compiler for Intel EM64T-Based Applications
? Intel® Fortran Compiler for Linux for Intel EM64T-Based applications, version 9.1
? Intel® Debugger for Intel EM64T-based applications, version 9.1  
Intel® Fortran Compiler for Itanium-Based Applications
? Intel® Fortran compiler for Itanium-based applications, version 9.1
? Intel® Debugger for Itanium-based applications, version 9.1
? Intel® Itanium Assembler to produce Itanium-based applications, version 9.0  
安装Intel Fortran Compiler for Intel EM64T-Base，默认目录就是/opt/intel/fce/9.1.032/。安装编译器完成之后，继续可以安装Linux Application Debugger for Intel EM64T-base applications，它默认安装在/opt/intel/idbe/9.1.023/下。最后选择“x”退出安装程序。
4．安装完成，将编译器路径加入到环境变量中。命令如下：
server:~ # vi .bash_profile
export PATH=$PATH:/opt/intel/fce/9.1.032/bin
export MANPATH=$MANPATH:/opt/intel/fce/9.1.032/man
server:~ # source .bash_profile
   在运行编译以后运行中，会出现找不到链接库文件的问题，这是由于没有将Intel编译器的库文件添加到链接库搜索中，编辑/etc/ ld.so.conf,添加intel库文件的路径。具体如下：
server:~ # vi /etc/ld.so.conf
/usr/X11R6/lib64
/usr/X11R6/lib/Xaw3d
/usr/X11R6/lib
/usr/x86_64-suse-linux/lib
/usr/local/lib
/opt/kde3/lib
/opt/gnome/lib
/lib64
/lib
/usr/lib64
/usr/lib
/usr/local/lib64
/opt/kde3/lib64
/opt/gnome/lib64
/opt/intel/fce/9.1.032/lib
include /etc/ld.so.conf.d/*.conf
然后运行命令生效。
server:/etc # ldconfig -v
安装完毕，可以编写小程序进行测试。
2． PICH的安装
1.下载并安装 mpich包(用hou用户)
下载mpi的linux安装包：mpich-1.2.7p1.tar。放到/home/hou/software 目录下。解压文件： tar xvf mpich-1.2.7p1.tar.然后在/home/hou目录下创建安装目录。
server /etc> cd /home/hou
server /home/hou> mkdir mpich
回到解压缩得到的目录，设定环境变量，指定用ifort编译器进行安装。命令：
server /home/hou> cd /home/hou/software/mpich-1.2.7p1/
server software/mpich-1.2.7p1> setenv FC ifort
server software/mpich-1.2.7p1> setenv F90 ifort
server software/mpich-1.2.7p1> ./configure -with-flibname=mpich-ifort -prefix=/home/hou/mpich
其中/home/hou/mpich为所指定安装的目录。然后make对MPI进行编译。
server software/mpich-1.2.7p1>make
测试安装是否正确，到example/basic目录下进行测试。
server software/mpich-1.2.7p1>cd example/basic
server software/mpich-1.2.7p1>make cpi
server software/mpich-1.2.7p1>../../bin/mpirun -np 4 cpi
至此，MPI还没有开始正式的安装，只是预安装。若运行成功，即可进行最后的安装。最后，将mpich安装到指定的目录
server software/mpich-1.2.7p1>make install
2．安装后文件配置
在所有的机器的/etc/hosts.equiv文件内添加启动MPI程序的机器名。如：
#
# hosts.equiv   This file describes the names of the hosts which are
#               to be considered "equivalent", i.e. which are to be
#               trusted enough for allowing rsh(1) commands.
#
# hostname
server
bingxing70
bingxing71
bingxing72
bingxing73
bingxing74
bingxing75
… …
或者在帐户目录下创建 .rhosts文件：
在hou目录下创建脚本文件 .cshrc添加环境变量，并生效。
server /home/hou> vi .cshrc
setenv MANPATH ${MANPATH}:/opt/intel/fce/9.1.032/man
setenv PATH ${PATH}:/home/hou/mpich/bin
setenv MANPATH ${MANPATH}:/home/hou/mpich/mansource .cshrc
server /home/hou> source .cshrc
最后还要到无盘机器上创建脚本文件 .cshrc
至此，SLES建立了MPI消息传递形式的，Intel Fortran编译器下的并行Fortran编译和运行环境。
关于编译优化参数的，参见附录文章：英特尔多核平台编程优化大赛报告