MySQL 数据库连接失败 SQLSTATE[HY000] [2003] Can't connect to MySQL server on '127.0.0.1' (13)

CentOS6.5x64 安装禅道6.2，生成配置文件，数据库连接失败

数据库连接失败 SQLSTATE[HY000] [2003] Can't connect to MySQL server on '127.0.0.1' (13)

root，密码肯定没有错（命令行可以登录），用的127.0.0.1

PHP安装正常，MySQL配置正确，PHP的PDO、MySQL扩展正确，使用

<?php
$link=mysql_connect('localhost','root','password');
if ($link)
echo "successfu";
else
echo "Faile";
mysql_close();
?>

php代码能够正确连接数据库，但是安装禅道过程中始终连不上MySQL数据库 Can't connect to MySQL server on '127.0.0.1' (13)，各种原因分析无果，最后仔细阅读my.cnf文件，发现mysqld中有配user=mysql的信息，如下：

[mysqld]
datadir=/var/lib/mysql
socket=/var/lib/mysql/mysql.sock
user=mysql
# Disabling symbolic-links is recommended to prevent assorted security risks
symbolic-links=0

[mysqld_safe]
log-error=/var/log/mysqld.log
pid-file=/var/run/mysqld/mysqld.pid

将user=mysql该为user=root 后重启mysqld服务后安装一切正常，官方参数解释：

mysqld程序在启动后将在给定UNIX/Linux账户下执行; mysqld必须从root账户启动才能在启动后切换到另一个账户下执行; mysqld_safe脚本将默认使用–user=mysql选项来启动mysqld程序。

具体参数请参考：MySQL配置参数详解