【R语言】

R语言学习之整理ETCM查询到的target symbol

#方法1#准备工作（后面需要用这个包的trim函数）install.packages("raster")library(raster)#读入数据（必须要加上encoding，以免乱码）data1<-read.table("modify.txt",sep=",",encoding="UTF-8")#转置数据data1<-t(data1)#删除括号内所有内容data1<-gsub("\\(.*?\\)
佐博伊森·2023-11-23 14:50

在Linux环境下配置和安装R语言

在Linux环境下配置和安装R语言R语言是一种用于统计计算和数据分析的开源编程语言和环境。在Linux操作系统中，配置和安装R语言可以通过以下步骤完成。
架构魔术·2023-11-23 11:54

R语言 数据Excel的导入与导出

R语言数据Excel的导入与导出在R语言中，我们经常需要将数据从Excel文件导入到R环境中进行分析，或将分析结果导出到Excel文件中进行保存。
一起去旅行Coding·2023-11-23 09:15

45-R语言机器学习：神经网络与深度学习

《精通机器学习：基于R第二版》学习笔记1、神经网络介绍“神经网络”的概念相当宽泛，它包括了很多相关的方法。我们主要关注使用反向传播方法进行训练的前馈神经网络。神经网络模型的优点在于，可以对输入变量（特征）和响应变量之间的高度复杂关系进行建模，特别是关系呈现高度非线性时。神经网络模型的构建和评价不需要基本假设，对于定量和定性响应变量都适用。神经网络的结果是一个黑盒。换言之，没有一个带有系数的等式可供
wonphen·2023-11-23 08:26

R语言常用的数据分析包

R语言是一种功能强大的统计分析和数据可视化工具，它拥有丰富的数据分析包，为数据科学家和分析师提供了丰富的功能和灵活性。下面介绍一些常用的R语言数据分析包及其功能。
领域征途探险·2023-11-23 07:21

R语言：安装和使用ggplot2数据可视化库

R语言：安装和使用ggplot2数据可视化库ggplot2是R语言中一款强大的数据可视化库，它提供了丰富的绘图功能和灵活的图形定制选项。本文将详细介绍如何安装和使用ggplot2库。
领域征途探险·2023-11-23 07:51

R语言中的先验概率分布与后验概率分布的计算

R语言提供了丰富的函数和包，可以方便地进行先验和后验概率分布的计算。本文将介绍如何使用R语言来计算先验概率分布和后验概率分布，并提供相应的源代码示例。
领域征途探险·2023-11-23 07:51

基于模型的聚类和R语言中的混合高斯模型

在本文中，我们将介绍基于模型的聚类方法，并使用R语言中的混合高斯模型进行实现。首先，我们将介绍基于模型的聚类方法。
领域征途探险·2023-11-23 07:51

R语言解方程实战：使用solve函数求解方程

R语言解方程实战：使用solve函数求解方程在R语言中，可以使用solve()函数来求解线性方程组。这个函数可以用来求解未知数的值，使得方程组成立。
领域征途探险·2023-11-23 07:21

R语言绘制卡方分布图

R语言绘制卡方分布图在数据分析和统计学中，卡方分布是一种重要的概率分布，常用于检验两个分类变量之间的关联性。在R语言中，我们可以使用各种函数和包来绘制卡方分布图。首先，我们需要安装并加载必要的包。
领域征途探险·2023-11-23 07:21

R语言编程-Tidyverse 书籍 - 第三章 - ggplot2 包

R最强项就是可视化，而ggplot2是其中最为著名的包3.1ggplot2基本语法ggplot2基于图层化语法：图形是一层一层的图层叠加而成。选取整洁数据将其映射为几何对象(如点、线等)，几何对象具有美学特征(如坐标轴、颜色等)，若需要则对数据做统计变换，调整标度，将结果投影到坐标系，再根据喜好选择主题。绘图流程image.png包括10个部件,前3个是必须得，其他ggplot2会自动帮你设置。数
Hello育种·2023-11-23 07:57

在Rstudio中选择conda虚拟环境 以及查看R版本

另外界面选择R语言版本如下图
煦煦向前·2023-11-23 04:58

R语言报错：could not find function “last“

跑DLCAnalyzer代码的时候，出现了报错：couldnotfindfunction“last”解决方法：需要安装包dplyr并且把它导入install.packages("dplyr")library("dplyr")再次允许就ok了
煦煦向前·2023-11-23 04:28

R语言学堂原创推文汇总-v4

更新时间:2022.5.21本篇是学堂原创推文的汇编和索引，涵盖了所有知识性的原创推文，并且会进行不定期的更新。索引按「专辑-系列」的顺序进行排列，越靠前的系列基础性越强；系列内部按逻辑顺序排列，部分推文会同时出现在不同的系列里。1数据处理通识专辑1.1「base-r数据处理（入门）」R及其相关程序安装base|数值运算符和逻辑运算符base|使用apply族函数进行向量化运算1.2「tidy-r
R语言学堂·2023-11-23 04:21

跟着Nature学作图：R语言ggridges包绘制山脊图

论文是EnvironmentalfactorsshapingthegutmicrobiomeinaDutchpopulation数据和代码的github主页链接https://github.com/GRONINGEN-MICROBIOME-CENTRE/DMP这个也是数据代码的下载链接，可以看目录结构https://zenodo.org/record/5910709#.YmAcp4VBzic今天的
小明的数据分析笔记本·2023-11-22 17:50

【webgl】初识

【webgl】初识WebGL应用程序的结构渲染名词着色器顶点着色器片段着色器(像素着色器)OpenGLESSL变量Shader语言顶点着色器原始汇编光栅化片段着色器WebGL应用程序的结构WebGL应用程序代码是
折桂怀橘·2023-11-22 14:32

第一章 R语言介绍

1.为何使用R与起源于贝尔实验室的S语言类似，R也是一种为统计计算和绘图而生的语言和环境，它是一套开源的数据分析解决方案，由一个庞大且活跃的全球性研究型社区维护。但是，市面上也有许多其他流行的统计和制图软件，如MicrosoftExcel、SAS、IBMSPSS、Stata以及Minitab。为何偏偏要选择R？R有着非常多值得推荐的特性。多数商业统计软件价格不菲，投入成千上万美元都是可能的。而R
拒绝三分钟热度·2023-11-22 11:59

复杂数据统计与R语言程序设计实验一

1.下载并安装R语言软件，熟悉基本操作的命令及操作界面，掌握软件的使用方法（提供学号加姓名的截图）。2.下载并安装Rstudio，（提供运行代码及运行结果的截图）。
星星失眠️·2023-11-22 11:45

分析多变量间因果关系的利器---结构方程模型（Structural Equation Modeling）

我们前期推出的《基于R语言结构方程模型》通过结构方程原理介绍、结构方程全局和局域估计、模型构建和调整、潜变量分析、复合变量分析及结构方程贝叶斯方法实现等一系列专题的介绍及大量案例讲解，由浅入深地系统介绍了结构方程模型的建立
梦想的初衷~·2023-11-22 07:25

R语言贝叶斯方法在生态环境领域中应用

贝叶斯统计已经被广泛应用到物理学、生态学、心理学、计算机、哲学等各个学术领域，其火爆程度已经跨越了学术圈，如促使其自成统计江湖一派的贝叶斯定理在热播美剧《TheBigBangTheory》中都要秀一把。贝叶斯统计学即贝叶斯学派是一门基本思想与传统基于频率思想的统计学即频率学派完全不同的统计学方法，它在统计建模中具有灵活性和先进性特点，使其可以轻松应对复杂数据和模型结构。然而，很多初学者在面对思想、
梦想的初衷~·2023-11-22 07:24

COMP9321代做、代写dataframe、Python程序设计调试、代写Python语言代写R语言程序|代做数据库SQL

Resources/Assignments(/COMP9321/20T1/resources/41975)/Week3(/COMP9321/20T1/resources/41976)/Assignment-1Assignment-1TheassignmentdatahasbeenextractedfromaMoviedatasetonKaggle(https://www.kaggle.com/ro
tes6903·2023-11-22 06:37

微信红包分配机制的模拟与实现（使用R语言）

微信红包分配机制的模拟与实现（使用R语言）在这篇文章中，我们将使用R语言来模拟和实现微信红包的分配机制。微信红包是一种在社交媒体平台上广泛使用的红包形式，用户可以在特定的场景下发送红包给其他用户。
ByteWhiz·2023-11-22 05:49

R语言读文件“-“变成“.“

R语言读取文件时发生"-"变成"."
hx2024·2023-11-21 23:52

R语言r3dmol包，m_bio3d()#从包Bio3d加载结构

R语言r3dmol包，m_bio3d()#从包Bio3d加载结构#ThuFeb1800:13:422021-#字符编码：UTF-8#R版本：Rx644.0.3forwindow10#cgh163email
youmigo·2023-11-21 18:47

跟着Nature Communication学作图：R语言ggplot2话点线图展示基因表达量的范围

论文MicrobiomesintheChallengerDeepslopeandbottom-axissedimentshttps://www.nature.com/articles/s41467-022-29144-4#code-availability对应代码链接https://github.com/ucassee/Challenger-Deep-Microbes论文里提供了大部分图的数据和代
小明的数据分析笔记本·2023-11-21 18:39

R语言——taxize（第二部分）

taxize（第二部分）3.taxize文档中译3.10.classification（根据类群ID检索分类阶元层级）示例1：传递单个ID值示例2：传递多个ID值示例3：传递单个名称示例4：传递多个名称示例5：传递字符型ID示例6：传递带数据源的ID示例7：传递多个数据库示例8：横向/纵向组合示例9：传递多个类群至多个数据库示例10：查找维基物种3.11.comm2sci（根据俗名检索科学名）3.
ALittleHigh·2023-11-21 14:36

R语言——taxize（第三部分）

taxize（第三部分）3.39.get_wiki（获取维基分类群的页面名称）3.40.get_wormsid（获取分类群名称的WormsID）3.41.gni_details（使用GlobalNamesIndex搜索分类学名称详情）3.42.gni_parse（使用EOL的名称解析器解析科学名称）3.43.gni_search（使用GlobalNamesIndex搜索分类学名称）3.44.gnr
ALittleHigh·2023-11-21 14:05

R语言——taxize（第三部分）

taxize（第三部分）3.taxize文档中译3.24.genbank2uid（从GenBankID获取NCBI分类UID）3.25.getkey（获取API密钥的函数）3.26.get_boldid（获取搜索词的BOLD（生命条形码）代码）3.27.get_eolid（根据分类名称从《生命百科全书》中获取EOLID）3.28.get_gbifid（从分类名称中获取GBIF主干分类群ID）3.2
ALittleHigh·2023-11-21 14:59

R语言中查找系统文件或安装包的文件路径

R语言中查找系统文件或安装包的文件路径在R语言中，我们经常需要查找系统文件或者安装包的文件路径，这对于处理数据、读取文件以及加载包非常有帮助。在本文中，我将介绍几种方法来实现这一目标。
前端设计家·2023-11-21 13:20

使用R语言删除数据框（dataframe）中的列

使用R语言删除数据框（dataframe）中的列在R语言中，我们可以使用多种方法来删除数据框（dataframe）中的列。下面将介绍三种常用的方法：使用索引、使用列名和使用dplyr包。
前端设计家·2023-11-21 13:20

R语言中的数据标准化方法

R语言中的数据标准化方法在数据分析和机器学习领域，数据的标准化是一项重要的预处理步骤。它可以将不同范围和单位的数据转化为具有相似尺度的数据，使得它们更容易进行比较和计算。
前端设计家·2023-11-21 13:50

R语言实现排列组合（1）

实际研究中我们常常需要实现不同方法的组合，不同结果的组合，来比较差异，得出最好的结果，这里面就涉及到排列组合的思想。下面我们从最简单的排列组合开始：已知A、B两个向量，组合A、B，A先B后generate_combinations<-function(vector1,vector2){combinations<-expand.grid(vector1,vector2)return(combinat
weixin_49320263·2023-11-21 13:42

文献笔记八十四：Rsubread R语言里转录组表达定量工具

论文链接https://academic.oup.com/nar/article/47/8/e47/5345150本地文件gkz114.pdf
小明的数据分析笔记本·2023-11-21 13:42

R语言cox森林图绘制

杀杀cox森林图绘制cox的结果多为数据，绘制成表格较为不便，因此可以用森林图进行美化展示R语言中森林图的实现代码较为简单：library(forestplot)library(survival)library
不会生信哟·2023-11-21 13:16

LLVM5.0环境搭建以及对C程序编译运行

LLVM有两个特点：（1）LLVM有一个特定指令格式的IR语言，我们可以通过书写Pass来对其IR进行优化。（2）可以作为多种语言的后端，提供与编程语言无关的优化和针对多种CPU的代码生成功能。
静水流深ylyang·2023-11-21 12:01

R语言的排列组合函数：排列函数（permutations）和组合函数（combinations）

R语言的排列组合函数：排列函数（permutations）和组合函数（combinations）排列函数（permutations）和组合函数（combinations）是R语言中用于处理排列和组合问题的常用函数
幻想世界中的绚丽色彩·2023-11-21 10:14

R语言绘图——数据可视化ggplot2 介绍和主要的参数

R有几种用于制作图形的系统，但ggplot2是最优雅和最通用的系统之一。与大多数其他图形包不同，ggplot2具有基于图形语法的底层语法，它允许您通过组合独立组件来组合图形。如果想要更加了解ggplot2，请阅读ggplot2:ElegantGraphicsforDataAnalysis，可以从https://ggplot2-book.org/getting-started.html学习本书介绍所
我是一只科研狗·2023-11-21 08:37

R语言 如何合并2个单boxplot为1个多组boxplot(boxplot-multiple-group）

1.jpeg某一天，我生成了2个箱图boxplot，突然间老师要求合并成1个箱图，唉～～～于是我各种查资料，学着做这种分组plot，结果如上图所示，主要想用多组boxplot展示同组数据不同分类之间的区别，以及不同组之间的区别。以上是闲聊以下是代码定义个性化boxplot函数这个函数模块是生成多组boxplot的核心模块，功能是生成没有坐标轴的箱图，有它才能顺利生成想要的箱图。#定义boxplot
明天吃什么饭·2023-11-21 08:12

（四）控制流、函数与apply家族

控制流R语言的循环和控制流包括：if、else、next、while、for等语句。
井底蛙蛙呱呱呱·2023-11-21 04:16

使用R语言的clusterProfiler对葡萄做GO富集分析

葡萄的参考基因组下载自NCBI，下载链接是https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/003/745/GCF_000003745.3_12X/基本流程是Hiast2比对samtoolssam转bamstringtie组装转录本gffcompare将stringtie输出的gtf文件与参考基因组的注释文件做比较得到一-个merged.combin
小明的数据分析笔记本·2023-11-21 04:20

r语言与多维统计_Kaukatcr：多维空间语言设计的实验

r语言与多维统计与ProjectXanadu™[1]相关的各种项目之一是ZigZag™，ZigZag™是一种组织器系统或思维导图工具，围绕着称为ZZStructures的扭曲多维空间构建。
dfsgwe1231·2023-11-21 00:18

复杂数据统计与R语言程序设计实验二

1、创建一个对象，并进行数据类型的转换、判别等操作，步骤如下。①使用命令清空工作空间，创建一个对象x，内含元素为序列：1，3，5，6，8。②判断对象x是否为数值型数据。③将对象转换为逻辑型数据，记为x1。④判断x1是否为逻辑型数据。2、创建多种数据结构，并进行数据结构的各种操作，步骤如下。①使用命令清空工作空间，设置工作空间。②创建一个向量x，内含元素为序列：11，23，25，46，38，30，5
星星失眠️·2023-11-21 00:47

LINUX学习-预习

早上学习了一上午GEO数据的R语言处理，能听懂50%，感觉还要跑一个芯片看看结果。
米粥的味道·2023-11-20 21:08

R语言绘制配对样品箱线图

配对箱线图，常见于配对样本的数据分析中。例如下图示例，为了研究某些基因在肿瘤组织和正常组织中是否具有表达量的显著不同，在取样时，往往会在同一患者个体中同时获取肿瘤和临近正常组织，两个组织样本就是配对关系。当然在这类研究中，往往需要调查很多的患者，因此会获得大量的配对样本。随后，通过qPCR或RNA-seq等方法定量基因表达后，以箱线图呈现特定基因在肿瘤组织和正常组织中的整体表达水平，并在箱线图中以
纪伟讲测序·2023-11-20 20:40

如何利用R语言进行meta分析—详细教程（2）

如何利用R语言进行meta分析—详细教程（2）---（如何在meta分析中进行离群值检测与meta回归）小伙伴们大家好，在我上一篇的推文里详细讲解了如何利用R语言的meta包并以OR值和95%CI作为效应尺度进行合并作
吃一口小肉丸·2023-11-20 18:27

gRPC入门------protocol buffers指南（一）

注:内容来自官网资料LanguageGuide(proto3).这份指南描述如何使用protocolbuffer语言来构建你的protocolbuffer数据,包括.proto文件语法和如何从.proto
Sirius_lwq·2023-11-20 18:46

R语言实现多变量孟德尔随机化分析（1）

多变量孟德尔随机化分析调整了潜在混杂因素的影响。1、调整哪些因素？参考以往文献。可以分别调整，也可以一起调整。2、解决了什么问题？某个暴露相关的SNP，往往与某个或者某几个混杂因素相关。可以控制混杂偏倚。3、如何解释结果？若该暴露的P值小于0.05，则可以说明该暴露独立于其他暴露对结局产生影响。否则是通过其他因素对结局产生影响。#多变量孟德尔随机化（MVMR）library(TwoSampleMR
weixin_49320263·2023-11-20 08:08

R语言的入门学习

目录准备工作导入csv数据集选择前200行作为数据集展示数据集的前/后几N行宏观分析删除缺失值构建直方图导出为图片R语言常见图像类型例1：散点图例2：散点矩阵图准备工作安装教程：R语言和RStudio的下载安装
一只天蝎·2023-11-20 08:37

基于R语言平台Biomod2模型的物种分布建模与可视化分析

!](https://img-blog.csdnimg.cn/84e1cc8c7f9b4b6ab60903ffa17d82f0.jpeg#pic_center)
生信小窝·2023-11-20 08:07

R语言：利用biomod2进行生态位建模

  在这里主要是分享一个不错的代码，喜欢的可以慢慢研究。我看了一遍，觉得里面有很多有意思的东西，供大家学习和参考。  利用PCA轴总结的70个环境变量，利用biomod2进行生态位建模：#----------------------------------------------------------##NICHEMODELLINGWITHBIOMOD2USING########70ENVIRO
Amyniez·2023-11-20 08:32
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