稀疏矩阵

seurat自学笔记1.0 单细胞数据导入

importanndataimportpandasaspdadata=anndata.read("/home/R/R_data/Seurat/PBMC10/output/adata.h5ad")#adata.X.todense()#将稀疏矩阵转成普通矩阵

Sanye2022·2024-09-14 01:36

稀疏矩阵的常用存储格式（COO、CSR、CSC）

图结构数据图是用于描述对象间关系的基本结构，顶点表示对象，边表示连接关系。根据连接关系的紧密可以将图分为稀疏图和稠密图，两者是相对的概念，并不存在明确的划分界限。稀疏图可以理解为仅有少部分对象间存在关联，稠密图反之。实际应用中的图往往都是稀疏图。采用直观的办法来存储图往往会造成极大的空间浪费，如邻接矩阵（稀疏图对应的邻接矩阵中绝大部分的元素为零，无实际意义）。因此需要考虑寻求其它格式来进行高效存储

每天学一点吧·2024-09-02 05:37

【机器学习】特征提取特征降维

这样的操作把字典样本的每一条数据转化为了矩阵，但是矩阵中含有大量的0（因为数据中的键和值有很多不同），所以称之为稀疏矩阵为了保存数据的高效，一般使用三元组表存储。保存非零数据

de-feedback·2024-08-27 18:20

压缩感知进阶有关稀疏矩阵

分享一下我老师大神的人工智能教程！零基础，通俗易懂！http://blog.csdn.net/jiangjunshow也欢迎大家转载本篇文章。分享知识，造福人民，实现我们中华民族伟大复兴！上一篇《初识压缩感知CompressiveSensing》中我们已经讲过了压缩感知的作用和基本想法，涉及的领域，本文通过学习陶哲轩对compressivesensing（CS）的课程，对压缩感知做进一步理解，针对

还可以吧有点纯纯的·2024-02-20 06:59

RedisGraph概述

RedisGraph创新地将图数据表示为稀疏矩阵并利用GraphBLAS将图形操作转换为对矩阵的操作，同时还保留了完全基于内存的特点，这些特别之处为RedisGraph带来了独特的性能优势。

简vae·2024-02-19 14:32

精确覆盖问题学习笔记（四）——算法优化

2、在实际情况中，矩阵M一般是稀疏矩阵，0的个数远远多于1的个数，如果我们能只处理含1的单元格的话，将大大提高运行的时空效率。二、优化所用到的数据结构以下优化算法是Knuth提出来的，其主要

laomai·2024-02-14 20:51

机器学习（1）——Python数据处理与绘图

1.8数组连接与拆分1.8.1数组连接1.8.2数组拆分2scipy包的使用2.1scipy包中的模块2.2常数模块的使用2.3特殊函数模块的使用2.4信号处理模块2.5空间结构模块2.6优化器2.6稀疏矩阵

WHJ226·2024-02-09 09:30

海量数据相似数据查找方法（ANN）：【高维稀疏向量的相似查找——MinHash, LSH, SimHash】【稠密向量的相似查找——Faiss、Annoy、ScaNN、Hnswlib】

同样海量文本场景，文本集合可以看成doc-word稀疏矩阵，如何求解每个

u013250861·2024-02-08 10:08

python 中和机器学习相关的库：numpy scipy pandas scikit-learn tensorflow-gpu matplotlib

scipy:微积分、矩阵分解、函数优化器（最小化器）、根查找算法、信号处理工具、稀疏矩阵和稀疏线性系统求解器。

Hi-Lu·2024-02-05 04:41

Python数据分析及可视化实例之“NumPy“

NumPy系统是Python的一种开源的数值计算扩展一个强大的N维数组对象Array比较成熟的（广播）函数库用于整合C/C++和Fortran代码的工具包实用的线性代数、傅里叶变换和随机数生成函数numpy和稀疏矩阵运算包

IT小生2020·2024-02-05 02:40

matlab矩阵的第一列,matlab提取矩阵第一列

第2章MATLAB矩阵及其运算2.1变量和数据操作2.2MATLAB矩阵2.3MATLAB运算2.4矩阵分析2.5矩阵的超越函数2.6字符串2.7结构数据和单元数据2.8稀疏矩阵2.1变量和数据操作2.1.1

C丶陈先森·2024-02-02 23:13

Python第三方扩展库SciPy

例如线性代数、常微分方程数值求解、信号处理、图像处理、稀疏矩阵等等。S

软件技术爱好者·2024-02-01 19:36

OCP NVME SSD规范解读-8.SMART日志要求-2

LDPC码是一种基于稀疏矩阵的纠错码，它由一组奇偶校验方程组成，其中大部分元素为零，因此得名“低密度”。LDPC码的优点是可以有效地纠正大量的错误，尤其是对于高密度存储设备来说。

古猫先生·2024-02-01 03:41

TFRecord实践

在工作中，需要在训练模型的过程中，读入大规模稀疏矩阵，因此考虑用tfrecord进行加载1.生TFRecordimporttensorflowastfimportnumpyasnp"""txt文件中保存的是矩阵每一行的行坐标

钢镚儿_e134·2024-01-30 20:32

《Numpy 简易速速上手小册》第8章：Numpy 和 SciPy 的交互（2024 最新版）

解决线性代数问题8.1.3拓展案例1：数据插值8.1.4拓展案例2：优化问题8.2使用SciPy进行科学计算8.2.1基础知识8.2.2完整案例：曲线拟合8.2.3拓展案例1：积分计算8.2.4拓展案例2：稀疏矩阵运算

江帅帅·2024-01-30 20:46

数据结构 | 第七章：数组和矩阵 | 行主映射和列主映射 | 稀疏矩阵

文章目录7.1数组7.1.1抽象数据类型7.1.2C++数组的索引7.1.3行主映射和列主映射7.1.4用数组的数组来描述7.1.5行主描述和列主描述7.2矩阵7.2.1定义和操作7.2.2类matrixmatrix类声明matrix类的构造函数matrix类的复制构造函数matrix类对`()`的重载matrix类对`=`的重载matrix类对`+`的重载matrix类对`*`的重载7.3特殊矩

啦啦右一·2024-01-26 14:02

【数据结构】（C语言版）第三章：栈和队列

双端队列4.练习题三、栈和队列的应用1.栈在括号匹配时的应用2.栈在表达式求值中的应用3.栈在递归时的应用4.队列——树的层次遍历5.队列——图的层次遍历6.队列——操作系统应用四、特殊矩阵1.压缩存储2.稀疏矩阵一

_popo_·2024-01-26 11:06

5 数组

a,-1,sizeofa)复制：memcpy(last,dist,sizeofdist);//将dist备份为last排序快速排序quick_sort()归并排序merge_sort()查询二分双指针稀疏矩阵特殊三角矩阵对角矩阵一般一般的稀疏矩阵的压缩存储

cwn_·2024-01-25 19:19

scanpy预处理总结

importscanpyasscadata=sc.read("/Users/yxk/Desktop/test_dataset/pbmc/pbmc.h5ad")print(adata)可以看到这个原始数据是稀疏矩阵形式的

我的心永远是冰冰哒·2024-01-24 07:26

邻接矩阵的COO格式

我们知道，邻接矩阵通常是稀疏矩阵，而COO格式（CoordinateFormat）是稀疏矩阵的一种存储方式，本文将简要介绍如何将无权无向图的邻接矩阵转化为COO格式。

Iareges·2024-01-23 17:28

Eigen 与 CUDA cusolver 解大规模稀疏矩阵方程的实现与比较

近期在解决一个解大型稀疏矩阵方程的问题，用到了Eigen库和cuSolver库，并对二者的不同算法进行了时间上的比较。

石小鑫·2024-01-22 20:02

数据结构题型

选择题2021数据处理的单位：数据元素矩阵压缩存储2022①单链表头插法选择②矩阵压缩存储，行优先③删除链表节点的时间复杂度④稀疏矩阵存储⑤平衡二叉树时间复杂度⑥栈和队列的出队，问栈的大小至少多少⑦拓扑排序

my烂笔头·2024-01-22 17:05

数据结构与算法教程，数据结构C语言版教程！（第五部分、数组和广义表详解）二

三、矩阵（稀疏矩阵）压缩存储（3种方式）数据结构中，提供针对某些特殊矩阵的压缩存储结构。这里所说的特殊矩阵，主要分

别致的SmallSix·2024-01-22 04:31

数据结构与算法教程，数据结构C语言版教程！（第五部分、数组和广义表详解）三

五、行逻辑链接的顺序表（压缩存储稀疏矩阵）详解前面学习了如何使用三元组顺序表存储稀疏矩阵，其实现过程就是将矩阵中各

别致的SmallSix·2024-01-22 04:59

C#数据结构(4) 稀疏矩阵与稀疏方阵

导言线性代数是大学理工科学生的必修课。学过线性代数的同学一定对矩阵不陌生，因为线性代数就是一门关于矩阵的学科。程序设计中有一种储存数据的方式是二维数组，而二维数组本质上就是矩阵。但是，假如我们想要用二维数组去储存一个大规模的矩阵并进行运算的话，会造成很大的资源浪费。举个例子，假如我们想要用二维数组去储存一个20W*20W的单位矩阵，事实上其中只有20W个数是1，其他数字都是0。所以，我们或许可以利

HarmoniaLeo·2024-01-22 03:17

【详解】稀疏矩阵的十字链表✿◡‿◡

目录引言：稀疏矩阵的十字链表表示第一步：创结点存数据第二步：将头结点同数据结点串起来第三步：创建一个总头结点构成循环链表总代码如下：运行结果如下：结语：引言：接上一小结稀疏矩阵的三元组表示（循序表表示）

gobeyye·2024-01-21 15:34

数据结构-数组-稀疏矩阵表示与多维矩阵(转置、加法、乘法,附完整代码)

稀疏矩阵概念对于一个矩阵，我们非常自然的是将其存储在一个二维数组中，但对于一个矩阵，它的很多元素都为0，这样的矩阵我们叫做==“稀疏矩阵”==；比如一个的矩阵，它只有个非零元素，如果我们用的数组存储的话

一棵灬大树·2024-01-21 14:44

408数据结构知识点——第三章栈、队列和数组（二）

文章目录栈和队列的应用括号匹配代码实现表达式求值代码实现栈在递归中的应用队列的应用舞伴问题树的层次遍历图的广度优先遍历操作系统处理机调度策略数组和特殊矩阵数组的存储结构一维数组二维数组普通矩阵的存储对称矩阵的压缩存储三角矩阵的压缩存储三对角矩阵的压缩存储稀疏矩阵的压缩存储注

豆奶特浓6·2024-01-20 15:50

细胞基因完整矩阵转10xGenomics稀疏矩阵文件

经常分析单细胞数据的同学都知道，10xGenomics的细胞基因矩阵通常存储在三个关键文件中，这些文件共同描述了单细胞测序数据。这三个文件分别是：Barcodes.tsv，通常是一列多行，每一行代表一个细胞。Features.tsv，通常是两列多行，每一行代表一个基因，每行第一个是基因ID，第二个是对应的基因名称。Features.tsv。通常是三列多行，前两行可以理解为标题。从第三行开始，第一个

我是胡锦州·2024-01-20 01:27

python中的稀疏矩阵1（随手记）

分析一下这段代码test_csr=csr_matrix((test,(row,col)),shape=graph_shape)这行代码使用了csr_matrix类来创建一个稀疏矩阵，其中的数据(test

编程小白成长之路·2024-01-19 22:09

数据结构之数组、矩阵和广义表

数据结构之数组、矩阵和广义表1、数组1.1、数组的定义及基本运算1.2、数组的顺序存储2、矩阵2.1、特殊矩阵2.2、稀疏矩阵3、广义表3.1、广义表的基本操作3.2、广义表的特点3.3、广义表的存储结构

yysh_001·2024-01-19 09:40

Android中矩阵Matrix实现平移，旋转，缩放和翻转的用法详细介绍

对于一些特殊矩阵，如稀疏矩阵和准对角矩阵，有特定的快速运算算法。在MatrixMatrix中，矩阵的数学原理同样适用。Matrix提供了缩放、平移、旋转和

孤舟簔笠翁·2024-01-19 03:53

矩阵加法

题目：实现三元组表示的两个稀疏矩阵的加法。

土豆土豆皮·2024-01-17 01:16

Scipy 高级教程——稀疏矩阵

PythonScipy高级教程：稀疏矩阵Scipy提供了处理稀疏矩阵的工具，这对于处理大规模数据集中的稀疏数据是非常有效的。

Echo_Wish·2024-01-14 10:09

用一个简单的例子说明单细胞分析中的dgCMatrix数据的结构

dgCMatrix用来存储矩阵的一种数据格式，这种数据格式很适合存储稀疏矩阵（即矩阵中大部分值为0）。dgCMatrix使用三个数组（分别是i，p，x）来存储矩阵。怎么存的呢？

我是胡锦州·2024-01-13 15:13

稀疏矩阵的三元组表示----（算法详解）

目录基本算法包括：（解释都在代码里）1.创建2.对三元组元素赋值3.将三元组元素赋值给变量4.输出三元组5.转置（附加的有兴趣可以看看）稀疏矩阵的概念：矩阵的非零元素相较零元素非常小时，这个矩阵就叫稀疏矩阵

gobeyye·2024-01-11 05:15

day 81

数据结构1下述说法不正确的是_AA.数组可看成线性结构的一种推广，因此与线性表一样，可以对它进行插入、删除等操作B.稀疏矩阵以三元组表压缩存储后，必会失去随机存取功能C.从逻辑结构上看，n维数组的每个元素均属于

BoneInscri·2024-01-09 14:49

day 14

数据结构1.对稀疏矩阵采用压缩存储,其缺点之一是_选CA.无法判断矩阵有多少行多少列B.无法根据行列号查找某个矩阵元素C.无法根据行列号计算矩阵元素的存储地址D.使矩阵元素之间的逻辑关系更加复杂稀疏矩阵采用二维数组存储时

BoneInscri·2024-01-09 14:48

三元组压缩存储稀疏矩阵的转置

数据结构的一道上机题主要实现快速转置算法参考博客:稀疏矩阵的压缩存储及其转置算法参考博客把思路讲的很清晰了，但代码仍有错误，下面结合我的理解给出代码(难以理解的地方有注释)代码#include#include

MambaHJ·2024-01-09 07:34

matlab遍历所有节点最短路径,【7.19 graphshortestpath graphallshortestpaths函数】matlab 求最短路径函数总结...

语法为：[dist,path,pred]=graphshortestpath(G,S)[dist,path,pred]=graphshortestpath(G,S,T)G是稀疏矩阵，S是起点，T是终点。

步衫·2024-01-08 19:52

numpy 稀疏矩阵

python稀疏矩阵稀疏矩阵介绍稀疏矩阵是指矩阵中除了少量的非零元素，其余都是零的矩阵。稀疏矩阵一般的维度都比较大，如果直接用二维矩阵来表示的话，会造成内存溢出，或者计算缓慢的缺点。

阿君聊风控·2024-01-06 02:13

独热编码的两种实现形式

区别：输入格式要求：OneHotEncoder：接受二维数组或稀疏矩阵作为输入。需要先对分类特征进行编码为整数标签，然后再使用OneHotEncoder进行转换。DictVectorizer：接受字

acmakb·2024-01-01 16:09

稀疏矩阵压缩格式（Sparse Matrix Compression Formats）

BCCSBlockCompressedColumnStorageformatBCRSBlockCompressedRowStorageformatBNDLinpackBandedformatBSRBlockSparseRowformatCCSCompressedColumnStorageformatCOOCoordinateformatCRSCompressedRowStorageformatCS

AI杰克王·2023-12-31 02:44

备战数学建模1-MATLAB矩阵相关

目录一、数值数据二、常用函数三、变量及其操作四、矩阵的基础应用五、MATLAB基本运算六、字符串处理七、特殊矩阵八、矩阵变换九、矩阵求值十、矩阵的特征值与特征向量十一、稀疏矩阵一、数值数据（1）整型整型分为有符号整型号和无符号整型

nuist__NJUPT·2023-12-30 06:30

GoogleNetv1：Going deeper with convolutions更深的卷积神经网络

文章目录GoogleNetv1全文翻译论文结构摘要1引言2相关工作3动机和高层考虑稀疏矩阵4结构细节引入1x1卷积核可以减少通道数5GoogleNet6训练方法7ILSVRC2014分类挑战赛设置和结果

源代码•宸·2023-12-29 00:42

【数值分析】乘幂法，matlab实现

特别适合于大型稀疏矩阵。一个矩阵的特征值和特征向量可以通过矩阵不断乘以一个初始向量得到。每次乘完之后要规范化，防止上溢或下溢。规范化可以用各种范数。

你哥同学·2023-12-27 08:49

【数据结构】五、数组与广义表

目录一、定义二、计算数组元素地址三、稀疏矩阵快速转置稀疏矩阵的表示稀疏矩阵快速转置四、广义表一、定义我们所熟知的一维、二维数组的元素是原子类型。广义表中的元素除了原子类型还可以是另一个线性表。

42fourtytoo·2023-12-27 03:29

R语言数据处理：tidyr包学习

缺失值处理总结前言在R语言中，tidyr包的应用tidyr主要提供了一个类似Excel中数据透视表(pivottable)的功能;gather和spread函数将数据在长格式和宽格式之间相互转化，应用在比如稀疏矩阵和稠密矩阵之间的转化

「已注销」·2023-12-26 06:19

数据结构与算法基础

数组稀疏矩阵题目代入法选A数据结构的定义线性表顺序存储和链式存储的对比队列与栈题目答案选：D广义表树与二叉树二叉树遍历图中前序遍历结果是？1,2,4,5,7,8,3,6图中中序遍历结果是？

努力发光的程序员·2023-12-25 15:35

Opencv 8 （打印一个稀疏矩阵中的所有非0元素)

#include#include"opencv2/highgui/highgui.hpp"#include"opencv2/imgproc/imgproc.hpp"usingnamespacestd;voidmain(){intsize[]={10,10};cv::SparseMatsm(2,size,CV_32F);for(inti=0;i(idx)+=1.0f;//Printoutthenon

怕什么真理无穷·2023-12-23 18:10

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