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第三代测序
生信格式之sam、bam
一、sam、bam简介1、samSequenceAlignment/Mapformat,直译就是序列比对格式;序列比对是
测序
结果分析中最基础的一步操作,它主要基于参考序列信息回答了每条reads来自人的哪条染色体的哪个区域
小贝学生信
·
2023-10-26 03:59
根据已有序列提纯二三代
测序
数据
提纯二代数据bwaindexreference.fastabwamem-t10reference.fastaillumina_1.fastqillumina_2.fastq>
[email protected]
>out.bambedtoolsbamtofastq-iout.bam-fqmito_f1.fq-fq2mito_f2.fq提纯三代数据bwaindexr
马连洼小法师
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2023-10-25 23:44
家人印象系列(太太-1)2021-04-07
时间如流水一般,担心会遗忘原先的一些美好时光,趁着有时间写下来,把这份记忆备份一下,先写个家人系列,太太,小孩,父母,兄弟姐妹,大家庭
第三代
小孩,朋友,还有学习工作数年,一路上遇见的各种个性人士。
三人申雨2018
·
2023-10-25 21:20
SLG策略新黑马 《三国志威力无双》入围硬核超明星
这款
第三代
殿堂级SLG手游就以惊人的气势加入同品类市场的角逐,在首测期能获得如此优异的评价着实称得上成绩斐然,那么,《三国志威力无双》是否名归实至?它的实际表现又如何呢?颠覆性创
游戏荒姐
·
2023-10-25 20:05
2021-10-01-day7-重点是
国庆节快乐~今天的作业是关于
测序
知识的。这个我第一天就循着生信星球的文章看过,今天系统看了一下,收获颇多。
重点是
·
2023-10-25 19:25
人体微生物研究能改善临床肿瘤治疗吗?
利用突破性的DNA
测序
技术,科学家们确定了数以百万计的基因和成千上万种不同的物种,在我们体内的各种各样的细菌、病毒、真菌和单细胞微生物构成了人体的微生物世界。“微生物群落是一种复杂的代谢器
亨利福特健康
·
2023-10-25 17:16
RNAvelocity系列教程5:scVelo 的基本知识
首先,scVelo的输入数据是(未剪切)和(剪切)的两个计数矩阵,这些矩阵可以从标准
测序
协议中获取,如使用velocyto或loompy/kallisto计数管道。
Seurat_Satija
·
2023-10-25 17:18
Fastq文件的获取
下安装SRAToolkit工具使用SRAToolkit工具下载SRA数据Fastq文件的获取author:CYH-BIdate:2023.10.25Fastq文件得获取,可以从NCBI获取,也可以自己
测序
得到结果
CYH-BI
·
2023-10-25 12:37
转录组学习
学习
linux
转录组之序列剪切(Trimmomatic)[学习笔记通俗易懂版]
2023年7月6号本文知乎地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/642000061在这里我们们先介绍以下为什么需要进行序列剪切;序列剪切(sequencetrimming)是在
测序
数据分析中的一
CYH-BI
·
2023-10-25 12:07
转录组学习
学习
笔记
linux
弘扬铁人精神 展现新时代党员干部“三心”
全国优秀共产党员、大庆
第三代
铁人李新民为国寻油32年,始
辉组妍
·
2023-10-25 11:53
现在这三本低分期刊已经对纯生信不友好了
注意:我们所说的纯生信是没有补任何实验和自己的
测序
数据的。NO.1MedSciMonit,影响因子:2.649,中科
SCI狂人团队
·
2023-10-25 09:03
随机 hash 均匀分布
这个概率分布可能是正态分布,可能是泊松分布,也可能是大部分hash函数符合的均匀分布区块链中使用的hash函数ethereum使用的是sha3-256SHA-3是
第三代
安全散列算法(Se
古则
·
2023-10-25 09:46
单细胞 RNA
测序
揭示与肾透明细胞癌复发相关的巨噬细胞亚群
2021年5月27日,美国哥伦比亚大学欧文医学中心和赫伯特欧文综合癌症中心研究人员在Cell上发表关于与肾透明细胞癌复发相关巨噬细胞亚群研究的文章,该研究采用单细胞RNA
测序
技术对11位未治疗的肾透明细胞癌
晶典教你玩转科研
·
2023-10-25 03:56
最完整的人参考基因组
国际人类基因组
测序
协会在2001年发表了人类基因组草图,今天这篇文献2021年5月27由Telomere-to-Telomere(T2T)发表于bioRxiv,刚好在草图发布20周年之后。。
xiaoji_hb
·
2023-10-24 22:37
高通量
测序
中的接头(adapter)到底是什么
首先放一张
测序
示意图,在DNA片段两端所加的序列即接头序列,也就是我们今天要讲述的主角。
云养江停
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2023-10-24 18:52
退休之后来到陌生城市照顾
第三代
,“老漂族”如此任劳任怨为哪般?
放暑假了,连姐带着孙女从深圳回到自己的家。从正月十六离开家,再到昨天回家,将近五个月,连姐家灰尘满地,冰箱里面发霉,家里的电器基本都罢工了。只得叫了家政,帮着整理。因为连姐的老公老李,也带着大孙儿在回来的高铁上了。连姐做梦都没有想到,退休后的生活,会是这样的一种状态。拿连姐的话说,现在都以孩子为主,自己的晚年生活怎么过还另说。连姐有两个儿子,大的在南京,小的在深圳。大儿子的媳妇是当地人,有她自己的
晨曦中奔跑的瑛
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2023-10-24 17:22
你好,旧时光
她是
第三代
华人,是土生土长的槟城人,在南京接受高等教育,我说她的普通话和大陆人几乎没有差别,她说马来西亚的华人小孩都至少会说华语、马来语和英语。“不学马来语不
杨小白是我
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2023-10-24 08:16
单细胞预测doublets软件
在做单细胞
测序
时,常常出现一定比例的doublets,可以通过DoubletFinder去除。
生信编程日常
·
2023-10-24 07:51
030-
第三代
软件开发-密码输入框
第三代
软件开发-密码输入框文章目录
第三代
软件开发-密码输入框项目介绍密码输入框总结一下关键字:Qt、Qml、echoMode、TextInput、Image项目介绍欢迎来到我们的QML&C++项目!
DreamLife.
·
2023-10-24 04:09
#
Qt
qml
LineEdit
Image
echoMode
物联网通信技术原理第5章 移动通信技术
目录5.1移动通信的基本概念及发展历史5.1.1移动通信的基本概念5.1.2移动通信的发展历史(理解)1.第一代移动通信系统(1G)2.第二代移动通信系统(2G)3.
第三代
移动通信系统(3G)5.1.3
一直在努力的小宁
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2023-10-24 04:29
物联网通信技术原理
网络
人工智能
物联网
现实生活
曾经以为的亲情真的抵不过利益二字,作为
第三代
我没有任何发言权,加上这两天爷爷身体突然恶化,遗嘱又没有立好公证,这一团乱麻的亲情关系,只剩下冰冷。昨晚凌晨两点才入睡,躺在床上根本无法安睡。
咘谷兮
·
2023-10-24 03:54
开始布局
前期涨幅靠前的鸿蒙概念+
第三代
半导体开始走弱,完全展现出了题材的轮动是非常快的,科技涨完,新能源涨。
九命_猫妖
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2023-10-24 02:05
026-
第三代
软件开发-C++&QML交互
第三代
软件开发-C++&QML交互文章目录
第三代
软件开发-C++&QML交互项目介绍C++&QML交互属性绑定示例信号与槽在QML中调用C++函数使用上下文共享数据创建可导出的C++对象总结一下关键字:
DreamLife.
·
2023-10-24 00:29
#
c++
qt
qml
Q_OBJECT
QObject
032-
第三代
软件开发-Popup弹窗
第三代
软件开发-Popup弹窗文章目录
第三代
软件开发-Popup弹窗项目介绍Popup弹窗官方示例项目中的代码之前写过一个Popup抄抄别人的dimvisible和Open区别与Dialog有啥区别其他总结一下关键字
DreamLife.
·
2023-10-23 23:50
#
Qt
qml
Popup
modal
弹窗
2019-08-26
第一步进行末修,即在末端磷酸帽子保护碱基;第二步在3’端加A,把接头加到需
测序
片段的两端,是将基因转化为可以上
测序
仪的状态;第三步则是扩增,因为之前的效率不
参错
·
2023-10-23 20:18
精彩纷呈宋王朝(第二部,第十四章,第十一节)
公元1096年,唃嘶啰政权
第三代
首领阿里骨病逝,其子瞎征继位,这是唃嘶啰政权的第四代。第二年正月,大宋封瞎征为河西军节度使、检校司空、宁塞郡公,算是
司马吹风
·
2023-10-23 17:59
组间差异分析神器-STAMP | 分析技能
在微生态研究中,当我们做完16S或宏基因组
测序
等多样性
测序
后,想找出不同处理组之间差异物种或差异基因,一般常用的组间差异分析metastats(只能用于两组之间的差异比较)、LEfSe、秩和检验等。
斗战胜佛oh
·
2023-10-23 15:27
029-
第三代
软件开发-加载本地字体库
第三代
软件开发-加载本地字体库文章目录
第三代
软件开发-加载本地字体库项目介绍加载本地字体库关键字:Qt、Qml、QFont、QFontDatabase、ttf项目介绍欢迎来到我们的QML&C++项目!
DreamLife.
·
2023-10-23 15:53
#
Qt
Qml
ttf
字体
构建一个近乎完整的植物基因组
shotgunOLC(CELERAassembler):木瓜、大豆、杨树等早期
测序
植物。454/IlluminaDBG短序列高深度带来植物基因组组装大爆发,但质量
生物信息与育种
·
2023-10-23 14:47
开学第一课观后感
叔叔是戍守边疆的
第三代
,他经常唱了一首歌,叫做《花儿为什么这么红》。听了他女儿的讲述叔叔的一生我特别感动。我要向这位叔叔学习,学习他的无私奉献的精神。第二个印象最深的是宇航员带我们参观空间站。
早起的鸟儿有虫吃哈
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2023-10-23 10:06
031-
第三代
软件开发-屏幕保护
第三代
软件开发-屏幕保护文章目录
第三代
软件开发-屏幕保护项目介绍屏幕保护关键字:Qt、Qml、MediaPlayer、VideoOutput、function项目介绍欢迎来到我们的QML&C++项目!
DreamLife.
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2023-10-23 09:14
#
qt
qml
QObject
MediaPlayer
VideoOutput
数据保密-
第三代
透明加密技术
透明加密技术是近年来针对企业数据保密需求应运而生的一种数据加密技术。所谓透明,是指对使用者来说是透明的,感觉不到加密存在,当使用者在打开或编辑指定文件时,系统将自动对加密的数据进行解密,让使用者看到的是明文。保存数据的时候,系统自动对数据进行加密,保存的是密文。而没有权限的人,无法读取保密数据,从而达到数据保密的效果。自WindowsNT问世以来,微软提出的分层的概念,使透明加密有了实现的可能。自
我漂亮吗
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2023-10-23 09:44
2022-04-14
NatBiotech|从DNA片段谱推断基因表达原创榴莲不酥图灵基因2022-04-1407:03收录于话题#前沿分子生物学技术撰文:榴莲不酥IF=54.908推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:无细胞DNA
测序
的表观遗传表达推断
图灵基因
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2023-10-23 05:17
学习小组Day7——林瑶
一代
测序
(Sanger
测序
):利用双脱氧核苷酸ddNTP去摸索DNA分子二代
测序
构建DNA文库上样桥式PCR
测序
名词结构化基因组学(核酸序列分析)转录组学(基因表达分析)蛋白质组学代谢组学Day7.png
瑶_4ff9
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2023-10-23 05:18
airpods pro是按压还是触摸_airpodspro触摸区域在哪里
它是苹果公司的
第三代
AirPods,采用了全新的入耳式外观设计而不是EarPods那个使用多年的经典外观。入耳式主要是为支持降噪功能,以增强聆听体验。这也是它跟前两代最大的功能不
weixin_39943202
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2023-10-23 03:33
airpods
pro是按压还是触摸
系统发育常见软件与在线工具合集
1.数据获取1.1
测序
数据整理DNAstarDNAstar是一个序列编辑和分析的全功能包,其子包Seqman能比对和手动调整Sanger
测序
文件,操作简单,但默认不解析少量低质量
测序
结果的
测序
文件Chromas
张振zz
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2023-10-23 01:54
用IGV判断NGS链特异性
现在很多人都从NCBI上下载高通量
测序
的SRA文件重新分析利用,想要更加准确地利用这些数据,首先要明确SRA的特征。
测序
的目的是一方面,建库的类型是一方面,链特异性也是很重要的一方面。
木制品_1125
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2023-10-23 00:49
检测snp和InDel的工具:snippy~可用于检测两条fasta序列之间的变异生成vcf格式文件
github主页对软件的介绍image.png通常利用二代
测序
数据检测单核苷酸多态性(SNP)和插入缺失(InDels)变异的基本流程是1
测序
数据与参考基因
小明的数据分析笔记本
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2023-10-23 00:47
单细胞
测序
文章图表复现05—免疫细胞亚群再分类
本文是参考学习CNS图表复现04—单细胞聚类分群的resolution参数问题的学习笔记。可能根据学习情况有所改动。既然我们根据Cellsweredefinedasnon-immuneifbelongingtoaclusterlowforPTPRC(geneforCD45)的规则,把细胞区分为了免疫细胞和非免疫细胞,详见:我在单细胞天地的教程:是否是免疫细胞很容易区分那是否是肿瘤细胞呢?现在我们就
Seurat_
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2023-10-23 00:30
健康黑匣子讲堂 关注儿童健康预警,从我做起(上)
健康预警第一代:家庭基本照护,天冷加衣,天热减衣健康预警第二代:疫苗接种、有/无专业指导下的药膳、食补、家庭常备医药箱、幼儿园定期体检儿童健康预警
第三代
:
健康黑匣子
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2023-10-22 21:14
我读《红楼梦》(第二回)
第三代
“文”字辈,敷(早亡)、敬、赦、政、敏。第四代“玉”字辈,珍、珠(早亡)、琏、宝玉、环、四春。第五代“草”字辈,蓉、兰、巧姐、蔷、芹、芸等。
史努比刘
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2023-10-22 19:31
2021-07-03 CRISPR-Cas9基因编辑技术简介
ivk_sa=1024320u来源|公众号:中学生物科学CRISPR-Cas9基因编辑技术简介mp.weixin.qq.com图标CRISPR-Cas9是继ZFN、TALENs等基因编辑技术推出后的
第三代
基因编辑技术
__一蓑烟雨__
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2023-10-22 17:11
2020-5-24
可传到
第三代
,子孙辈便大多贪
林桂绸
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2023-10-22 08:31
基因组重
测序
数据分析脚本
~/Process/result/depth.txt将
测序
深度保存为depth.txt4.
lizg
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2023-10-22 06:42
自然语言处理---经典序列模型
它一般以文本序列数据为输入,以该序列对应的隐含序列为输出.什么是隐含序列:*序列数据中每个单元包含的隐性信息,这些隐性信息之间也存在一定关联.举个例子:给定一段文本:"人生该如何起头"我们看到的这句话可以叫做:观
测序
列我们可以将这句话以词为单位进行划分得到
lichunericli
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2023-10-22 05:20
自然语言处理
自然语言处理
easyui
人工智能
青梅煮酒论英雄!《三国志威力无双》邀你与三国名将共谋天下
在
第三代
殿堂级正版战争策略手游《三国
游戏荒姐
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2023-10-22 04:30
纯电专属平台引领"鲸空间"Aion S震撼来袭
并搭载有广汽
第三代
温控系统及BMS精准控制和全球领先的永
车享一家
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2023-10-22 00:34
数学建模 预测方法集锦
当时间序列的数值由于受周期变动和不规则变动的影响,起伏较大,不易显示出发展趋势时,可用移动平均法,消除这些因素的影响,分析、预
测序
列的长期趋势。移动平均法简单移动平均法加权移动平均法趋势移动
CTGU_daffodil
·
2023-10-22 00:34
数学建模
数学建模
第二章:降生之始,风氏风浔
那是风氏的
第三代
长孙女出生的时候,红霞漫天,照耀着整个九天,伴随着凤凰花香,那西天的七彩雀鸟绕着青云府一圈又是一圈,仙者们扳着手指头数了数,嗯,恰好九圈。
风苍何处浔
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2023-10-21 23:47
【RNA structures】RNA转录的重构和前沿
测序
技术
文章目录RNA转录重建1先简单介绍一下
测序
相关技术2MaptoGenomeMethods2.1Step1Mappingreadstothegenome2.2Step2Dealwithsplicedreads2.3Step3Resolveindividualtranscriptsandtheirexpressionlevels3Align-de-novoapproaches3.1Step1
丸丸丸子w
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2023-10-21 22:02
生物信息
RNA
RNA测序
生物信息
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