CCA

深入解析Seurat整合单细胞数据函数FindIntegrationAnchors 2（CCA和L2正则化算法）

hi各位，今天我们来深入了解一下Seurat做多样本整合的深入算法，CCA算法以及FindIntegrationAnchors函数中的的参数l2.norm先来知道一下CCA典型关联分析(CanonicalCorrelationAnalysis
Evil_Genius·2023-06-13 00:56

降维常用方法SVD、PCA、CCA、NMF

最近在学习一些自然语言处理方面的知识，在学习的过程中发现，词向量构成的矩阵多为稀疏矩阵，信息比较分散，必须通过降维的方法将信息集中起来，从而方便后续的分析。本文将重点介绍几种不同降维方法的思想、区别PCA简介：主成分分析算法的关键在于对坐标轴进行旋转，从而找到使得数据中信息更加集中的坐标方向。简单的说就是对数据进行投影。PCA的算法流程对样本进行中心化小tip：对样本中心化之后的协方差数据的分析，
dearbobby·2023-06-09 00:08

2020-08-17

Manteltest分析两个距离矩阵之间的相关性做微生物菌落少不了分析环境因子（pH，有机碳，总氮，盐度等）与菌落的相关性，此时便需要做CCA和Manteltest分析。
ZMQ要加油呀·2023-04-21 11:50

免费开源的thinkphp办公管理系统

https://www.chtml.cn/product/show/3073开发日期：2016年11月安装教程：宝塔版[小白一键安装版]：https://www.jianshu.com/p/afc56cca846a
任聪聪·2023-04-20 19:50

10X单细胞转录组整合、转录组 && ATAC整合分析之VIPCCA

好了，今天我们来分享一个单细胞多样本整合的分析方法，VIPCCA，顾名思义，CCA的进阶版，参考文献在Effectiveandscalablesingle-celldataalignmentwithnon-linearcanonic
Evil_Genius·2023-04-20 04:47

10X单细胞数据整合分析Seurat之rpca（large data，细胞量超过20万）

不知道大家在研究单细胞数据整合函数FindIntegrationAnchors的时候没有发现一个很有意思的参数，那就是reduction，有两个选项，一个是cca，一个是rpca，其中关于FindIntegrationAnchors
Evil_Genius·2023-04-20 02:20

Seurat24式太极拳之6左右倒卷肱---使用互惠PCA（RPCA）进行快速集成

与其使用典范的相关分析（'CCA'）来识别锚点，不如使用互惠的PCA（'RPCA'）。在使用RPCA确定任何两个数据集之间的锚点时，我们
Seurat_·2023-04-20 00:31

单细胞36计之19釜底抽薪---使用互惠PCA（RPCA）进行快速集成

与其使用典范的相关分析（'CCA'）来识别锚点，不如使用互惠的PCA（'RPCA'）。
Seurat_Satija·2023-04-19 23:39

【附代码】SSVEP解码算法 - 局部时间信息的典型相关分析（TCCA）

FilterbanktemporallylocalcanonicalcorrelationanalysisforshorttimewindowSSVEPsclassification.”CognitiveNeurodynamics14(2020):689-696.2算法原理其算法在CCA
IT - 边缘人·2023-04-18 01:04

【附代码】SSVEP解码算法 - 扩展典型相关分析（eCCA）

etal.Enhancingdetectionofsteady-statevisualevokedpotentialsusingindividualtrainingdata[J].IEEE,2014.DOI：10.1109/EMBC.2014.69442632算法原理其算法的核心是CCA
IT - 边缘人·2023-04-18 01:04

基于典型相关分析的故障检测和过程监控算法研究（Matlab代码实现）

本文目录如下：目录1概述2运行结果3参考文献4Matlab代码实现1概述文献来源：本文首先研究了一种基于广义典型相关分析（CCA）的故障检测（FD）方法，旨在在可接受的误报率下最大限度地提高故障检测能力
数学建模与科研·2023-04-17 22:50

单细胞笔记7-scRNA-seq去除批次效应的方法总结

SeuratSeurat整合流程与原理使用CCA分析将两个数据集降维到同一个低维空间，因为CCA降维之后的空间距离不是相似性而是相关性，所以相同类型与状态的细胞可以克服技术偏倚重叠在一起。
江湾青年·2023-04-16 09:06

Seurat4.0系列教程13：使用互惠 PCA （RPCA） 快速整合数据

我们不再使用（"CCA"）来识别锚点，而是使用互惠PCA（"RPCA"）。在使用RPCA确定任意两个数据集之间的锚点时，我们将每个数据集投影到其他PCA空间中，并按相同的邻近要求寻找锚点。
Seurat_Satija·2023-04-15 03:33

数学建模 —— 降维算法

文章目录前言数据降维的作用一、主成分分析（PCA）1.介绍2.算法流程3.主成分分析的说明二、因子分析（FA）1.介绍2.算法流程3.因子分析和主成分分析的对比三、典型相关性分析（CCA）1.介绍2.算法思路
Hope Cordial·2023-04-10 11:29

【实操】3：CentOS7 系统下搭建禅道，页面空白的问题解决办法

主要都是照着这篇文章操作的：https://jingyan.baidu.com/article/fea4511a3cca6ef7ba912544.html其他参考：https://www.zentao.net
Queenie的学习笔记·2023-04-05 21:17

Seurat4.0系列教程12：大数据集整合的方法

首先，我们使用互惠PCA（RPCA）而不是CCA来寻找锚点。在使用互惠的PCA确定任意两个数据集之间的锚点时，我们将每个数据集投影到其他PCA空间中，并根据相同的邻近要
Seurat_Satija·2023-04-02 01:10

docker 安装 Elasticsearch:6.5.4 并使用logstash 同步mysql数据到Elasticsearch

6.5.46.5.4:Pullingfromlibrary/elasticsearcha02a4930cb5d:Downloading[===================>]30MB/75.17MBdd8a94cca3f9
风中吃西瓜·2023-03-31 02:52

使用Sentry错误监控实践

docs.sentry.io/guides/安装教程https://github.com/getsentry/self-hosted/tree/cd13427aa9a231b2b27c9fd14017d183cca52c1eSentry
三也视界·2023-03-28 18:07

｜大咖教室｜3招辨别伪心理学，拒绝精神洗脑忽悠走你家的800万？！

韩公元，九型人格全球学会EPTP亚洲中心高级督导，九型人格全球学会EPTP认证导师，九型人格CCA协会高级督导，九型小兔特约撰稿人。西游记有真假美猴王，这心理学课程也有“小雷音寺”啊。
小兔讲九型·2023-03-18 21:27

手写顺序栈

定义方法WeChata57be4379d9cca532be87e33af30ec0f.png调用image.png运行结果WeChat43fd0aaec290f7921dbc03ae2647a1bb.png
河马咕嘟·2023-03-16 22:55

单细胞转录组高级分析一：多样本合并与批次校正

scRNA数据校正批次效应的算法有很多：MNN,CCA+MNN,Harmony,Scanorama,s
Seurat_·2023-03-14 23:51

意外的礼物

她是我还在英国学校工作时，每天下午4点半带CCA校车时搭档的师傅。一转眼，我已经离开那里2年多了，她也已经退休回家带孙女了，难得她还挂念着我，实在是让人感动。印象中，程师傅工作特别认真负责。
DorisGuo_bc09·2023-03-12 08:12

常见分析方法 | PCA、PCoA和NMDS有什么区别？

无论是主成分分析（PCA）、主坐标分析（PCoA）、非度量多维尺度分析（NMDS），还是冗余分析（RDA）、典范对应分析（CCA）都属于降维排序分析方法。
斗战胜佛oh·2023-02-19 03:37

sklearn PLS DecisionTree EnsembleMethods

PLS降维与CCA降维考虑区别应当是前者进行了归一化处理，而后者不是。importnumpyasnpimportmatplotlib.pyplo
斯温jack·2023-02-07 07:30

溯源系统溯源码的生成方法

2ea0ac420595db0bb0bcf20759876afa8837ea2d89d7fb58e4c16d083be190b1071e76d132aadd115833aa5d43ea90b17701884443989b9fc4704ff559cca63c2325e6a1967d5e6
快乐生活2019·2023-02-06 10:54

ggplot2 多个柱状图比较_2. 主成分分析（PCA）与ggplot2绘图

现在陆续附上个人总结的PCA、NMDS、CCA和RDA分析与ggplot2表达的部分代码。当然在使用时还需要对ggplot2表达进行优化。
weixin_39688035·2023-02-06 07:51

docker基本用法

下载ubuntu最新版本的镜像sudodockerimages//列出本地镜像sudodockerimagesu*//使用通配符列出本地镜像sudodockerrmiubuntu:latest/2a4cca5ac898
能喝果汁不喝酒·2023-02-05 16:18

Unity加入Swift4.1项目中

U3D项目更新时只需要把unity_ios目录中的文件替换即可2357B9A7-ECE7-4CCA-A0F8-A1FD596FA0A3.png1、正式开始吧~第一步先创建Unity.xcconfig,添加到项目
PiscesLi·2023-02-04 23:31

2022-01-17 CCA校正批次效应

批次效应强时，用CCA进行校正先用PCA图查看不整合前的批次效应原理在每个批次中找到相同的一组表达差异低的基因，用这组基因在每个亚群中的差异代表整体基因的差异，按照这个差异调整整体基因表达水平#该代码用于理解并分析批次差异比较大的样本
徐添添·2023-02-01 23:00

docker基础

path//local/pathdockercp/local/pathcontainer-name:/pathimagedockerimagelsdockerimagerm75835a67d1342a4cca5ac898
箭飞天·2023-01-29 04:07

Cloud Code Analysis

两个服务器之间数据迁移慢6.缺少监控数据，业务数据kw1.服务器经常异常宕机2.许可证协议无法按院，地址统计3.增量编译加速4.监控使用数据不足Coverity1.资源不足2.监控数据不足3.许可证协议统计使用CCA
朱政_9881·2023-01-28 18:35

BSRN网络——《Blueprint Separable Residual Network for Efficient Image Super-Resolution》论文解读

：网络架构：具体流程：BSConv：ESDB——EfficientSeparableDistillationBlock：BlueprintShallowResidualBlock(BSRB)：ESA和CCA
子壹·2023-01-19 07:54

Sklearn官方文档中文整理6——交叉分解，朴素贝叶斯和决策树篇

监督学习1.8.交叉分解【cross_decomposition.PLSRegression，cross_decomposition.PLSCanonical，cross_decomposition.CCA
yumin1997·2023-01-16 17:37

X-62A大大提升美国空军对人工智能系统的测试能力

美国空军希望“协同作战飞机”（CCA）项目最早能够在2024财年启动，届时需要尽量排除技术风险，并证明无人机可以安全和有效地由人工智能控制。
人机与认知实验室·2023-01-11 12:38

pca主成份分析方法

reference：基于CCA的fMRI时空模型数据处理方法的研究，肖柯，硕士论文。———
csdn产品小助手·2023-01-08 13:45

点云处理简介

spm_id_from=333.337.search-card.all.click&vd_source=027b873d55e11100a6233cca0e4a339f2、3维度点云数据类型点云：某个坐标系下的点数据集
渡口五十六·2022-12-31 15:02

送书 | 222Beta多样性限制性排序CPCoA/CCA/RDA/LDA

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程（原理、代码和评述）)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析(step-by-step)-Limma差异分析
生信宝典·2022-12-29 15:55

基于典型相关性分析(CCA)的多视图学习方法综述

本文主要借鉴自《CanonicalCorrelationAnalysis(CCA)BasedMulti-ViewLearning:AnOverview》，转载自伍冬睿科学网博客，链接地址：https:/
长路漫漫2021·2022-12-27 18:28

CCNet：交叉注意力语义分割

论文地址：https://arxiv.org/pdf/1811.11721.pdf目录0、摘要1、CCA、RCCA模块2、网络结构3、损失函数4、结论0、摘要上下文信息对视觉理解问题十分重要，如在语义分割和目标检测领域
叶舟·2022-12-25 13:41

【虚拟试衣论文笔记】Towards Scalable Unpaired Virtual Try-On via Patch-Routed Spatially-Adaptive GAN

论文地址：https://proceedings.neurips.cc/paper/2021/file/151de84cca69258b17375e2f44239191-Paper.pdf项目地址：https
橙子的科研日记·2022-12-24 13:26

nmds与mds的区别_常见分析方法 | PCA、PCoA和NMDS有什么区别？

|撰文：阿拉雷回想当年，刚踏足科研领域，心中豪气万丈，幻想着努力发发发paper，从此走上人生巅峰......但当拿到微生物群落研究报告时却瞬间傻了眼，PCA、PCoA、NMDS、CCA、RDA各种长的差不多
白富美妖姐·2022-12-24 10:33

详解结构方程模型、路径分析方法

一、简介微生物群落研究逐渐从单一的群落结构研究转向分析群落与环境因素的关联互作机制研究当中，典型的环境因子分析方法有CCA/RDA、互作网络图、VPA分析等，这些分析能帮助我们逐一比较待选的环境因子与微生物群落数据间的关联性
sta@ma@brain·2022-11-27 10:36

基于Chebyshev融合头狼引导的狼群协同围攻策略的改进灰狼算法

文章目录一、理论基础1、灰狼优化算法(GWO)2、Chebyshev融合头狼引导的群体协同围攻策略的改进的灰狼算法(CCA-GWO)2.1Chebyshev种群初始化2.2头狼引导的狼群协同围攻策略（1
心️升明月·2022-11-23 10:19

AutoDL算力租用，Mobaxterm+Pycharm+VScode通过SSH连接远程服务器AutoDL

code=f8e175e4-67c3-4cca-b120-09b11caaf2e6第一步先注册，新注册的有免费十块代金劵，提供免费体验一下，本想白嫖，一体验，直接上车。
浪迹天涯@wxy·2022-11-22 08:44

Pytorch的grid_sample是如何实现对grid求导的？（源码解读）

（源码解读）这里本人的参考源码是grid_sample的CPU内核的CPP实现：https://github.com/pytorch/pytorch/blob/b039a715ce4e9cca82ae3bf72cb84652957b2844
蔡斯达纳·2022-11-18 08:24

R vegan包安装报错:‘vegan’ had non-zero exit status && CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED

Vegan包提供各种群落生态学分析工具，包括常用的排序方法(PCA,CA,DCA,RDA,CCA和NMDS)，同时也包括这些方法偏分析版本(Partialmethods)。
这是李金辉呀·2022-11-08 13:18

使用Flutter，历时三个月，我写了一个桌面象棋打谱软件

目前，该软件已经在官网上线，官网链接：https://cca.yhdm360.cn。
·2022-10-07 21:00

明辰智航教您识别铜包铝（CCA）电缆的方法

在你太激动之前，你可能想确保电缆不是由包铜铝（CCA）制成的。使用CCA导体制成的电缆比使用实心铜便宜，根本不值得冒险。
北京明辰智航·2022-09-30 13:12

Magichub 重口音对话ASR挑战赛颁奖仪式及案例分享-下半场

同时，邀请获奖团队进行方案分享，网易游戏《CCDL口语语音识别与微调技术》、同花顺&天津大学《RoyalFlush-CCA重口音对话ASR方案介绍》、网易有道《基于ESPNnet的重口音识别
Magic Data·2022-09-29 07:06

典型相关分析(CCA)及其python实现

典型相关分析(CanonicalCorrelationAnalysis)是一种分析多变量与多变量之间关系的统计方法。比如我们现在有自变量(x1,x2,x3)=((x_1,x_2,x_3)=((x1,x2,x3)=(身高，体重，肺活量)))，因变量(y1,y2)=(50(y_1,y_2)=(50(y1,y2)=(50米成绩，立定跳远成绩)))，我们想要研究自变量对因变量的作用。如果分别求取xix_i
Castria·2022-09-13 12:29
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