Cox

生存分析之Cox比例风险模型

cox比例风险模型则适合衡量具体某一因素对生存的影响程度，用HR(hazardratio)值体现，HR是某一因素影响生存的比率。cox模型公式如下。
BeeBee生信·2021-06-19 18:02

TCGA学习04：建模预测-cox回归

TCGA学习01：数据下载与整理-TCGA学习02：差异分析-TCGA学习03：生存分析-TCGA学习04：建模预测-cox回归-TCGA学习04：建模预测-lasso回归-TCGA学习04：建模预测-
小贝学生信·2021-06-13 20:15

TCGA学习04：建模预测-随机森林&向量机

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小贝学生信·2021-06-11 23:16

Nat Commun&JAMA INTERN MED|浅析两篇LASSO+Logistic/Cox 套路文章

Lasso+cox.jpgNatCommun&JAMAINTERNMED|浅析两篇LASSO+Logistic/Cox套路文章两篇文章分别是来自NATURECOMMUNICATIONS的EarlytriageofcriticallyillCOVID
木舟笔记·2021-06-08 19:31

TCGA学习02：差异分析

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小贝学生信·2021-06-06 23:00

森林图快速绘制工具

“把数据格式用Excel整理好，在粘贴到小工具中，点击鼠标，即可做出高颜值的森林图”01—研究背景前面给小伙伴们分享的《简易批量生存分析工具》，使用cox比例风险分析和KM曲线来展示每个基因对患者生存状态的影响
生信学霸·2021-06-05 01:37

野樱莓 | 传说中的不老莓

在日本，研究人员发现野樱莓可以阻断COX-2的作用，COX
ZAHRA飒赫拉·2021-06-04 07:47

R语言绘制限制立方条图2（基于logistic回归和线性回归）

既往教程中我们介绍了使用R语言在COX回归模型基础上绘制限制立方条图，后台有不少粉丝说道不
天桥下的卖艺者·2021-05-17 16:57

FK 3311

COX-2??????????????????????????????
莫小枫·2021-05-14 22:07

R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)

原文:R语言之生信⑦Cox比例风险模型(单因素)目录R语言之生信①差异基因分析1R语言之生信②差异基因分析2R语言之生信③差异基因分析3R语言之生信④TCGA生存分析1R语言之生信⑤TCGA生存分析2R
天道昭然·2021-05-12 05:55

基于DNA甲基化的分子亚型构建发5+分

MolecularsubtypesbasedonDNAmethylationpredictprognosisincolonadenocarcinomapatients”，文章作者基于TCGA-COAD队列甲基化数据对COAD进行分型，并根据亚型特异甲基化位点构建COAD的COX
科研菌·2021-05-05 13:56

Gartner报告解读：IBM全球DC业务SWOT分析

SWOT:IBM,DataCenterBusiness,WorldwideAnalyst(s):NareshSingh,RogerW.Cox,GregYoung,JoeSkorupa,ErrolRasitPublished
燕刀刀·2021-05-04 05:16

2019-12-22 Day10-14-学习 TCGA数据库单基因文章套路

提取矩阵中基因表达量，然后做差异表达分析-散点图-疾病和正常或肿瘤与癌旁比较，配对的差异分析-肿瘤与癌旁，然后对TCGA临床数据进行下载和整理，生产分析与基因联合，然后临床相关性分析-与性别-分期等是否有关，然后COX
卅衣·2021-04-28 20:58

R语言 生存分析与cox模型的学习笔记

K-M曲线可视化2、Log-Rank检验三、TheCoxproportionalhazardsmodel（PH模型）1、Coxproportionalhazardsmodel基础概念2、R代码实现3、验证Cox
菠萝西斯·2021-04-28 19:33

OC基础教程之语法 【转载】

20世纪80年代早期由BradJ.Cox设计,2007年苹果公司
十年落魄·2021-04-24 20:02

R语言配色方案02-RcolorBrewer包

作者：白介素2相关阅读：R语言配色方案01-colortoolsR语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpubr-专为学术绘图而生（二）ggstatsplot
医科研·2021-04-21 11:43

Objective-C 程序设计（第四版）复习摘要(上)

分享给大家（很基础哈，高手勿喷）BradJ.Cox在20世纪80年代早期设计了Objective-C这门编程语言。1988年，Objective-C的语言库和开发环境(NEXTSTEP)产生了。
herbert·2021-04-20 22:01

R语言ggboxplot-一文掌握箱线图绘制所有细节

作者：白介素2相关阅读：R语言ggplot2绘制箱线图R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断R语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpubr
医科研·2021-04-19 21:40

R语言进行数据结构化转换：Box-Cox变换、“凸规则”变换方法

在讨论回归模型中的变换时，我们通常会简单地使用Box-Cox变换，或局部回归和非参数估计。这里的要点是，在标准线性回归模型中，我们有但是有时候，线性关系是不合适的。
拓端研究室·2021-04-19 18:22

R语言：生存分析 Cox回归分析 survival analysis

Cox模型是干什么的？Cox模型的目的是同时评估几个因素对生存的影响。换句话说，它使我们能够检查特定因素在特定时间点如何影响特定事件（例如，感染，死亡）的发生率。这个速度通常被称为危险率。
生信频道·2021-04-19 13:27

R语言之生信（12）一分钟学会绘制cox/meta森林图

目录R语言之生信①差异基因分析1R语言之生信②差异基因分析2R语言之生信③差异基因分析3R语言之生信④TCGA生存分析1R语言之生信⑤TCGA生存分析2R语言之生信⑥TCGA生存分析3R语言之生信⑦Cox
柳叶刀与小鼠标·2021-04-19 13:04

TCGA学习04：建模预测-lasso回归

TCGA学习01：数据下载与整理-TCGA学习02：差异分析-TCGA学习03：生存分析-TCGA学习04：建模预测-cox回归-TCGA学习04：建模预测-lasso回归-TCGA学习04：建模预测-
小贝学生信·2021-04-19 09:23

R绘制森林图（forestplot）

前面我们讲过了单因素和多因素cox回归分析，那么怎么样将结果以森林图的形式来展示呢？
生信交流平台·2021-04-19 04:06

m5C纯生信分析套路 m5C预后模型构建+验证

使用单变量Cox回归和LASSOCox回归算
呆呆聊生信·2021-04-18 15:13

TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）

测序上游分析系列：mRNA-seq转录组二代测序从rawreads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从rawreads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【一】miRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从rawreads，鉴定已知miRNA-预测新miRNA，到表达矩阵【二】其他文章系列：ggplot2作图篇：（1
ZZZZZZ_XX·2021-04-18 06:57

一致性指数：Harrell’concordance index:C-index

concordanceindex，中文里有人翻译成一致性指数，最早是由范德堡大学（VanderbiltUniversity）生物统计教教授FrankEHarrellJr1996年提出，主要用于计算生存分析中的COX
医科研·2021-04-18 05:28

R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断

作者：白介素2相关阅读：R语言生存分析04-Cox比例风险模型诊断R语言生存分析03-Cox比例风险模型R语言生存分析-02-ggforestR语言生存分析-01ggpubr-专为学术绘图而生（二）ggstatsplot
医科研·2021-04-14 21:01

生存分析（二）-- Cox比例风险模型（Cox proportional-hazards model）

翻译自：http://www.sthda.com/english/wiki/cox-proportional-hazards-modelCox比例风险模型（考克斯，1972年）是常用的统计在医学研究调查的患者和一个或多个预测变量的存活时间之间的关联回归模型
你有康娜可爱吗·2021-04-13 20:46

【搬砖】构建预后signature 实践

Cox回归模型写在最开头：诚心推荐解螺旋麦子的Cox回归模型R教学视频！！！如果你对cox还稀里糊涂的，下面的链接，点！
yadandb·2021-04-13 12:37

forestplot R 森林图绘制

1单因素COX和多因素COXclinical.txtlibrary(survival)rt=read.table("clinical.txt",header=T,sep="\t",check.names
医学小白学生信·2021-04-12 23:27

论文模板丨最基本的生信套路换了miRNA也能发6分+

文章利用了从TCGA数据库中搜集的头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）RNA测序数据和miRNA测序数据进行了综合分析，通过与临床数据结合，利用Cox回归分析，得到了7个与HNSCC相关的标志性miRNA，确定为用于头颈部鳞状细胞癌预后的新型
WOSCI沃斯编辑·2021-04-12 22:02

数据分析：基于glmnet的Cox-PH分析

glmnet提供了LASSO或ridgeregression的Cox-PH分析模式，用于研究预测变量与生存时间的关系。具体做法先训练模型再使用最佳参数构建模型。
华仔少年·2021-04-12 20:04

没有想到就这样就发了6.68分的SCI

更多资料可以关注微信公众号SCI狂人在这里分享一篇比较新的文章，这篇文章于2019Oct5发表在EBioMedicine上，目前EBioMedicine的最新IF为6.68，文章内容也不多，也就是我们经常提到的分析，Cox
SCI狂人团队·2021-04-12 20:51

差异分析+火山图+COX模型构建

：没有生物学重复的转录组数据怎么进行差异分析？edgeR需要的数据是reads数，可以设置BCV值，做单样本的差异分析。edgeR包可以做无重复的差异分析，不过需要认为指定一个dispersion值(设置BCV值)，这样得到的结果比较主观，不同的人就可以有不同的结果。通常如果是实验控制的好的人类数据，那么选择BCV=0.4，比较好的模式生物选择BCV=0.1。6LUAD验证6.2差异基因分析和功能
医学小白学生信·2021-04-01 20:12

R语言自适应LASSO 多项式回归、二元逻辑回归和岭回归应用分析

该算法速度快，可以利用输入矩阵x中的稀疏性，拟合线性、logistic和多项式、poisson和Cox回归模型。可以通过拟合模型进行各种预测。它还可以拟合多元线性回归。”
·2021-03-26 14:44

R语言自适应LASSO 多项式回归、二元逻辑回归和岭回归应用分析

该算法速度快，可以利用输入矩阵x中的稀疏性，拟合线性、logistic和多项式、poisson和Cox回归模型。可以通过拟合模型进行各种预测。它还可以拟合多元线性回归。”
·2021-03-25 16:06

R语言自适应LASSO 多项式回归、二元逻辑回归和岭回归应用分析

该算法速度快，可以利用输入矩阵x中的稀疏性，拟合线性、logistic和多项式、poisson和Cox回归模型。可以通过拟合模型进行各种预测。它还可以拟合多元线性回归。”
拓端研究室·2021-03-25 14:20

R语言中使用非凸惩罚函数回归(SCAD、MCP)分析前列腺数据

p=20828本文使用lasso或非凸惩罚拟合线性回归，GLM和Cox回归模型的正则化，特别是_最小_最_大凹_度_惩罚_函数_(MCP)_和光滑切片绝对偏差惩罚（SCAD），以及其他L2惩罚的选项（“
·2021-03-10 21:08

R语言中使用非凸惩罚函数回归(SCAD、MCP)分析前列腺数据

p=20828本文使用lasso或非凸惩罚拟合线性回归，GLM和Cox回归模型的正则化，特别是_最小_最_大凹_度_惩罚_函数_(MCP)_和光滑切片绝对偏差惩罚（SCAD），以及其他L2惩罚的选项（“
·2021-03-09 22:24

“误用姓名”，前哈佛教授炮轰中国学者“碰瓷”：“整件事都让人讨厌！

感到震惊并愤怒的Cox在推特上写道：“整件事都让
CSDN资讯·2021-02-21 19:49

【信号处理】小波变换的音频水印嵌入提取【Matlab 202期】

Cox等[提出了着名的基于图像全局变换的数字水印技术，该方案对整个图像作离散余弦变换（DCT），Barni等提出一种利用HVS掩蔽特性的基于DCT的水印算法，在水印嵌入阶段，对的图像进行的DCT变换，对
星斗月辉·2021-02-12 14:04

统计科学之分析遇到非正态数据该怎么办？

这一节我们来看一下，如果数据不满足正态时该怎么办，答案就是将非正态数据通过Box-Cox变换进一步转换成符合正态分布的数据。这一篇就给大家分享下Box-Cox变换的具体内容。
·2021-01-27 17:18

Cox 去世，他推动了苹果软件生态的发展

据外媒报道，编程语言Objective-C之父BradJ.Cox博士已于近日在其家中逝世，享年77岁。
·2021-01-25 14:52

Cox 去世，他推动了苹果软件生态的发展

据外媒报道，编程语言Objective-C之父BradJ.Cox博士已于近日在其家中逝世，享年77岁。
·2021-01-25 14:52

Cox去世，他推动了今天苹果的软件生态

本文转载自机器之心近日，讣告网站Legacy.com发布消息：Objective-C之父BradJ.Cox博士于2021年1月2日在自己的家中逝世，享年77岁。
程序员的店小二·2021-01-25 14:14

【信号处理】基于matlab小波变换的音频水印嵌入提取【含Matlab源码 053期】

Cox等[提出了着名的基于图像全局变换的数字水印技术，该方案对整个图像作离散余弦变换（DCT），Barni等提出一种利用HVS掩蔽特性的基于DCT的水印算法，在水印嵌入阶段，对的图像进行的DCT变换，对
紫极神光·2021-01-24 14:20

颜值够格的风险森林图

也可以自己根据表达矩阵与临床信息生成，如下：rm(list=ls())load("cox_dat.Rdata")str(dat)##'data.frame':516obs.of10variables:#
小洁忘了怎么分身·2021-01-23 18:04

手把手教你使用R语言做竞争风险模型并绘制列线图

这是我们应该优先选择竞争风险模型来做数据分析，而不是COX回归。竞争风险模型在数据挖掘中经常使用到，我们将
天桥下的卖艺者·2021-01-06 08:27

知识小结------数据分析------Bonferroni correction（邦费罗尼校正）

系列文章目录Cox比例风险回归模型（proportionalhazardsmodel）知识小结------数据分析------Fisher‘sexacttest(费希尔检测)Bonferronicorrection
闲看庭前雪·2020-12-31 12:19

知识小结------数据分析------Fisher‘s exact test(费希尔检测)

系列知识小结目录Cox比例风险回归模型（proportionalhazardsmodel）Fisher'sexacttest费希尔检测系列知识小结目录前言一、Fisher'sexacttest费希尔检测是什么
闲看庭前雪·2020-12-31 10:35
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