GRN

GRNdb：解码不同人类和小鼠条件下的基因调控网络

这是利用scenic计算并制作的数据库，可以学习并使用一下摘要由转录因子（TF）及其下游靶基因形成的基因调控网络（GRN）在基因表达调控中发挥着重要作用。
生信小鹏·2023-12-28 09:14

基因调控网络重建：利用单细胞多组学数据

Regressionmodels（回归模型）Probabilisticmodels（概率模型）Dynamicalsystems（动力系统）Deeplearningmodels（深度学习模型）bulk组学时代的GRN
生信小鹏·2023-12-28 09:43

用于单细胞基因调控网络分析（GRN）的SCENIC 工作流程

用于单细胞基因调控网络分析（GRN）的SCENIC工作流程摘要WorkflowPre-processing(Steps1–4)Networkinference(Step5)网络推理Modulegeneration
生信小鹏·2023-12-28 09:43

scenic：单细胞调控网络推理和聚类

这是GRN分析中scenic的文献，发表在2017年的naturemethods（SCENIC:single-cellregulatorynetworkinferenceandclustering），学习了解其原理
生信小鹏·2023-12-28 09:42

GRNdb：单细胞水平的基因调控网络数据库

转录因子及其下游靶基因形成的基因调控网络（GeneRegulatoryNetwork,GRN）在基因表达调控中起着重要作用。此外，GRNs可以在不同的条件下动态变化，这对于理解疾病发病机制至关重要。
尐尐呅·2023-11-29 21:03

计算机类推荐书籍

本人水平很菜，但是看见兄台写的，认为很是不错http://blog.sina.com.cn/s/blog_57e4fc6501000grn.html目录1前言2Mathematics(数学)3DataStructures
chenmaotuo1022·2023-11-18 18:39

pyscenic的结果不可重复

一、pyscenic的结果不可重复最近在运行pyscenic的结果的时候发现了两次相同参数相同数据的结果存在不一致，回溯发现scenic的第一步GRN的结果已经出现了差异，转录因子和目标基因之间的importance
纷纷不可诉·2023-10-23 15:50

目标检测算法改进系列之Backbone替换为ConvNextV2

受掩码自编码机制的启发，本文在ConvNeXt的架构基础上延伸出了一个完全卷积掩码自编码器框架——ConvNeXtV2，同时作者设计了一个全新的全局响应归一化(GlobalResponseNormalization,GRN
我悟了-·2023-09-28 19:00

基于scRNA-seq的GRN分析三阴性乳腺癌的肿瘤异质性

此外，基于scRNA-seq数据构建的GRN已经证明了对关键调控因子研究的重要性。作者使用scRNA-seq对TNBC患者的GRN进行了全面分析。从scRNA-seq数据鉴定出545个恶性细胞。
tzc_fly·2023-09-14 16:24

10X单细胞（10X空间转录组）基因调控网络分析之Pando

Pando利用多模式单细胞测量，使用灵活的建模框架来推断基因调控网络(GRN)。通过模拟TF结合位点对与靶基因表达之间的关系，Pando同时推断每个转录因子的基因模
单细胞空间交响乐·2023-07-22 01:26

Mac遇到已损坏文件的解决脚本

/bin/bashclearRED='\033[0;31m'GRN='\033[0;32m'BLU='\033[0;34m'NC='\033[0m'echo""echo-e"修复补丁${RED}by四维虫虫
四维虫虫·2023-06-24 07:19

改进YOLO系列：改进YOLOv8，结合ConvNeXt V2骨干网络！使用MAE共同设计和扩展ConvNet

使用MAE共同设计和扩展ConvNet一、论文讲解1.全卷积掩码自动编码器（FCMAE）2.全局响应归一化（GRN）层二、YOLOv8更改骨干1.yaml文件2.ConvNeXtV2代码3.注册模块4.
一休哥※·2023-04-17 05:35

2021-11-07

前沿分子生物学机制撰文：珍奇IF：28.82推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本研究使用单细胞转录组和染色质可及性概况来定义作为恶性浆细胞细胞状态转变基础的转录和顺式调节改变；在不同细胞状态的建立过程中推断基因调控网络(GRN
图灵基因·2023-04-02 07:17

以一篇文章为例，总结单细胞文章分析框架

上一篇我们分享的《一文了解单细胞基因调控网络（GRN）》中有提过:scRNA-seq数据的表达矩阵之后大多数后续分析的重点是:确定组织或癌症中细胞亚群的类型或状态，或研究动态变化过程，例如细胞分化、细胞周期或刺激反应
seqyuan·2023-03-29 22:30

视觉模型 ConvNeXt V2，结合纯卷积与MAE

为了更好地结合ConvNeXt和MAE，ConvNeXtV2提出了一个改进的网络架构，将全局响应归一化(GRN)层添加到ConvNeXt架
·2023-01-31 20:43

视觉模型 ConvNeXt V2，结合纯卷积与MAE

为了更好地结合ConvNeXt和MAE，ConvNeXtV2提出了一个改进的网络架构，将全局响应归一化(GRN)层添加到ConvNeXt架
·2023-01-20 12:37

基础理论|图论基础

疫情期间，回头看了看，发现徒有框架远远不够，下定决心将GNN、GCN、GRN、GAN等相关的鼻祖论文都找出来认真拜读，看看大佬的思路，收获颇丰。
脑电与图网络研究僧·2022-12-01 16:36

GRN: Generative Rerank Network for Context-wise Recommendation

总结generator:GRU，policygradient优化，selfreward+differentialreward，从粗排到精排evaluator:bi-lstm+self-attention，交叉熵损失，对finallist做rank细节generator把gru当作一个policy，reward有2部分：selfreward+differentialreward。selfreward
KpLn_HJL·2022-11-21 02:52

面向任务的无人集群系统自主协同方法（基因调控网络, GRN）

前言本文研究了在障碍物固定和障碍物持续移动的条件下，群体机器人对单个或多个移动目标的围捕问题。为此，本文提出了基于合作的基因调控网络的群体机器人围捕模式，该模式不仅依赖于目标的信息，同时也考虑了周围因素的影响。实验结果表明，该模式能够很好地解决躲避固定或持续移动障碍物、追踪围捕移动目标等问题，拥有较优越的性能，对未来研究在各种复杂环境下的群体机器人目标搜索及围捕打下了良好的基础。但是需要指出的是，
代码缝合怪·2022-11-21 00:09

图神经网络入门（三）GAT图注意力网络

往期文章图神经网络入门（一）GCN图卷积网络图神经网络入门（二）GRN图循环网络注意机制已成功用于许多基于序列的任务，例如机器翻译，机器阅读等等。与GCN平等对待节点的所有邻居相比，注意力
weixin_45519842·2022-11-20 05:09

MariaDB10.2.6启用Mroonga存储引擎用于全文索引

存储引擎1）加载mroonga插件MariaDB[(none)]>INSTALLSONAME'ha_mroonga';MariaDB[(none)]>CREATEFUNCTIONlast_insert_grn_idRETURNSINTE
?Briella·2020-08-18 04:08

51单片机静态数码管显示

1、设计要求用一个共阳极数码管循环显示数值“0~F”，显示变换时间为1s，由P1口输出要显示的数值2、硬件设计使用proteusIsis仿真，选择元器件，AT89C51、7SEG-COM-AN-GRN、
狂狼书生·2020-08-07 15:07

linux服务器巡检脚本

/bin/bashBLK=''RED=''YEL=''BLU=''CYN=''GRN=''RES=''BLD
你似北风·2020-07-08 22:55

Windows server2016安装.Net Framework 3.5 报错失败的解决办法

通过离线NetFx3.cab文件进行安装，首先下载好文件：（如下，百度云盘，如果失效，请留言）链接:链接:https://pan.baidu.com/s/108rr1uPzm9gRN2UZBXJCgw提取码
洛城兴·2020-06-29 00:17

自然语言处理常用RNN、LSTM、GRU举例详解，通俗易懂

之前疫情网民情绪识别的模型用到了LSTM，最近面试被问到具体细节，感觉被拎出来羞辱，经过认（cha）真（yue）思（wen）考（xian），总结了一下RNN、LSTM、GRN的一些知识。
Pumpkin9913·2020-06-27 16:21

R包SCENIC：分析流程

GRN：基因调控网络分为四步进行GRN分析1.GENIE3/GRNBoost：基于共表达情况鉴定每个TF的潜在靶点;过滤表达矩阵并运行R包GENIE3/GRNBoost；将得到的靶点格式化为共表达模块；
阿糖胞苷_SYSU·2020-06-22 04:53

A Comprehensive Survey on Graph Neural Networks（图神经网络综述）

目录摘要1.引言2.定义3.分类和框架A.图神经网络（GNN）的分类B.框架4.循环图神经网络（GRN）5.卷积图神经网络A.基于频谱的ConvGNNsB.基于空间的CGNNC.图池化模型D.理论方面的讨论
灬Miracle丶·2020-06-22 04:07

[Ethereum] Gas Station Network (GSN) eip-1613 与 Gas Relay Network (GRN) eip-1077

在Ethereumdapp中，任何涉及状态改动的交易都需要消耗Gas，这限制了很多没有钱包或者ETH的用户对dapp的采用。理念让非以太用户能够访问智能合约(如dapps)，允许合约接受“接听来电”，即为来电付费。让合约在可公开访问的渠道上“监听”(例如webURL)。鼓励节点运行“加油站”来促进这一点。不需要网络更改，只需最小的契约更改。概述目前，与dapps通信需要支付ETH的Gas费用，这限
ercom·2020-03-20 16:00

python django结合七牛云存储图片

image.pngQINIU_ACCESS_KEY='Oo9PxPHACtVScG-YgAHiM9htuRd1LLOxZhdpZBk'#个人中心的KEYQINIU_SECRET_KEY='744J6A85OsW0a9bu_gRN4vR5BNX1HyJbGVcZuby
小梨的十三·2019-05-25 11:00

MariaDB10.2.6启用Mroonga存储引擎用于全文索引

存储引擎1）加载mroonga插件MariaDB[(none)]>INSTALLSONAME'ha_mroonga';MariaDB[(none)]>CREATEFUNCTIONlast_insert_grn_idRETURNSINTE
jinyan2049·2017-06-27 11:02

嵌入式Qt学习（1）--窗口全屏显示

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Tankng·2016-01-16 15:00

深度学习与自然语言处理之五：从RNN到LSTM

.*/                               author: 张俊林     大纲如下：1.RNN2.LSTM3.GRN4.AttentionModel5.应用6.探讨与思考扫一扫关注微信号
malefactor·2015-12-30 19:00

PHP CREATE PNG ALPHA

class generatePNG { var $red = 0; var $grn = 0; var $blu = 0; function draw($name, $red=0, $grn=0, $
·2015-10-31 10:05

Go Web开发之Revel - app.conf

下面是一个例子文件： app.name=chat app.secret=pJLzyoiDe17L36mytqC912j81PfTiolHm1veQK6Grn1En3YFdB5lvEHVTwFEaWvj
·2015-10-31 09:21

Go Web开发之Revel - app.conf

下面是一个例子文件： app.name=chat app.secret=pJLzyoiDe17L36mytqC912j81PfTiolHm1veQK6Grn1En3YFdB5lvEHVTwFEaWvj
·2015-10-30 13:14

基于struts2及poi的导出功能

前端页面： <input type="button" id="btnExp" class="grn_btn_l" value="
wangw5512·2015-01-07 15:00

shell高亮显示

/bin/bashBLK='\E[1;30m' RED='\E[1;31m' GRN='\E[1;32m' YEL='\E[1;33m' BLU='\E[1;34m' MAG='\E[1;35m' CYN
a3865571·2014-12-16 16:28

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a3865571·2014-12-16 16:28

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/bin/bashBLK='\E[1;30m' RED='\E[1;31m' GRN='\E[1;32m' YEL='\E[1;33m' BLU='\E[1;34m' MAG='\E[1;35m' CYN
a3865571·2014-12-16 16:28

Go Revel - app.conf

示例： app.name=chat app.secret=pJLzyoiDe17L36mytqC912j81PfTiolHm1veQK6Grn1En3YFdB5lvEHVTwFEaWvj http.addr
·2013-08-20 23:00

单目录内容批量下载

/bin/bash#下载#author：falconhero#qq:40594324RED='\E[1;31m'GRN='\E[1;32m'YEL='\E[1;33m'MAG='\E[1;35m'RES
falconhero·2012-03-03 18:56
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