r语言主成分分析

survey和surveyCV：如何用R语言进行复杂抽样设计、权重计算和10折交叉验证？

一、引言在实际调查和研究中，我们往往面临着样本选择的复杂性。复杂抽样设计能够更好地反映真实情况，提高数据的代表性和可靠性。例如，多阶段抽样可以有效地解决大规模调查的问题，整群抽样能够在保证样本的随机性的同时减少资源消耗。由于复杂抽样设计中不同样本的选取概率不一致，为了确保结果的准确性和代表性，需要对样本进行加权处理。通过权重计算，我们可以将不同样本的贡献考虑进去，使得结果更符合总体情况。例如，在人
笑不语·2024-01-16 14:49

答读者问~使用R语言利用SSR数据构建进化树

今天公众号的一位读者留言问有了SSR的数据，如何画树状图？SSR的数据我也是第一次接触，我看了一下他发给我的数据，是csv格式，每行是一个样本，每列是一个位点。位点的取值是0，和1。这种格式好像叫做二进制的格式。就是下面这种image.png第一列是样本名称，后面每一列是一个位点。我搜索了一下相关教程，找到了一个。需要借助ape这个包，如果是第一次使用的话需要先安装install.packages
小明的数据分析笔记本·2024-01-16 14:42

R语言：Purrr包探索

看统计书，有一道题问n人之中至少有两人生日相同的概率。感觉这道题非常适合用来练习purrr包的基本用法，于是就试了下。对于这道题，可以先算出所有人的生日都不相同的概率，然后再用1减去这个概率。当人数为2人时，概率是：1-(365/365)*(364/365)##[1]0.002739726当人数为3人时，概率是：1-(365/365)*(364/365)*(363/365)##[1]0.00820
孟祥良·2024-01-16 14:15

统计学-R语言-4.7

文章目录前言描述水平的统计量平均数分位数中位数四分位数众数描述差异的统计量（数据离散程度）极差四分位差方差和标准差变异系数标准分数描述分布形状的统计量偏度与偏度系数峰度与峰度系数数据的综合描述综合描述的R函数综合描述的实例总结前言本篇文章将介绍数据的描述统计量。描述水平的统计量平均数平均数也称为均值，常用的统计量之一消除了观测值的随机波动易受极端值的影响根据总体数据计算的，称为总体平均数，记为；
柔雾·2024-01-16 11:32

R语言【paleobioDB】——pbdb_scale()：通过ID选择，返回一个时间刻度的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_scale(id,...)Arguments参数【id】：时间年代段的标识符，即ID。此参数为必需参数
ALittleHigh·2024-01-16 10:46

R语言【paleobioDB】——pbdb_scales()：返回多个时间刻度的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_scales(...)Arguments参数【...】：可通过API调用的参数。所有可用参数详见PBD
ALittleHigh·2024-01-16 10:13

R语言【paleobioDB】——pbdb_strata()：通过名称、等级和/或 地理位置选择，返回地质地层的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_strata(...)Arguments参数【...】：可通过API调用的参数。所有可用参数详见PBD
ALittleHigh·2024-01-16 09:07

R语言【paleobioDB】——pbdb_richness()：绘制指定类群的数量丰度

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_richness(data,rank,res,temporal_extent,colour,bord,
ALittleHigh·2024-01-16 09:01

Day4 —刘强

初识R语言What'sR?R是一种编程语言，提供了统计计算和绘图的环境。可调用许多函数，从而提供强大的数据处理和可视化功能。R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。
刘强_9e14·2024-01-16 07:16

统计学-R语言-4.6

文章目录前言列联表条形图及其变种---单式条形图条形图及其变种---帕累托图条形图及其变种---复式条形图条形图及其变种---脊形图条形图及其变种---马赛克图饼图及其变种---饼图饼图及其变种---扇形图直方图茎叶图箱线图小提琴图气泡图总结前言本篇文章是对数据可视化的补充文章。列联表跳转至该篇博客跳转至该篇博客在上面两篇博客中，对单变量和双变量的列联表进行了实例展示，下面是对三维列联表进行实例。
柔雾·2024-01-16 06:28

R语言【paleobioDB】——pbdb_subtaxa()：统计指定类群下的子类群数量

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_subtaxa(data,do.plot,col)Arguments参数【data】：输入的数据，数据
ALittleHigh·2024-01-16 03:48

R语言【paleobioDB】——pbdb_taxa()：获得多个类群名的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_taxa(...)Arguments参数【...】：可通过API调用的参数。所有可用参数详见PBDBD
ALittleHigh·2024-01-16 03:18

R语言【paleobioDB】——pbdb_taxa_auto()：根据部分名称或前缀，获得多个类群名的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_taxa_auto(...)Arguments参数【...】：可通过API调用的参数。所有可用参数详见
ALittleHigh·2024-01-16 03:18

R语言【paleobioDB】——pbdb_taxon()：通过名称或标识符，获得一个类群名的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_taxon(...)Arguments参数【...】：可通过API调用的参数。所有可用参数详见PBDB
ALittleHigh·2024-01-16 03:14

R语言实验1 ：数据的描述性分析

3.熟悉R语言等语言的集成开发环境。二、实验分析与内容完成教材P37第6题。题目如下：（1）(1)分别计算数学成绩和统计学成绩的均值、方差、标准差、极差、变异系数、偏度和峰度。
Blossom i·2024-01-16 02:40

R语言ggplot2漂亮的热图和配色 简单小例子

偶然间在github上发现的这个链接，示例数据和代码都有，很好的R语言学习素材链接是https://github.com/blmoore/blogR，主要内容有image.png光看这个可能有些枯燥，我们来看结果图
小明的数据分析笔记本·2024-01-16 01:44

R语言ggplot2作图配色相关R包

R语言ggplot2作图的时候配色如果不知道如何选择，可以参考如下链接https://r-charts.com/color-palettes/image.pngimage.pngimage.png这里分别提供了连续型数据和离散型数据的配色
小明的数据分析笔记本·2024-01-15 21:24

Protocol Buffers(proto3) 指南

这个指南描述了如何使用protocolbuffer语言来组织你的protocolbuffer数据，包括.proto文件语法和如何从你的.proto文件生成数据访问类。
rubys007·2024-01-15 19:39

2020-12-24(R study note)

转载：01.介绍r语言及rstudio编辑器安装r及rstudio打开rstudio编辑器：4块1.新建脚本，markdown，写source代码，点任何地方会进行下一步。
tongyuxianglian·2024-01-15 08:19

FigDraw 2. SCI 文章绘图必备 R 语言基础

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你70篇原创内容-->公众号关注公众号，桓峰基因，每天更新不停歇
90066456ace6·2024-01-15 07:04

COMP9321代做、代写dataframe、Python程序设计调试、代写Python语言代写R语言程序|代做数据库SQL

Resources/Assignments(/COMP9321/20T1/resources/41975)/Week3(/COMP9321/20T1/resources/41976)/Assignment-1Assignment-1TheassignmentdatahasbeenextractedfromaMoviedatasetonKaggle(https://www.kaggle.com/ro
houshizi·2024-01-15 07:46

统计学-R语言-4.2

文章目录前言单变量数据的描述分析分类型数据频数表条形图饼图数值型数据数值型数据数据的集中趋势--均值数据的集中趋势--众数离散程度离散程度--极差离散程度--四分位数极差离散程度--方差离散程度--加权方差离散程度--标准差离散程度--变异系数数据的形状数据的形状--偏度数据的形状--峰度练习前言本篇介绍下数据的描述性分析。单变量数据的描述分析分类型数据统计学上把取值范围是有限个值或是一个数列构成
柔雾·2024-01-15 06:17

统计学-R语言-4.3

文章目录前言直方图茎叶图箱线图练习前言本篇介绍的是数值型数据怎么进行数据可视化，本篇介绍的有直方图、茎叶图、箱线图。直方图直方图（Histogram）用于描述连续型变量的频数分布，实际应用中常用于考察变量的分布是否对称；是否服从某种分布类型，如正态分布直方图以矩形的面积表示各组段的频数或频率，各矩形的面积总和为总频数（或等于1，此时是按照频率来计算的）在R软件里用函数是hist()来作直方图，把p
柔雾·2024-01-15 06:17

统计学-R语言-4.5

文章目录前言多变量数据多维列联表复式条形图并列箱线图R语言中取整运算主要包括以下五种：点带图多变量散点图重叠散点图矩阵式散点图练习前言本篇文章将继续对数据的类型做介绍，本片也是最后一个介绍数据的。
柔雾·2024-01-15 06:44

统计学-R语言-4.4

文章目录前言双变量数据分类型数据对分类型数据--二维表分类对分类--复式条形图分类对数值--并列箱线图数值型数据对数值型数据散点图相关系数练习前言上一篇文章介绍的是单变量数据，本篇将介绍双变量数据。双变量数据描述分类数据对分类数据的描述方法：二维表、复式条形图。描述分类型数据对数值型数据的描述方法：箱线图。描述数值型数据对数值型数据的描述方法：散点图、相关系数。分类型数据对分类型数据–二维表二维表
柔雾·2024-01-15 06:43

第一部分 ：第一章：R语言介绍

参考书籍：《R语言实战》RobertI.Kabacoff高涛，肖楠，陈钢image.png主要内容：R的安装、熟悉R语言、运行R程序1.1为何要使用R？
催催莎·2024-01-14 19:57

Windos系统下安装R以及R studio

下载安装R语言先去https://cran.r-project.org/bin/windows/base/;去下载DownloadR3.5.1forWindows(62megabytes,32/64bit
陈佶1·2024-01-14 15:51

浅谈学习

最近晚上的自由学习时间，我重拾了一年没有学的R语言，重新翻看曾经的学习笔记（记录在我的博客），短短的一年时间，竟然发现已经有几千的浏览量，甚至有许多朋友在下面评论及提问，还私信我许多问题。
大雄always·2024-01-14 13:11

【机器学习与R语言】7-回归树和模型树

1.理解回归树和模型树决策树用于数值预测：回归树：基于到达叶节点的案例的平均值做出预测，没有使用线性回归的方法。模型树：在每个叶节点，根据到达该节点的案例建立多元线性回归模型。因此叶节点数目越多，一颗模型树越大，比同等回归树更难理解，但模型可能更精确。将回归加入到决策树：image.png分类决策树中，一致性（均匀性）由熵值来度量；数值决策树，则通过统计量（如方差、标准差或平均绝对偏差等）来度量。
生物信息与育种·2024-01-14 10:18

Unity游戏图形学 Shader结构

shader结构shader语言openGL：SLG跨平台=>GLSL：openGLshaderlaugugeDX：微软开发，性能很好，但是不能跨平台=>HLSL：highlevelshaderlanguageCG
Msir_Modern·2024-01-14 09:22

R包-VennDiagram韦恩图

R语言中有几个包能够较好的完成这份工作。如VennDiagram、Venn、UpSetR包等，也有一些在线画韦恩图网站。
新欣enjoy·2024-01-14 08:07

[ML]机器学习_PCA主成分分析

主成分分析详解一主成分分析详解二主成分分析详解三目录一、降低特征数量二、主成分分析算法(PCA)1、概念2、举例说明三、代码实现一、降低特征数量主成分分析(PCA)是一种算法，可以获取大量特征的数据，并将特征数量减少到两三个特征
IAz-·2024-01-14 05:20

黄丽红日精进593/596

.…5.发励志giwin6.日精进7.研究生统计课本（+*r语言学习）
做自己小太阳·2024-01-14 04:51

spark入门教程（3）--Spark 核心API开发

Spark综合了前人分布式数据处理架构和语言的优缺点，使用简洁、一致的函数式语言Scala作为主要开发语言，同时为了方便更多语言背景的人使用，还支持Java、Python和R语言。
xwc35047·2024-01-14 04:45

学习小组Day6笔记-学习R包

生信必学R语言——含有丰富图表和Biocductor上的生信分析R包。每个包都解决生信的一个流程问题。
小路多虫·2024-01-14 03:37

R语言实践——U.Taxonstand标准化动植物科学名

U.Taxonstand标准化动植物科学名简介准备工作支持包的安装：openxlsx、plyr、magrittrU.Taxonstand安装方法1：GitHub方法2：devtools测试参照github文档测试1.加载U.Taxonstand2.加载示例数据库3.待查科学名以向量字符输入（charactervector)4.nameMatch函数使用5.结果解读nameMatch函数详解1介绍2
ALittleHigh·2024-01-14 01:26

R语言【文章复现】——集成式地绘制高分辨率的多样性分布图，对方法的检验和优化，以及处理思路的思考

参考文献本文对一篇2022年发表在NewPhytologist的绘图方法文章中的技术路线进行复现。Anintegratedhigh-resolutionmappingshowscongruentbiodiversitypatternsofFagalesandPinalesSummary文中，作者针对在全球尺度上绘制物种分布图提出了一种全新的方法。该方法整合了多边形绘图（polygonmapping
ALittleHigh·2024-01-14 01:25

R语言学习之选定目标行列

搜寻位置或逻辑值grep("color",irisSpecies)本行代码表示选择在iris数据集中，Species列包含”color“的所有行信息iris[1,]iris[grepl("color",iris$Species),]取字母，负号表示不要的资料letters[c(1,3,5)]letters[c(-1,-3,-5)]选择列使用，选择行iris$Speciessubset(iris,S
佐博伊森·2024-01-13 16:49

学习小组Day4笔记--邓陶

话不多说，先放上今天的主要学习内容：Day4学习内容.png1、安装R和Rstudio首先确认电脑用户名为英文接着下载R和Rstudio，具体操作参考果子学生信给自己一个全新的R语言环境2、初步了解R和
邓陶·2024-01-13 15:34

R语言【paleobioDB】——pbdb_intervals()：通过参数选择，返回多个地层年代段的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_interval(id,...)Arguments参数【...】：其余可通过API调用的参数。所有可用
ALittleHigh·2024-01-13 15:15

R语言【paleobioDB】——pbdb_occurrences()：从PBDB获取多个化石记录号的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_occurrences(...)Arguments参数【...】：其余可通过API调用的参数。所有可用
ALittleHigh·2024-01-13 15:15

R语言【paleobioDB】——pbdb_interval()：通过ID选择，返回一个地层年代段的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_interval(id,...)Arguments参数【id】：地层年代段的标识符，即ID。此参数为必
ALittleHigh·2024-01-13 15:15

R语言【paleobioDB】——pbdb_collection()：从PBDB获取单个采集号的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_collection(id,...)Arguments参数【id】：采集号的标识符，即ID。此参数为必
ALittleHigh·2024-01-13 15:12

R语言【paleobioDB】——pbdb_map()：根据化石记录绘制地图

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_map(data,col.int="white",pch=19,col.ocean="black",m
ALittleHigh·2024-01-13 15:12

在线作图丨做一张叠加mantel test的相关性热图

下边这张图摘自2015年的Science（暂且叫他Manteltest和相关性热图的组合图吧），这张图在各大论坛都有R语言的教程，今天小编教大家如何不使用R语言，分分钟在线做出这样的高水平图片。
维凡生物·2024-01-13 14:49

机器学习降维技术全面对比评析

线性技术主成分分析（PCA）线性投影：PCA执行线性投影以捕获数据中的最大方差。计算效率：高效且广泛使用，但假设线性关系。线性判别分析(LDA)有监督的降维：LDA结合了类别信息来找到最好地
冷冻工厂·2024-01-13 10:52

Day4-郭妞2020.04.27-R语言基础

1.安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面）2.粗略了解R语言是什么，干什么的，认识Rstudio的工作界面3.学会外观设置和基本操作准备工作1、查看电脑用户名是中文还是英文先在电脑桌面随便打开一个文件夹
郭妞儿·2024-01-13 09:28

R语言【paleobioDB】——pbdb_occurrence()：从PBDB获取单个化石记录号的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_occurrence(id,...)Arguments参数【id】：化石记录号的标识符，即ID。此参数
ALittleHigh·2024-01-13 09:49

R语言【paleobioDB】——pbdb_collections()：通过参数选择，返回多个采集号的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_collections(...)Arguments参数【...】：可通过API调用的参数。所有可用参数
ALittleHigh·2024-01-13 09:19

R语言【paleobioDB】——pbdb_collections_geo()：从PBDB获取根据地理位置信息筛选的采集号的基本信息

PackagepaleobioDBversion0.7.0paleobioDB包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDBv1API。可以选择在Indexof/src/contrib/Archive/paleobioDB(r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。Usagepbdb_collections_geo(...)Arguments参数【...】：可通过API调用的参数。所有
ALittleHigh·2024-01-13 09:19
上一页 8 9 10 11 12 13 14 15 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他