r语言逻辑回归

R语言作图——Line plot with colored background

Step1.绘图数据的准备首先还是要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式excel中保存成csv格式。
生信了·2023-09-30 08:04

跟着Science Advances学画图：R语言ggplot2画柱形图如何让屁股朝右

AAA今天推文模仿的图片是来自于论文Landscapesofbacterialandmetabolicsignaturesandtheirinteractioninmajordepressivedisorders。有读者在公众号的后台留言问论文中Figure2中的A图如何实现image.png今天的推文就介绍一下，因为A图的数据较多，我们来模仿B图，过程其实是一样的image.png左边两幅图是柱
小明的数据分析笔记本·2023-09-30 06:19

R语言：下载和使用包

R语言：下载和使用包R语言是一种功能强大的统计分析和数据可视化工具，通过使用R包（也称为库），用户可以扩展R语言的功能。本文将介绍如何下载和使用R包。
雨中徜徉的思绪漫溢·2023-09-30 04:27

如何开始着手一篇Meta分析 | Meta分析的流程及方法

R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制，可以对数据直接进行分析和显示，命令格式简单、结果可读性强，包含众多针对Meta分析软件包，是进行Meta整合分析及评价的有效平台。Meta分
Teacher.chenchong·2023-09-30 02:08

使用R语言筛选包含特定字符串的行

使用R语言筛选包含特定字符串的行在数据分析和处理中，经常需要根据数据集中某一列的内容筛选出符合特定条件的行。如果我们想要筛选出包含特定字符串的行，R语言提供了多种方法来实现这一操作。
PixelCoder·2023-09-30 01:24

R语言实现随机生存森林（3）

常见问题解答1、计算C指数1-Errorrate，或者rsf.err%dcurves::as_tibble()library(ggplot2)ggplot(d,aes(x=threshold,y=net_benefit,color=variable))+stat_smooth(method="loess",se=FALSE,formula="y~x",span=0.2)+coord_cartesi
weixin_49320263·2023-09-30 00:36

vscode 配置 R 语言

前提条件：1、本机安装R语言程序，并配好变量等，终端中输入R回车无报错，例如输入sum(1:10)，输出结果进行552、vscode中安装好R扩展，jupyter扩展（例如，能正常使用python的ipynb
bailixuance·2023-09-29 23:52

R＆RStudio的安装及配置

所以，Rstudio提供了一个人性化的可视界面来操作R语言。在软件里可以创建完整的项目，编写脚本，查看变量值，获取绘图的结果等等。1.R的安装（1）下载下载地址
涉川.·2023-09-29 19:07

rstudio安装后如何打开_R语言IDE之RStudio的安装及使用入门

RStudio功能特色RStudio支持语法高亮、代码完成和智能缩进直接从源代码编辑器执行R代码快速跳转到函数定义RStudio集成R帮助和文档使用项目轻松管理多个工作目录工作区浏览器和数据查看器交互式调试器快速诊断和修复错误RStudio广泛的软件包开发工具用Sweave和RMarkdown创作RStudio集成支持Git和Subversion支持创作HTML、PDF、Word文档和幻灯片RSt
weixin_39912566·2023-09-29 19:37

R | R及Rstudio安装、运行环境变量及RStudio配置

R|R及Rstudio安装、运行环境变量及RStudio配置一、介绍1.1R介绍1.2RStudio介绍二、R安装2.1演示电脑系统2.2R下载2.3R安装2.4R语言运行环境设置（环境变量）2.4.1
跳动的喵尾巴·2023-09-29 19:05

R语言报错Error:n() should onlybe called in a data context

提示可能是有两个函数互相冲突，通过制定包加函数的办法可以解决。解决办法见下图：或者关闭之前加载的plyr包detach(“package:plyr”）参考链接:https://www.jianshu.com/p/491b6eca2d9a
翻山越玲·2023-09-29 19:43

解密人工智能：线性回归 | 逻辑回归 | SVM

3、逻辑回归算法3.1什么是逻辑函数?3.2逻辑回归可以用于多类分类吗？3.3如何解释逻辑回归中的系数？4、支持向量机（SVM）算法4.1优点4.2缺点5、结语1、机器学习算法简介机器学习算法是一种基
春人.·2023-09-29 17:05

生信学习小组-Day5 - 三三

关键词R语言，数据类型，向量，数据框今日笔记向量来自生信星球1.赋值命令x数据框1.读取本地数据read.csv()read.csv()read.table()read.table()2.设置行名和列名
三三鹅_·2023-09-29 16:21

R语言用标准最小二乘OLS，广义相加模型GAM ，样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分类...

p=21379本文我们对逻辑回归和样条曲线进行介绍（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。logistic回归基于以下假设：给定协变量x，Y具有伯努利分布，目的是估计参数β。
拓端研究室TRL·2023-09-29 12:44

跟着Nature Genetics学画图：R语言ggplot2画曼哈顿图展示XP-CLR score

今天推文重复的图来自于论文Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png今天试着重复的图片对应着的是论文中的Figure3a,，曼哈顿图展示的是XP-CLRscore，这个分支具体是什么含义还得仔细学习，群体基因组类的论文通常都有这个数据
小明的数据分析笔记本·2023-09-29 10:27

R语言进行孟德尔随机化+meta分析（2）----基于R和stata

目前不少文章用到了孟德尔随机化+meta分析，在上一章咱们简单介绍了一下meta分析的基础知识。咱们今天来介绍一篇11分文章，由文章看看孟德尔随机化+meta分析如何进行，文章的题目是：Appraisingthecausalroleofsmokinginmultiplediseases:Asystematicreviewandmeta-analysisofMendelianrandomizatio
天桥下的卖艺者·2023-09-29 08:36

linux服务器安装R语言及Rstudio server

在linux服务器上使用R语言及Rstudioservercat/etc/redhat-release:查看服务器系统版本R程序包获取查看最新版本的下载链接，使用wget获取wgethttps://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn
Seurat_Satija·2023-09-29 07:04

R语言批量有规律改变量名

#把data数据集的18个变量名统一改为x1,x2....x18names(data)<-paste('x',1:18,sep='')
绿菡萏·2023-09-29 04:52

2020-05-30R语言 特殊函数

1、统计函数函数描述mean()平均数median()中位数sd()标准差var()方差mad()绝对中位差，即原数据减去中位数后得到的新数据的绝对值的中位数quantile(x,probs)求分位数，x为待求分位数的数值型向量，probs为一个由[0,1]之间的概率值组成的数值向量，eg:a均方根，均方差：均方根：2、数学函数函数描述abs()绝对值sqrt()平方根ceiling()向上取整f
Seurat_·2023-09-29 02:59

R语言 数据框：创建、操作和分析数据框

R语言数据框：创建、操作和分析数据框数据框（data.frame）是R语言中最常用的数据结构之一，它是一种二维的表格型数据对象，由行和列组成。
CyberwCoder·2023-09-29 01:19

R语言中将字符串转换为日期类型的方法

R语言中将字符串转换为日期类型的方法日期数据在数据处理和分析中非常重要。在R语言中，我们可以使用不同的函数和包来将字符串转换为日期类型。
CyberwCoder·2023-09-29 01:49

跟着Nature Ecology&Evolution学数据分析：R语言ggplot2作图展示方差分解的结果

关于方差分解的内容之前已经分享过两篇推文之前的推文分享过一篇内容是重复了一篇NatureEcology&Evolution期刊论文的方差分解过程，虽然对运行过程还是不太理解，但是能得到结果。今天的推文我们利用得到的结果复现一下论文中的Figure4aimage.png前面的计算过程可以参考推文现在是假设我们已经拿到了计算结果，需要作图，组图用到的示例数据如下image.png（这里不再提供示例数据
小明的数据分析笔记本·2023-09-29 01:08

R语言中的数据重塑

文章目录介绍reshape2::melt()的用法实例reshape2::dcast()的用法实例tidyr::gather()的用法tidyr::spread()的用法介绍tidyverse系列包中的函数操作都是针对简洁数据框进行的，对于不是简洁的数据，实现需要进行数据重塑。数据重塑主要包括长宽表的转换、拆分/合并列、方形化。长宽表转化最初使用的是reshape2包的melt()和cast()函
zoujiahui_2018·2023-09-29 00:17

RNA 21. SCI 文章中单基因富集分析

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你88篇原创内容公众号今天就来剖析一下单基因到底怎么做
桓峰基因·2023-09-28 23:10

SCS【1】今天开启单细胞之旅，述说单细胞测序的前世今生

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你123篇原创内容-->公众号今天开启单细胞之旅，单细胞其实我也算接触较早的项目
90066456ace6·2023-09-28 20:33

逻辑回归

逻辑回归说的是数据的分类，估计的是一个离散值线性回归用来估计某个连续值，如果用线性回归来归类，预测值是0.10.2而不是1和0。
Bounty_Hunter·2023-09-28 19:33

逻辑回归和线性回归的异同点

逻辑回归和线性回归的异同点如果你光说名词相近，那面试官就要打你了。不同点逻辑回归与线性回归最大的区别，即逻辑回归中的因变量为离散的，而线性回归中的因变量是连续的。
GhostintheCode·2023-09-28 17:01

R语言随机波动模型SV：马尔可夫蒙特卡罗法MCMC、正则化广义矩估计和准最大似然估计上证指数收益时间序列...

全文链接：http://tecdat.cn/?p=31162最近我们被客户要求撰写关于SV模型的研究报告，包括一些图形和统计输出（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频本文做SV模型，选取马尔可夫蒙特卡罗法(MCMC)、正则化广义矩估计法和准最大似然估计法估计。模拟SV模型的估计方法：sim<-svsim(1000,mu=-9,phi=0.97,sigma=0.15)print(sim)
拓端研究室TRL·2023-09-28 13:25

如何开始着手一篇Meta分析 | Meta分析的流程及方法

R语言拥有完整有效的数据处理、统计分析与保存机制，可以对数据直接进行分析和显示，命令格式简单、结果可读性强，包含众多针对Meta分析软件包，是进行Meta整合分析及评价的有效平台。Meta分
asyxchenchong888·2023-09-28 09:08

R语言分析：如何轻松地把数据分为三、四、五等份？

有网友问了，我如何对连续型资料进行分组，常见的有按照中位数分组、四分位数分组，甚至分为5组。这个问题其实很简单的了。用两个函数，一个是quantile函数，另外一个是cut函数1.quantile()函数的应用该函数目的是获得分组界值比如说，求某个百分位比data<-c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,5,6,7,43,9,4,12,46,22,0,14,15,3,5,7,9,4,22)
weixin_44693403·2023-09-28 03:02

限制性立方样条图还不会画？ RCS曲线，现在可以快速搞定了（附教程）

国内学者已经整出3个R语言包，简单暴力美现在我希望搞出一个网页版，快速绘制RCS曲线，本来我想把国内几种方法全部都呈现出来，不过实在精力有点限制，先画一种吧，希望下个
weixin_44693403·2023-09-28 03:31

逻辑回归（Logistic回归又名对数几率回归）原理及python代码实现

逻辑回归的本质还是线性回归，母体函数是线性回归函数，只不过将结果值代入Sigmoid函数转换为0到1之间的数
南山十一少·2023-09-28 00:26

逻辑回归【保姆级注释Python实现】

1.引入头文件importpandasaspdimportnumpyasnpimportmatplotlib.pylabaspltimportscipy.optimizeasopt2.读取数据百度网盘地址如下：链接：https://pan.baidu.com/s/12iVi93AQStYRmgUhhYR0Zg提取码：9kgk#根据自己存放的路径进行修改path='ML-homework-main\
Infinity_and_beyond·2023-09-28 00:56

R语言学习.6---绘图

R语言绘图是生信技能树生信爆款入门课程R语言部分Day6的讲到的一个重要知识点。为加深理解，现在做下练习巩固。
Seurat_·2023-09-28 00:49

全面解析并实现逻辑回归(Python)

本文以模型、学习目标、优化算法的角度解析逻辑回归(LR)模型，并以Python从头实现LR训练及预测。
风度78·2023-09-28 00:23

逻辑回归模型的简介及python代码实现

文章目录1逻辑回归简介1.1回归步骤1.2逻辑回归与多重线性回归2逻辑回归模型算法原理2.1逻辑回归模型的数学原理2.2逻辑回归模型的代码实现2.3逻辑回归模型的深入理解2.4多分类逻辑回归模型演示总结
日常脱发的小迈·2023-09-28 00:22

GEO生信数据挖掘（一）数据集下载和初步观察

GSE1297为例目录GEOquery简介安装并加载GEOquery包getGEO函数获取数据（联网下载）更换下载数据源对数据集进行初步观察处理GEOquery简介GEOquery是一个在生物信息学中常用的R语言包
人工智能学术前沿（真)·2023-09-27 22:54

跟着Science学画图：R语言ggplot2作小提琴图展示NLRs基因的拷贝数（copy number）

论文是Denovoassembly,annotation,andcomparativeanalysisof26diversemaizegenomesimage.png部分数据代码是公开的下载链接https://zenodo.org/record/4781590#.YSB40Hzivic论文本地pdf玉米Science.pdf附件本地pdfabg5289_Hufford_SM.pdf今天的推文我们来
小明的数据分析笔记本·2023-09-27 22:25

跟着Nature Plants学作图：R语言ggplot2画分组折线图和置信区间

论文Theflyingspider-monkeytreeferngenomeprovidesinsightsintofernevolutionandarborescencehttps://www.nature.com/articles/s41477-022-01146-6#Sec44数据下载链接https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19125641今天的推文重复一
小明的数据分析笔记本·2023-09-27 22:17

R语言逻辑回归、决策树、随机森林、神经网络预测患者心脏病数据混淆矩阵可视化...

全文链接:https://tecdat.cn/?p=33760众所周知，心脏疾病是目前全球最主要的死因。开发一个能够预测患者心脏疾病存在的计算系统将显著降低死亡率并大幅降低医疗保健成本。机器学习在全球许多领域中被广泛应用，尤其在医疗行业中越来越受欢迎。机器学习可以在预测关键疾病（例如心脏病）的存在或不存在方面发挥重要作用（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频如果能提前准确预测这些信息，
拓端研究室TRL·2023-09-27 22:27

线性回归&逻辑回归&正则化

本文为《吴恩达机器学习》课程笔记线性回归代价函数CostFuction它的目标是:选择出可以使得建模误差的平方和能够最小的模型参数批量梯度下降BatchGradientDescent是学习率（learningrate），它决定了我们沿着能让代价函数下降程度最大的方向向下迈出的步子有多大，在批量梯度下降中，我们每一次都同时让所有的参数减去学习速率乘以代价函数的导数。对于的取值可以尝试:运用梯度下降法
susion哒哒·2023-09-27 20:50

ggplot2绘制箱式图（并叠加小提琴图和点图）

本文使用基因表达数据绘制箱式图，并叠加小提琴图和点图(geom_boxplot绘制箱式图，geom_violin绘制小提琴图，geom_dotplot和geom_jitter绘制点图).了解一下R语言中箱式图的术语
钿璎纍纍佩珊珊·2023-09-27 20:17

介绍一位网络爬虫工程师

他系一名软件开发工程师，在工作之余，热爱Python编程，专注于网络爬虫与数据分析（R语言、水晶易表）。
IT农民工1·2023-09-27 18:32

介绍一位零基础学Python网络爬虫的工程师

他系一名软件开发工程师，在工作之余，热爱Python编程，专注于网络爬虫与数据分析（R语言、水晶易表）。
IT农民工1·2023-09-27 18:02

常用植被物候提取方法 (TIMESATE/R语言/Python)

文章内容仅用于自己知识学习和分享，如有侵权，还请联系并删除：）（一）Background这篇文章介绍的非常全面！！物候的提取通常包含两个步骤：（1）曲线的重构拟合（curvefitting）和（2）物候矩阵的提取（phenologicalmetricsextraction）（1）曲线拟合的方法通常有3种方法：(S-G)滤波法（Savitzky-Golay）,双逻辑斯蒂函数拟合法（DoubleLog
柚柚柚子爱吃葡萄柚·2023-09-27 12:17

r语言作业：基于线圈数据的交通流密速分析

目录1.数据读取：提取全部NHNX40(1)检测器的数据。2.冗余和缺失处理3.数据聚集4.可视化与分析5.选择第一天的数据分析6.总体代码1.数据读取：提取全部NHNX40(1)检测器的数据。通过Excel打开几个文件并查找后，确认仅有tmp02和tmp04中含有NHNX40（1）监测器结果，因此将两个文件合并为data文件，并针对data文件进一步通过函数过滤监测器NHNX40（1）的数据至新
苏瑾年sakuralen·2023-09-27 12:43

spark java web_在Java Web中使用Spark MLlib训练的模型

训练模型首先在sparkMLlib中使用mllib包下的逻辑回归训练模型：importorg.apache.spark.mllib.classification.{Logisti
圆山中庸·2023-09-27 11:55

R语言逻辑回归Logistic选股因素模型交易策略及沪深300指数实证|附代码数据

全文链接：http://tecdat.cn/?p=32071原文出处：拓端数据部落公众号最近我们被客户要求撰写关于交易策略的研究报告，包括一些图形和统计输出。随着中国的证券市场规模的不断壮大、市场创新不断深化、信息披露不断完善、市场监管不断强化，随着现代投资组合理论的发展和计算机技术的进步，投资者为了在股票交易中取得更多的收益，就需要有合理有效的投资策略，因素模型的基础上发展出众多量化研究模型。对
·2023-09-27 11:56

R语言用标准最小二乘OLS，广义相加模型GAM ，样条函数进行逻辑回归LOGISTIC分类...

p=21379本文我们对逻辑回归和样条曲线进行介绍（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。logistic回归基于以下假设：给定协变量x，Y具有伯努利分布，目的是估计参数β。
拓端研究室TRL·2023-09-27 08:40

数据分享|R语言分析上海空气质量指数数据：kmean聚类、层次聚类、时间序列分析：arima模型、指数平滑法...

本文向大家介绍R语言对上海PM2.5等空气质量数据（查看文末了解数据免费获取方式）间的相关分析和预测分析，主要内容包括其使用实例，具有一定的参考价值，需要的朋友可以参考一下（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据
拓端研究室TRL·2023-09-27 08:34
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