sra数据下载第16页

windows下使用word2vec训练维基百科中文语料全攻略！（一）

训练数据下载我们使用维基百科训练词向量，维基百科数据的下载地址为：https://dumps.wikimedia.org/zhwiki/lates

LeadAI学院·2023-04-10 06:10

springboot 启动加载数据 commandLineRunner

项目启动时，我们需要加载一些数据或启动定时任务执行数据下载或同步，此时可以用到commandLineRunner类。

茶本无香·2023-04-10 05:58

在Mac 和windows上用 Aspera Connect下载NCBI Sra数据

做生信分析在NCBI上下数据是第一步，不一定非要用linux下，装好sratools和AsperaConnect和都没问题。在这里NCBISRAToolkit找属于你版本的sratools吧。在这里AsperaConnect找属于你版本的的ascp客户端如果下载太慢，可以私信我，我给你网盘链接。用sratools的prefetch命令是最快的。基本用法都是需要告诉prefetch，ascp的程序在

Ray钱·2023-04-09 22:15

合并新版TCGA表达矩阵R代码叒更新了—基因名字也给你提出来

TCGA数据库在2022年4月初进行更新之后，小编第一时间给大家展示了TCGA数据库的变化，用图文的方式详细介绍了新版TCGA数据库RNAseq数据下载方法。

生信交流平台·2023-04-09 19:40

ArcGIS批量栅格重采样（ArcPy方法）

本系列文章的开发环境为：ArcGIS10.2.2+Python2.7、ENVI5.3+IDL8.5ArcGIS批量计算栅格数据平均值（ArcPy方法）GLDAS数据下载及处理（NC转TIF）ArcGIS

bestYou_·2023-04-09 17:11

学生信的那些事儿之十二 - RNAseq 分析流程之用aspera工具下载SRA数据

在Linux系统下安装了conda，配置了镜像，创建了分析环境，并且在环境下下载了常用的分析软件，那么接下来做什么呢？锅碗瓢盆、油盐酱醋都已准备妥当，准备开火煮饭却发现没有米！生信分析的米是啥，是数据，数据从哪里来？一种途径是可以把样本送到测序公司，然后测序公司交付数据，比如说你给我样本（和钱），我交付数据，这是一手的“资料”。另一个途径就是用别人的，而且不用花钱，真的就有这么好的事儿。NCBI是

李白爱吃橙子·2023-04-09 15:26

GEO数据库视频学习笔记（芯片数据下载和数据读取）

之前写的的CHIP-seq和RNA-seq很多练习的数据都是从GEO数据库下载的。但是从来没有细致的了解过GEO这个数据库。趁着还没复工，再多学一点新知识~这次的笔记是生信技能树的视频笔记，视频是对公众开放的，地址如下：生信技能数b站视频地址：https://space.bilibili.com/338686099/channel/detail?cid=95141视频还是很浅显易懂的，写这个笔记的

生信start_site·2023-04-09 07:06

在Arcgis中对nc格式的气象数据处理方法

Arcgis中对nc格式的气象数据处理的方法：以国家地球系统科学数据中心的《1901-2021年中国1km分辨率逐月降水量数据集》为例更多教程：树谷资料库资源大全（3月16日更新）（1）数据下载链接：http

树谷-胡老师·2023-04-09 06:22

CellRanger初探

公共数据库中的SRA单细胞转录组数据究竟包含了哪些数据？CellRanger怎样利用10x平台下机数据进行下游一系列分析？这篇文章简单记录CellRanger包括的主要分析步骤，纯理论。

新欣enjoy·2023-04-09 05:27

手把手教你用nodejs 模拟人工输入账号密码自动登录，爬取网页数据生成xlsx

这时候想把这些数据全部放在xlxs里，手动的话，得一条一条复制就是有200条信息，你也得复制2-3小时，但是用本程序，可以自动批量把数据导入到xlsx，只要你运行程序，数秒就把数据下载

qq1520869979·2023-04-09 01:23

2021-02-24--TCGA 拷贝数变异数据分析

GISTIC2分析TCGA拷贝数变异数据及可视化全过程一、数据下载1、Segment_data数据下载TCGA官网下载下载地址它有如下CNV类型，而在TCGA数据库里面我们通常关心的是somaticCNV

FFwizard·2023-04-08 19:47

STM32介绍

此外，它们还具有较大的Flash存储器和SRA

(～￣▽￣)～凤凰涅槃·2023-04-08 14:29

KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载

KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载KEGGpathwayKEGG数据库pathway相关数据下载我们下载KEGG数据库的目的是为了研究目标蛋白参与了那些pathway。

赵会成·2023-04-08 07:05

（收藏贴）微生物多样性测序原始数据（SRA）上传到NCBI实操

我们知道，给SCI期刊投稿的时候，往往要上传原始数据，今日，笔者正好在做这份工作，就学习记录，供大家参考。操作步骤太多了。。。读者感兴趣可以去公众号查看。

龙star180·2023-04-08 06:09

AIS数据下载

该网址可以免费下载美国及其国际海域的船舶AIS数据https://marinecadastre.gov/ais/

网格小生·2023-04-08 06:54

CMIP6数据下载

之前没有用过模式数据，因此记录一下首先下载可以用这个网站CMIP6Homepage下面红框的四个网站可以任意选择之后选择参数，我用到的是分辨率，experimentID，frequency，和变量但是我之后发现这里下载下的不快，而且有时候下载不下来。然后我就换了个网站https://data.ceda.ac.uk/badc/cmip6/data/CMIP6/CMIP/AWI/AWI-CM-1-1-

就是一只白·2023-04-08 06:12

AIS数据下载并处理（python）

最近由于项目需求，需要下载AIS数据，其实也就是船舶位置数据。首先通过百度发现目前一些网站下载的AIS数据都是收费的，如船达通等等。船达通是只能查找近一个月的船舶轨迹信息，下载需要支付收费。但是最后我终于找到了一个免费下载AIS数据的网站，并且下面附上了处理说明，可以通过python代码批量处理通过以下的文档可以详细了解如何下载数据，将AIS数据中的时间、经度、纬度、航速提取出来。最后通过ArcM

就是一只白·2023-04-08 06:07

转录组实战01: 从数据下载到定量fastp+STAR

生信交流与合作请关注公众号@生信探索01.建立工作目录cd ~mkdir -p Project/Human_16_Asthma_Bulkcd Project/Human_16_Asthma_Bulk# 建立数据存放目录 datamkdir -p data/rawdata data/cleandata/fastp# 建立STAR目录mkdir STAR02.环境准备micromamba creat

生信探索·2023-04-07 18:40

R代码合并TCGA体细胞突变数据

☞新版TCGA数据库RNAseq数据下载☞新版TCGA数据库miRNA数据下载无论是RNAseq，miRNAseq还是体细胞突变

生信交流平台·2023-04-06 10:05

SRA数据库简介及使用方法

来源于SRA官网介绍SRA是NIH高通量测序数据的主要存档，并且是国际核苷酸序列数据库协作（INSDC）的一部分，该数据库包括NCBI序列阅读档案（SRA），欧洲生物信息学研究所（EBI）以及日本（DDBJ

正经昵称征集中·2023-04-06 10:13

SRA数据库简介

简介SRA是NIH的高通量测序数据的主要档案，是国际核苷酸序列数据库协作（INSDC）的一部分，包括NCBI序列阅读档案（SRA），欧洲生物信息学研究所（EBI）和DNA数据库。日本（DDBJ）。

Forest_Lee·2023-04-06 07:32

StaMPS中使用GACOS数据进行大气校正，解缠、计算形变速率

StaMPS中使用GACOS数据进行大气校正1GACOS数据下载2查看GACOS用法3在StaMPS中使用GACOS进行大气校正4stamps6相位解缠stamps7时间形变速率5制图1GACOS数据下载

Vigo*GIS_RS·2023-04-06 01:46

[R]TCGAbiolinks包：数据准备--query、download、prepare

TCGAbiolinks包是一站式分析TCGA数据的R包工具，它集成了TCGA数据下载、分析、可视化的全部流程。此次系列笔记主要跟着TCGAbiolinks帮助文档重新学习下TCGA数据挖掘流程。

小贝学生信·2023-04-05 23:50

GEO数据库视频学习笔记（差异分析、可视化、GSEA）

笔记回顾：1.GEO数据库视频学习笔记（芯片数据下载和数据读取）2.GEO数据库视频学习笔记（ID转换）3.GEO数据库视频学习笔记（了解你的表达矩阵）这一讲的视频地址是：[https://www.bilibili.com

生信start_site·2023-04-05 21:43

2019-04-16 SRA数据批量下载

批量下载SRA数据#!

WILLWILLWIN·2023-04-05 20:51

Python-爬虫-凯斯西储轴承数据下载

1.背景久闻凯斯西储数据集大名，最近开了个新坑，打算用CWRU数据做一下验证，网上简单搜了一下没有找到现成的数据，遂前往官网手动下载然后手动命名。在下载十几个数据之后，忽然想起为什么不用python来下载？本文提供了python下载CWRU数据的程序，以及汇总数据。（后话）下载完才发现有几个百度云资源，这里一并整理在“4.数据集下载”中。2.工具python+re+request3.程序impor

猫猫丸·2023-04-05 19:39

1.基于深度学习的轴承故障诊断--凯斯西储大学轴承数据集介绍

本章主要介绍来自凯斯西储大学的轴承实验数据下载地址西储大学下载地址：http://csegroups.case.edu/bearingdatacenter/pages/download-data-file

秋雨行舟·2023-04-05 19:57

GEO数据分析之必备基础知识

数据分析之必备基础知识本节主要介绍GEO分析开始之前的准备工作和推荐学习以下非常优秀的推文，学习之后GEO分析就春暖花开了：生信技能树GEO数据挖掘相关的课程解读GEO数据存放规律及下载，一文就够解读SRA

天涯清水·2023-04-05 14:19

利用R包TCGAbiolinks进行各种数据下载

TCGAbiolinks的优点在于具备一体化的下载整合，无需再使用复杂的方法对下载的单个数据重新进行整合，换句话说，就是TCGAbiolinks包下载的数据是合并了的，不需要整理（TCGAbiolinks数据下载

生信start_site·2023-04-05 05:27

NASA EARTHDATA GES DISC不用爬虫基于插件DownThemAll批量下载数据

NASAEARTHDATAGESDISC不用爬虫批量下载数据下载插件DownThemAll找到数据集下载链接列表启动插件由于NASAEARTHDATAGESDISC的数据集需要登录下载，使用爬虫下载不仅需要获取

冬_冬_·2023-04-05 04:28

PowerBI基础 ——第三天分组求和summarizecolumns等同于SQL中的分组汇总group by

本文的数据下载地址：https://download.csdn.net/download/weixin_44435602/161285641、从官方给出summarizecolumns的解释：返回组组的摘要表语法

骑士坑天下·2023-04-05 04:56

NASA 数据下载文档

第一页中：导入研究区范围SHP—在这个页面最下方可以调节云量和日期1990，1998年选Landsat4，52006年选Landsat72014，2022年选Landsat8第二页选择需要的产品数据—Landsatlevel2第三页不管第四页就开始显示结果下载即可

借巨塔许愿望·2023-04-05 04:44

aspera下载

home/shen/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh-k1-T-l100manonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:sra

苏牧传媒·2023-04-05 01:42

地球物理及空间物理相关数据下载

总结了一些常用的数据下载地址（持续更新ing…）。

IGSzt·2023-04-04 12:37

matlab怎样获取输出文件_MATLAB处理CMIP5模式输出数据（NetCDF格式），附数据下载地址和M文件代码...

CMIP5是世界气候研究项目(WorldClimateResearchProgramme，WCRP)组织的第5次气候模式对比计划(CoupledModelIntercomparisonProject5)。目前，该项目(WCRP)正在开展第6次气候模式对比计划(CMIP6)。其中，来自全球各国家的46个气候模式参加了CMIP5，这些气候模式输出的二维气候变量约有40个左右，像表面温度(ts)，海平面

Yao King·2023-04-04 09:00

CMIP6数据下载教程大全（含批量）

CMIP6数据下载教程大全（含批量）注意：CMIP6数据网站属国外网站，比较卡，需耐心等待及其下载。

长安归故里啊·2023-04-04 09:49

conda 卸载_conda第一步，你确定安装成功了吗？

安装列表bwagatk4sra-

weixin_39563823·2023-04-04 04:44

跟着Nature microbiology学作图:R语言ggplot2做簇状柱形图并在坐标轴添加分组标记

EvolutionaryoriginsoftheSARS-CoV-2sarbecoviruslineageresponsiblefortheCOVID-19pandemicimage.png本地文件s41564-020-0771-4.pdf代码和数据下载链接

小明的数据分析笔记本·2023-04-03 23:10

利用scanpy进行单细胞测序分析（一）预处理和聚类

https://scanpy-tutorials.readthedocs.io/en/latest/pbmc3k.html这个软件的官网分了几个部分进行介绍，每一个部分的练习数据都不一样，这一部分的练习数据下载地址

生信start_site·2023-04-03 20:41

转录组实战之SRA数据下载（上） 2019-05-07

数据下载两种方式打开链接，下载id：https://www.ncbi.nlm.nih.gov//geo/query/acc.cgi?

Bio小盼·2023-04-03 19:17

细菌基因组的组装

一、获取SRA号登录GenomeAnnouncements网站（https://mra.asm.org/），搜索关键词“bacteriagenomeSRA”，在搜索到的细菌基因组文章中选择一篇，找到文章记载的

々不发呆·2023-04-03 02:27

数据获取及处理

AD%E4%B8%80%E4%B8%AA%E5%AE%8C%E6%95%B4%E7%9A%84%E8%BD%AC%E5%BD%95%E7%BB%84%E9%A1%B9%E7%9B%AE/听张旭东老师的课数据下载工具

嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀·2023-04-02 23:00

单细胞测序分析: Seurat V3联合harmony进行单细胞数据整合分析

HarmonyintegratesspatiallyresolvedtranscriptomicwithdissociatedscRNAseqdatasets#R包导入library(Seurat)library(cowplot)library(harmony)#数据数据下载

JeremyL·2023-04-02 12:52

m6A原始数据识别差异甲基化——使用RADAR分析MeRIP-seq数据

www.ebi.ac.uk/ebisearch/error.ebi数据展示：双末端：SRR7763560_1.fastq.gzSRR7763560_2.fastq.gz；单末端：SRR9029562.fastq.gz数据下载

Apache_lin·2023-04-02 12:03

《ArcGIS Runtime SDK for Android开发笔记》——离在线一体化技术：离线矢量数据下载

【原文链接：http://www.cnblogs.com/gis-luq/p/5858048.html】1、前言1.1、环境准备：ArcGISforDesktop10.4.1（10.2.1以上版本即可）ArcGISforServer10.4.1（10.2.1以上版本即可）PostgreSQL、MicrosoftSQLServer、或Oracle设置企业级地理数据库。1.2、发布具有同步能力的Fea

duyi324·2023-04-02 09:36

osm数据下载【附实例】

目录1.OSM官网下载数据集1.1直接导出（不推荐）1.2其他摘录OSM数据的网站2.通过QGIS插件下载（推荐推荐推荐）2.1下载并安装QGIS软件2.2插件使用方法3.通过Arcgis工具箱下载4.小结1.OSM官网下载数据集1.1直接导出（不推荐）直接进入OSM主页面点击导出数据。缺点：无法根据行政区划导出数据；导出数据格式为.osm无法直接添加到arcgis中进行处理1.2其他摘录O

我是个烧饼啊·2023-04-02 01:35

hive：表数据从一台机器导入到另一台机器的 hive 中

hive：表数据从一台机器导入到另一台机器的hive中1进入老机器目录新建dirTmp文件夹2原机器中数据下载到本地3打包文件4文件传输到新机器5解压文件6创建hive表,并指定hdf目录和分割方式7将文件传到新机器

小何才露尖尖角·2023-04-02 00:11

chip-seq数据分析流程

chip-seq数据分析流程1.chip-seq数据下载及更换名称1.1.根据文献提供的ncbi的编号，下载sra数据。1.2.更换文件名：更换后的文件名能表明数据所对应的实验组。

梁兄_小白·2023-04-01 17:46

linux学习100篇36：转录组分析用软件及安装sra-tools

安装(rnaseq)root11:41:39~$condainstall-ysra-tools=2.10.7Collectingpackagemetadata(current_repodata.json):doneSolvingenvironment:failedwithinitialfrozensolve.Retryingwithflexiblesolve.Collectingpackageme

Seurat_·2023-04-01 15:31

SRA Toolkit下载SRA数据

1.下载https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?

lms9095·2023-04-01 13:34

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