使用OpenMP实现并行归并排序(Report)

原文链接: http://www.cnblogs.com/ACMFish/p/7222831.html

归并排序算法:

归并排序算法是一种经典的分治算法。

分治

分治算法分为由三部分组成:
分解:将原问题分解为一系列子问题;
解决:递归的解决各个子问题。若子问题足够小,那么直接求解。
合并:将子问题的结果合并成原问题。

归并排序步骤

归并排序完全依照了上述模式,直观的操作如下:
分解:将n个元素分成各含n/2个元素的子序列;
解决:用合并排序法对两个子序列递归地排序;
合并:合并两个已经排序的子序列,已得到排序结果。
这里递归的边界是序列长度为1时,显然是有序的。

合并过程

这里最关键的步骤,是合并步骤里如何合并两个有序的序列,并保证合并后的序列依然有序。

假设有序的序列为递增的,A、B为需要合并的序列,C为合并后的结果序列,p、q分别为A和B的下标,top为C的下标。定义如果一个下标大于序列的长度后,表示的值为无穷大。

初始状态:p、q、top均为0.

操作:选择A[p]和B[q]中的小的元素,加入到C[top]中,然后让较小的元素所在的序列的下标加一,top加一。当A[p]和B[q]均为无穷大时,结束操作。

由于每次操作均是比较A[p]和B[q],然后取较小者加入C中,显然时间复杂度是O(n)的。

归并排序时间复杂度分析:

假设归并排序一个长度为n的序列需要的时间为T(n)。
首先归并排序分如下三个步骤:
分解:这一步是把序列分为两个子序列,只需要常量时间,O(1);
解决:递归的解决规模为n/2的两个子问题,时间为2*T(n/2);
合并:上面已经证明,只需时间O(n)。

那么接下来可以UI递归的表示出所需的时间T(n):
当n = 1是,T(n) = O(1);
否则:T(n) = 2*T(n/2) + O(n)。

可以证明出上述的T(n)其实就是O(n*log(n))。

T(n) = 2*T(n/2) + O(n)
= 2*(2*T(n/4) + O(n/2) + O(n)
= 4*T(n/4) + 2*O(n/2) + O(n)
= 4*T(n/4) + 2*O(n)
= 8*T(n/8) + 8*O(n/8) + 2*O(n)
= 8*T(n/8) + 3*O(n)
= x*T(1) + y*O(n)

显然y即为n除多少次才为1,y = log2(n),x等于2^y,那么T(n) = O(n*log(n))。

一个容易理解的代码:

Python is very beautiful!

def merge_sort(array):
    if len(array) > 1:
        mid = len(array) / 2
        left = merge_sort(array[:mid])
        right = merge_sort(array[mid:])
        return merge(left, right)
    return array


def merge(left, right):
    rst = []
    while len(left) > 0 or len(right) > 0:
        if len(right) == 0 or len(left) != 0 and left[0] < right[0]:
            rst.append(left.pop(0))
        else:
            rst.append(right.pop(0))
    return rst

串行过程:

串行排序代码:

void merge_sort(int *A, int x, int y, int *T) {
    if (y - x > 1) {
        int m = x + (y-x)/2;
        int p = x, q = m, i = x;
        merge_sort(A, x, m, T);
        merge_sort(A, m, y, T);

        while (p < m || q < y) {
            if (q >= y || (p < m && A[p] <= A[q])) {
                T[i++] = A[p++];
            }
            else {
                T[i++] = A[q++];
            }
        }
        for (i = x; i < y; i++) {
            A[i] = T[i];
        }
    }
}

串行求和代码:

int get_sum(int* data, int N) {
    int sum = 0, i;
    for (i = 0; i < N; i++) {
        sum += data[i];
    }
    return sum;
}

运行时间:

num_elements sort time sum time
100 0.000012 0.000001
1000 0.000166 0.000005
10000 0.002162 0.000045
100000 0.022915 0.000384
1000000 0.216075 0.003397
10000000 2.404543 0.034109
100000000 27.204318 0.340051

ignore the input time.

并行过程:

归并排序算法的并行化:

首先,归并排序的步骤分为已下三步:

分解:将n个元素分成各含n/2个元素的子序列;
解决:用合并排序法对两个子序列递归地排序;
合并:合并两个已经排序的子序列,已得到排序结果。

然后发现,按照这个思路很难并行化,因为许多过程有依赖的,比如当[1, 1], [2, 2] 区间没有合并之前,那么[1, 2], [3, 4]区间是不能进行合并的。

但是我们可以把归并的步骤反过来。原来归并是要不断的分解一个序列,直到分解成长度为1的区间,最后依次合并。我们现在假设有N个区间,要分别合并,最后合并成一个区间。那么我现在的操作是没有前后依赖的,对于任意两个区间,只需要合并就好,不用考虑其他的线程。

这样排序的过程就类似一颗线段树(严格的来讲并不是),自底向上的不断合并。

使用OpenMP实现并行归并排序(Report)_第1张图片

排序代码:

//合并两个区间
void merge(int l1, int r1, int r2, int* data, int* temp) {
    int top = l1, p = l1, q = r1;
    while (p < r1 || q < r2) {
        if (q >= r2 || (p < r1 && data[p] <= data[q])) {
            temp[top++] = data[p++];
        }
        else {
            temp[top++] = data[q++];
        }
    }
    for (top = l1; top < r2; top++) {
        data[top] = temp[top];
    }
}

void merge_sort(int l, int r, int* data, int N) {
    int i, j, t, *temp;
    temp = (int*)malloc(N * sizeof(int));
    //这里做了一些优化,预处理合并了单个的区间,略微提高的速度
    #pragma omp parallel for private(i, t) shared(N, data)
    for (i = 0; i < N/2; i++)
        if (data[i*2] > data[i*2+1]) {
            t = data[i*2];
            data[i*2] = data[i*2+1];
            data[i*2+1] = t;
        }

    //i代表每次归并的区间长度,j代表需要归并的两个区间中最小的下标
    for (i = 2; i < r; i *= 2) {
        #pragma omp parallel for private(j) shared(r, i)
        for (j = 0; j < r-i; j += i*2) {
            merge(j, j+i, (j+i*2 < r ? j+i*2 : r), data, temp);
        }
    }
}

求和代码:

int get_sum(int* data, int N) {
    int sum = 0, i;
    #pragma omp parallel for private(i) reduct(+:sum)
    for (i = 0; i < N; i++) {
        sum += data[i];
    }
    return sum;
}

运行时间:

num_elements sort time sum time
100 0.000164 0.000009
1000 0.000209 0.000009
10000 0.002318 0.000052
100000 0.010589 0.000166
1000000 0.110090 0.001279
10000000 1.093572 0.013541
100000000 11.872408 0.127646

ignore the input time.

运行时间分析:

排序时间对比:

使用OpenMP实现并行归并排序(Report)_第2张图片

求和时间对比:

使用OpenMP实现并行归并排序(Report)_第3张图片

结论:

增加线程数在是可以加快程序的运行速度的,但是随着线程的增加,加速的效果逐渐变得不明显,双线程与单线程的差异较大,整体上多线程的用时为单线程的一半。

转载于:https://www.cnblogs.com/ACMFish/p/7222831.html

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