Hadoop 的 TotalOrderPartitioner

http://blog.oddfoo.net/2011/04/17/mapreduce-partition%E5%88%86%E6%9E%90-2/ 

Partition所处的位置


patition类结构


1. Partitioner是partitioner的基类,如果需要定制partitioner也需要继承该类。

2. HashPartitioner是mapreduce的默认partitioner。计算方法是

which reducer=(key.hashCode() & Integer.MAX_VALUE) % numReduceTasks,得到当前的目的reducer。

3. BinaryPatitioner继承于Partitioner< BinaryComparable ,V>,是Partitioner的偏特化子类。该类提供leftOffset和rightOffset,在计算which reducer时仅对键值K的[rightOffset,leftOffset]这个区间取hash。

Which reducer=(hash & Integer.MAX_VALUE) % numReduceTasks

4. KeyFieldBasedPartitioner也是基于hash的个partitioner。和BinaryPatitioner不同,它提供了多个区间用于计算hash。当区间数为0时KeyFieldBasedPartitioner退化成HashPartitioner。

5. TotalOrderPartitioner这个类可以实现输出的全排序。不同于以上3个partitioner,这个类并不是基于hash的。在下一节里详细的介绍totalorderpartitioner。

TotalOrderPartitioner


每一个reducer的输出在默认的情况下都是有顺序的,但是reducer之间在输入是无序的情况下也是无序的。如果要实现输出是全排序的那就会用到TotalOrderPartitioner。

要使用TotalOrderPartitioner,得给TotalOrderPartitioner提供一个partition file。这个文件要求Key (这些key就是所谓的划分)的数量和当前reducer的数量-1相同并且是从小到大排列。对于为什么要用到这样一个文件,以及这个文件的具体细节待会还会提到。

TotalOrderPartitioner对不同Key的数据类型提供了两种方案:

1) 对于非BinaryComparable(参考附录A)类型的Key,TotalOrderPartitioner采用二分发查找当前的K所在的index。

例如reducer的数量为5,partition file 提供的4个划分为【2,4,6,8】。如果当前的一个key value pair 是<4,”good”>利用二分法查找到index=1,index+1=2那么这个key value pair将会发送到第二个reducer。如果一个key value pair为<4.5, “good”>那么二分法查找将返回-3,同样对-3加1然后取反就是这个key value pair 将要去的reducer。

对于一些数值型的数据来说,利用二分法查找复杂度是o(log (reducer count)),速度比较快。

2) 对于BinaryComparable类型的Key(也可以直接理解为字符串)。字符串按照字典顺序也是可以进行排序的。这样的话也可以给定一些划分,让不同的字符串key分配到不同的reducer里。这里的处理和数值类型的比较相近。

例如reducer的数量为5,partition file 提供了4个划分为【“abc”, “bce”, “eaa”, ”fhc”】那么“ab”这个字符串将会被分配到第一个reducer里,因为它小于第一个划分“abc”。

但是不同于数值型的数据,字符串的查找和比较不能按照数值型数据的比较方法。mapreducer采用的Tire tree的字符串查找方法。查找的时间复杂度o(m),m为树的深度,空间复杂度o(255^m-1)。是一个典型的空间换时间的案例。

Tire Tree


Tire tree的构建

假设树的最大深度为3,划分为【aaad ,aaaf, aaaeh,abbx 】

采样类结构图

采样方式对比表:

类名称

采样方式

构造方法

效率

特点

SplitSampler

对前n个记录进行采样

采样总数,划分数

最高

 

RandomSampler

遍历所有数据,随机采样

采样频率,采样总数,划分数

最低

 

IntervalSampler

固定间隔采样

采样频率,划分数

对有序的数据十分适用

writePartitionFile这个方法很关键,这个方法就是根据采样类提供的样本,首先进行排序,然后选定(随机的方法)和reducer数目-1的样本写入到partition file。这样经过采样的数据生成的划分,在每个划分区间里的key value pair 就近似相同了,这样就能完成均衡负载的作用。

TotalOrderPartitioner实例


 
   
复制代码
public  class SortByTemperatureUsingTotalOrderPartitioner  extends Configured
         implements Tool
{
    @Override
     public  int run(String[] args)  throws Exception
    {
        JobConf conf = JobBuilder.parseInputAndOutput( this, getConf(), args);
         if (conf ==  null) {
             return -1;
        }
        conf.setInputFormat(SequenceFileInputFormat. class);
        conf.setOutputKeyClass(IntWritable. class);
        conf.setOutputFormat(SequenceFileOutputFormat. class);
        SequenceFileOutputFormat.setCompressOutput(conf,  true);
        SequenceFileOutputFormat
                .setOutputCompressorClass(conf, GzipCodec. class);
        SequenceFileOutputFormat.setOutputCompressionType(conf,
                CompressionType.BLOCK);
        conf.setPartitionerClass(TotalOrderPartitioner. class);
        InputSampler.Sampler sampler =  new InputSampler.RandomSampler(
                0.1, 10000, 10);
        Path input = FileInputFormat.getInputPaths(conf)[0];
        input = input.makeQualified(input.getFileSystem(conf));
        Path partitionFile =  new Path(input, "_partitions");
        TotalOrderPartitioner.setPartitionFile(conf, partitionFile);
        InputSampler.writePartitionFile(conf, sampler);
         //  Add to DistributedCache
        URI partitionUri =  new URI(partitionFile.toString() + "#_partitions");
        DistributedCache.addCacheFile(partitionUri, conf);
        DistributedCache.createSymlink(conf);
        JobClient.runJob(conf);
         return 0;
    }

     public  static  void main(String[] args)  throws Exception {
         int exitCode = ToolRunner.run(
                 new SortByTemperatureUsingTotalOrderPartitioner(), args);
        System.exit(exitCode);
    }
}
复制代码

示例程序引用于:http://www.cnblogs.com/funnydavid/archive/2010/11/24/1886974.html

附录A
Text 为BinaryComparable,WriteableComparable类型。
BooleanWritable、ByteWritable、DoubleWritable、MD5hash、IntWritable、FloatWritable、LongWritable、NullWriable等都为WriteableComparable。

 

 

http://www.cnblogs.com/OnlyXP/archive/2008/12/06/1349026.html

 

在0.19.0以前的版本中,Hadoop自身并没有提供全排序的solution,如果使用缺省的partitioner(HashPartitioner)每个reducer的输出自身是有序的,但是多个reducer的输出文件之间不存在全序的关系;如果想实现全排序,需要自己实现Partitioner,比如针对key为Mac地址的Partitioner,如假定Mac地址的分布是均匀的,可以根据Mac地址的前两个字节构造不超过255个reducer的Partitioner;但是这种Partitoiner是应用逻辑相关的,因此没有通用性,为此Hadoop 0.19.0提供了一个通用的全序Partitioner。 

TotalOrderPartitioner最初用于Hadoop Terasort,也许是考虑到其通用性,后来作为0.19.0的release feature发布。

Partitioner的目的是决定每一个Map输出的Record由哪个Reducer来处理,它必须尽可能满足
1. 平均分布。即每个Reducer处理的Record数量应该尽可能相等。

2. 高效。由于每个Record在Map Reduce过程中都需要由Partitioner分配,它的效率至关重要,需要使用高效的算法实现。
获取数据的分布

对于第一点,由于TotalOrderPartitioner 事先并不知道key的分布,因此需要通过少量数据sample估算key的分布,然后根据分布构造针对的Partition模型。

0.19.0中有一个InputSampler就是做这个事情的,
通过指定Reducer个数, 并读取一部分的输入数据作为sample,将sample数据排序并根据Reducer个数等分后,得到每个Reducer处理的区间。比如包含9条数据的sample,其排好序的key分别为:
a b c d e f g h i
如果指定Reducer个数为3,每个Reducer对应的区间为

Reducer0 [a, b, c]
Reducer1 [d, e, f]
Reducer2 [g, h, i]

区间之间的边界称为Cut Point ,上面三个Reducer的Cut point为 d, g。  InputSampler将这cut points排序并写入HDFS文件,这个文件即包含了输入数据的分布规律。

根据分布构建高效Partition模型

对于上面提到的第2点,高效性,
在读取数据的分布规律文件之后,TotalOrderPartitioner会判断key是不是BinaryComparable类型的。

BinaryComparable的含义是“字节可比的”,o.a.h.io.Text就是一个这样的类型,因为两个Text对象可以按字节比较,如果对应的字节不相等就立刻可以判断两个Text的大小。

先说不是
BinaryComparable 类型的情况,这时 TotalOrderPartitioner会使用二分查找BinarySearch来确定key属于哪个区间,进而确定属于哪个Reducer,每一次查找的时间复杂度为O(logR),R为Reducer的个数。

如果key是
BinaryComparable类型, TotalOrderPartitioner会根据 cut points构造Trie Trie是一种更为高效的用于查找的数据结构, 这种数据结构适合key为字符串类型,如下图
Hadoop 的 TotalOrderPartitioner_第1张图片
TotalOrderPartitioner中的Trie缺省 深度为2,即使用2+1个prefix构造Trie;每个父节点有255个子节点,对应255个ASCII字符。查找的时间复杂度为O(m),m为树的深度,空间复杂度为O(255m-1),可以看到,这是一种空间换时间的方案,当树深度为2时,可以最多分配255 * 255个reducer,这在绝大情况下足够了。

可以看到,使用
Trie进行Partition的效率高于binarySearch,单次执行两种查找可能不会有 什么感觉,但是当处理亿计的Record时,他们的差距就明显了。
 
介绍Trie树的一篇好文章: http://hi.baidu.com/ecchi/blog/item/84bcdc3ff832a5c37d1e71bf.html

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