【生信人R软件入门】R语言基础操作介绍

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这是青盐的第 3 篇生信笔记分享

大家好,我是青盐,一只努力学习生信,并致力于在新疆推广生信的菜鸟。上一次我们简单介绍了R软件的安装,Rstudio以及R程序包的安装,相信大家已经对R有了初步的认识,这一次我们介绍R的基本语法。

一、R的基本运算符

R是一种解释性语言,不是编译语言,输入的命令能够直接被执行,不像其它语,例如C和FORTAN需要编译和连接等操作。R的命令提示符是“>”,表示正在等待输入命令,续行符为“+”,在同一行中输入多个命令语句,使用“;”来隔开。我们先来了解一下R的基本运算符,包括算术运算符、比较运算符以及逻辑运算符,示例代码如下:


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接下来说一下R语言中合法的函数形式是函数名(),括号内的参数可以为空,例如assign()。R语言对象名必须以字母开头(A-Z 或a-z),中间可以包含字母、数字(0–9)、点(.)及下划线(— )。R语言对象名是区分大小写的,所以在变量定义时注意x和X 代表着两个不同的对象。

二、R语言帮助功能的使用

无论是R语言的初学者还是已经学习了很长时间的人,都应该熟练的使用R语言的在线帮助功能。下面我们通过代码,以assign函数为例来讲解一下R语言在线帮助功能的具体使用。示例代码如下:


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对初学者而言,代码例子中我们列出了一些经常用的信息,如Examples部分、Arguments部分,有的函数参数很多,根据需要去看,不需要每一个参数意义都明白,有些参数并不常用。

除了代码中罗列的信息,帮助中还包含了其它一些说明部分,如注释(Notes),参考文献(References)或作者(Author(s))等,也可以根据需要选读。除了用代码查看帮助文档,同样也可以在R的程序界面菜单栏中点击 help 菜单 进行查询。

三、R语言常用基础函数

前两部分我们介绍了R语言的基本运算符以及如何使用在线帮助文档,这一部分我们主要介绍一些经常使用的基础包里面的函数,这些函数是R自带的,不用额外的安装和加载包。示例代码如下:

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这一篇生信笔记知识点就分享到这,主要介绍了R的基本运算符,R的在线帮助文档使用以及R的常用函数命令,下次将会给大家分享R语言的基本数据结构。看的在多,都不如动手一练,赶紧动起来吧!

参考文献:

[1]《R语言与统计分析》,作者 汤银才.

[2]《R语言实战》,作者【美】卡巴科佛,译者 高涛,肖楠,陈刚.

[3]https://www.bilibili.com/video/av25643438?from=search&seid=11340800859923486993

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