生物信息学

【机器学习】朴素贝叶斯方法的概率图表示以及贝叶斯统计中的共轭先验方法

朴素贝叶斯方法的概率图表示1.1节点表示1.2边表示1.3无其他连接1.4总结二、朴素贝叶斯的应用场景2.1文本分类2.2推荐系统2.3医疗诊断2.4欺诈检测2.5情感分析2.6邮件过滤2.7信息检索2.8生物信息学三

Lossya·2024-09-07 19:33

零基础入门生信数据分析——导读

零基础入门生信数据分析——导读生信数据分析，即生物信息学数据分析，是一个涵盖了生物学、计算机科学、数学和统计学等多个领域的交叉学科。

呆猪儿·2024-09-06 02:32

NCBI BLAST+：分析生物内在编码的工具

在生物信息学的广阔领域中，NCBI（NationalCenterforBiotechnologyInformation，美国国立生物技术信息中心）开发的BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool

belldeep·2024-09-02 23:52

【图论简介】

图论在计算机科学、网络理论、优化问题、生物信息学等多个领域都有广泛的应用。本文将简要介绍图论的基本概念、常见算法及其在实际中的应用。

WA-自动机·2024-09-02 13:26

生信圆桌：专业生信服务器与平台服务的提供者

生信圆桌是一个专注于提供生物信息学（生信）服务器和平台服务的领先企业，致力于为全球科研机构、企业和独立研究者提供高性能的生信分析解决方案。

生信圆桌x生信云服务器·2024-08-31 03:45

用Python实现生信分析——基序（Motif）识别详解

在生物信息学中，基序（Motif）是指在生物序列（如DNA、RNA或蛋白质序列）中具有特定功能或结构的短序列片段。基序通常在生物进化中得到保留，因为它们在生物学功能中起着重要作用。

写代码的M教授·2024-08-28 08:19

数据结构与算法——动态规划

LeetCode70题）2.斐波那契数列（LeetCode126题）3.最长公共子序列（LeetCode95题）引言动态规划（DynamicProgramming,简称DP）是一种在数学、计算机科学、经济学和生物信息学等领域广泛使用的算法设计技术

passion更好·2024-08-26 06:54

深度学习——概念引入

深度学习深度学习简介深度学习分类根据网络结构划分：循环神经网络卷积神经网络根据学习方式划分：监督学习无监督学习半监督学习根据应用领域划分：计算机视觉自然语言处理语音识别生物信息学深度学习简介深度学习（DeepLearning

韶光流年都束之高阁·2024-02-20 10:31

考研调剂：中医生命科学

科学网—考研调剂——欢迎研究生调剂到我们的招生专业方向“中西医结合基础”：中医药与肠道菌群、生物信息学等交叉学科-张成岗的博文http://blog.sciencenet.cn/home.php?

菌心说双脑论·2024-02-15 04:36

2020-04-07

）1.为什么学习linux大多数人用的是可视化界面，便捷的windows，linux用户量比较少，但是需要知道，linux的功能相当的强大，对于数据处理、程序运行方面的优势，那是其它的系统无法比拟的，生物信息学数据处理对电脑要求较高

liuyang2020·2024-02-14 15:21

Python在生物信息学中的应用：有序字典

我们知道，通过{}创建的字典是无序的。如何创建有序字典呢？解决方案可以使用collections模块中的OrderedDict类。当对字典做迭代时，它会严格按照元素添加的顺序进行。例如：from collection import OrderedDictd=OrderedDict()d['1st'] = 1d['2nd'] = 2d['3rd'] = 3d['4th']=4forkeyind:

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-02-14 10:48

Python在生物信息学中的应用：同时对数据做转换和换算

我们需要调用一个换算（reduction）函数，例如sum()、min()、max()等，但首先得对数据做转换或筛选。解决方案一种优雅的方式能将数据换算和转换结合在一起，即在函数中使用生成器表达式。例如，要计算平方和，可以这样：nums=[1,2,3,4,5]s=sum(x*xforxinnums)更多的例子：#Determineifany.pyfilesexistinadirectoryimpo

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-02-14 10:48

Python在生物信息学中的应用：列表推导式

列表中有一些数据，我们想提取或删除某些值，该怎么办？解决方案最简单的方法是使用列表推导式（listcomprehension）。例如：>>>mylist=[1,4,-5,10,-7,2,3,-1]>>>[nforninmylistifn>0][1,4,10,2,3]>>>[nforninmylistifn>>列表推导式的使用需要注意其内存占用，当原始列表比较大时，其内存占用较高，可以使用生成器表达

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-02-14 10:47

最长公共子序列(LCS)

最长公共子序列问题是一个经典的计算机科学问题，也是数据比较程序，比如Diff工具和生物信息学应用的基础。

·2024-02-13 23:57

自学生物信息学

在学习生物信息学之前，我们先来了解一下什么是生物信息学。生物信息学，顾名思义，生物学和信息学的结合。生物学，这个对大家比较简单，基本入生信行的同

gtt儿_生物信息学习·2024-02-12 08:00

我们能成为孩子的上帝吗—— 谁来管理非法行医的贺建奎

贺建奎，原南方科技大学副教授，毕业于美国斯坦福大学，拥有多学科交叉的背景，并在基因测序仪研究，CRISPR基因编辑，生物信息学等多个领域取得研究突破。

闲月农·2024-02-12 06:31

2022-01-27

参考：生物信息学100个基础问题——第1~5题答案公布-知乎(zhihu.com)掌握FASTQ格式特点第2行就是测序得到的序列信息，一般用ATCGN来表示，其中N用于荧光信号干扰无法判断到底是哪个碱基时的代表符号

学习生信的小兔子·2024-02-12 01:29

金域医学：医检行业顶级学术委员会成立，钟南山院士任主席

国内第三方医学检验行业的开拓者和引领者广州金域医学检验集团在广州国际生物岛总部，召开金域医学学术委员会成立大会暨金域学术汇报会由呼吸系统疾病专家、中国工程院院士钟南山出任委员会主席，医学遗传学家、中国工程院院士曾溢滔，生物信息学家

里昂杰森·2024-02-11 02:57

机器学习系列——（十九）层次聚类

层次聚类（HierarchicalClustering）是聚类算法中的一种，以其独特的层次分解方式，在各种应用场景中得到广泛应用，如生物信息学、图像分析、社交网络分析等。

飞影铠甲·2024-02-10 07:47

东南大学-生物信息学

http://www.lmbe.seu.edu.cn/chenyuan/xsun/bioinfomatics/Web/Index.html目录image第1章生物信息学引论第2章生物信息学的生物学基础第

wangchuang2017·2024-02-10 01:12

TCGA新版数据库表达矩阵提取

主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。

医学和生信笔记·2024-02-10 00:22

R语言可视化学习笔记之ggridges包

作者：严涛浙江大学作物遗传育种在读研究生（生物信息学方向）伪码农，R语言爱好者，爱开源。严涛老师的绘图教程还有：gganimate|诺奖文章里面的动图布局教程来了！！

生信宝典·2024-02-09 21:25

microRNA数据库与预测、功能分析软件大全

在microRNA的研究中，生物信息学发挥越来越重要的作用，以下是microRNA相关的数据库与预测、功能分析软件，绝对值得收藏。

Seurat_Satija·2024-02-09 20:51

从列表中删除元素|自学生信Python（第十六天）

写在前面的话：本人是一枚生物学的学生，由于对生物信息学特别感兴趣，于是想自学生物信息学（新手莫怪）。

天明豆豆·2024-02-08 22:40

「转录组」从环境配置之conda

【生物信息学频道bioconda】Anaconda是一个开源的Python发行版本，包含了conda、python等180多个科学包及其依赖项。因为包含了大量

旮旯蜗牛_c299·2024-02-08 21:35

生信绘图：在线绘制序列 Logo 图

它是由生物信息学领域中的生物学家TomSchneider和R.MichaelStephens在1990年首次引入的。序列Logo通过显示序列中每个位置上不同碱

Ningbo_JiaYT·2024-02-08 07:09

理解生物信息学FASTA格式

在生物信息学中，FASTA格式是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来表示，且允许在序列前添加序列名及注释。

陈佶1·2024-02-07 09:36

Cytoscape软件下载、安装、插件学习[基础教程]

关于Cytoscape，对于做组学或生物信息学的同学基本是陌生的，可能有的同学用这个软件作图是非常溜的，做出来的网络图也是十分的好看，“可玩性”很高，就像前面分享的aPEAR包一样aPEAR包绘制功能富集网络图

小杜的生信筆記·2024-02-06 18:28

支持向量机

支持向量机在许多领域都有广泛的应用，如文本分类、图像识别、生物信息学、金融预测等。支持向量机的应用：（1）文本分类：支持向量机可以用于文本分类任务，如垃圾邮件过滤、情感分析、主题分类等。

小森( ﹡ˆoˆ﹡ )·2024-02-05 10:24

基迪奥的新书（基因表达调控-新组学技术介绍与应用）是否值得买？

--谈谈你入门生物信息学时遇到的那些坑先说答案，不值得买。相信很多朋友在新学一门技术时，会通过购入书籍、购买课程等手段来迅速地提高自己的知识储备，笔者也不例外。

浪子刀客·2024-02-05 08:41

【年度盛会征稿】第二届全国精准营养与生命健康创新大会（PNHIC 2024）

“精准营养”研究借助多组学、可穿戴、影像学、生物信息学、人工智能等多种新技术和新理论对不同个体营养状况和需求开展系统研究，提供量身定制的膳食和生活方式干预和指导，从而更有效地促进健康和防控重大疾病。

搞科研的小刘选手·2024-02-04 14:41

文件格式——FASTA

FASTA文件的格式在生物信息学中，FASTA格式（又称为Pearson格式）是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。

oddxix·2024-02-04 03:57

scRNA-seq | Windows下的R、RStudio下载和安装

2020/5/25，下定决心用R语言了，Python虽然顺手但是生物信息学尤其是单细胞测序领域主要还是R的天下。（发现一篇Naturecommunication居然用R调用了Tensorflow！

切瓜少年·2024-02-03 20:37

【C++动态规划学习总结】

1.动态规划：初识动态规划（英语：Dynamicprogramming，简称DP），是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的，通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法

PP mod·2024-02-03 17:30

软件系统架构黄金法则17：图形数据存储架构法则

禅与计算机程序设计艺术·2024-02-03 15:47

200826 Circ之旅3-构建人类基因组索引

注：后面可能还会构建鼠源的x参考：RNA-seq(5):序列比对：Hisat2人类基因组hg19、hg38构建bwa索引生物信息学习——bowtie2使用手册bwabowtie2salmonsubreadhisat2

dicklim·2024-02-03 15:13

卡梅计算机生物专业怎么样,美国卡梅生物信息学专业录取案例

Carnegiemellonuniversity卡耐基梅隆大学computationalbiology计算机生物学Universityofmichigan,annarbor密歇根大学安娜堡分校bioinformatics生物信息学

weixin_39683863·2024-02-02 04:14

2020-02-25 Day30 利用生物信息学分析鉴定乳腺癌的潜在关键基因和关键通路

在本研究中，我们旨在通过公共数据集的生物信息学分析来鉴定乳腺癌中潜在的病原性和预后差异表达基因（DEG）。

卅衣·2024-02-01 15:13

《生物信息学：导论与方法》--新一代测序NGS：转录组分析RNA-Seq--听课笔记（十四）

第八章新一代测序NGS：转录组分析RNA-Seq8.1转录组介绍Atranscriptomeisacollectionofallthetranscriptspresentinagivencell.所谓转录组（transcriptome），是指特定细胞中全体转录本（transcript）的集合。也可以说是细胞特定时刻基因表达谱的一个快照（snapshotofexpressionprofile）在转录

盲人骑瞎马5555·2024-02-01 12:52

《生物信息学：导论与方法》----变异的功能预测----听课笔记（十一）

第六章变异的功能预测6.1问题概述Wheredidyourgeneticvariationscomefrom?inheritedfromparentsdenovomutations（70~100个新发突变）somaticmutations（体细胞突变，如癌症）有很多的先天的小儿疾病，就是这个孩子有一个Denovomutation，刚好落在了一个重要的基因上，它有可能有这种严重的疾病。肿瘤细胞一般都

盲人骑瞎马5555·2024-02-01 12:21

生信学习笔记1：学习如何用OPLS-DA分析代谢组数据（从入门到掌握）

它们广泛应用于化学计量学、生物信息学、经济预测等领域。偏最小二乘法（PLS）偏最小二乘法是一种多变量分析方法，主要用于找到两组数据（通常是预测变量集和响应变量集）之间的线性关系。

盲人骑瞎马5555·2024-02-01 12:18

隐马尔可夫模型系列——（二）模型参数

隐马尔可夫模型在自然语言处理、语音识别、生物信息学和金融领域等方面有着广泛的应用。本文将从模型参数的角度详细介绍隐马尔可夫模型中的三个关键要素：隐藏状态、观测状态和状态转移

飞影铠甲·2024-02-01 02:35

2021-12-27

NatRev丨癌症基因组测序数据的计算分析原创珍奇图灵基因2021-12-2707:03收录于话题#前沿生物大数据分析撰文：珍奇IF：60.716推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本文描述了癌症基因组生物信息学分析中涉及的主要步骤

图灵基因·2024-01-31 23:49

特征选择综述论文阅读笔记

一特征选择（featureselection）的简介我们现在正处在大数据的时代，大量的高维数据在各种领域中无处不在，如社交媒体、医疗保健、生物信息学和在线教育。

wyn20001128·2024-01-31 01:23

LINUX的练习题

LINUX的练习题：最低要求是完成我的linux20题http://www.bio-info-trainee.com/2900.html其次完成生物信息学数据格式的习题(blast/blat/fa-fq

七七师姐·2024-01-31 00:14

生物信息网站集合

1.常用门户：美国国家生物技术信息中心(NCBI)：https://www.ncbi.nlm.nih.gov欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)：https://www.ebi.ac.ukUCSCGenome

庐山星晖·2024-01-30 16:27

ChatGPT如何为初学者进入生物信息学领域赋能？

也引发了人们对它们在促进编程重数据分析方面的潜在用途的巨大兴趣，如生物信息学。凭借其卓越的会话和编程能力（例如rtour.ai网站），ChatGPT有望帮助学生克服编程障碍。

qq_37303241·2024-01-30 10:44

使用 ChatGPT 为生物信息学初学者赋能

论文：EmpoweringBeginnersinBioinformaticswithChatGPT.2023对于生信初学者而言，最大的困难是身边没有经验丰富的人给予指导。而ChatGTP的出现可能改变这一现状，学生可以自己作为导师，指导ChatGPT完成数据分析工作。众所周知，与ChatGPT互动，给予的指令越精确，那么它给出的答案越精准。这篇论文提出一个与ChatGPT互动的模型：OPTICAL

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-30 10:13

2018.8.9

玉米粥土豆春卷大绿砖曲折的生物学学长结果是生物信息学纠结来纠结去很辣的辣子鸡美美的午觉破釜沉舟的决心吧桃子核桃打打气刚刚好的生活刚刚到的快递港澳通行证签证凉面烤奶微生物打卡保持明天开始独立实验了不需要人陪

珍惜眼前始为真·2024-01-30 09:14

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