相关软件
参考：
GMT参考手册
GMT4
SAC学习笔记（一）——SAC安装
1.SAC的安装
1.1 下载软件包：科大镜像
1.2 安装：
$tar zxvf sac-101.6a-linux_x86_64.tar.gz
$sudo cp -r sac /usr/local
1.3 设置环境变量
$ vi ~/.bashrc
# 添加以下内容
# 设置SACHOME环境变量
export SACHOME=/usr/local/sac
# 设置SACAUX环境变量
export SACAUX=$SACHOME/aux
#设置SAC目录下的bin目录到PATH环境变量
export PATH=$SACHOME/bin:$PATH
1.4 应用设置
$ source ~/.bashrc
1.5 启动
$ sac
SEISMIC ANALYSIS CODE [11/11/2013(Version101.6a)]
Copyright1995Regents of the University of California
SAC>
2.GMT4安装
1.下载
gmt-4.5.15-src.tar.bz2
gshhg-gmt-2.3.6.tar.gz
2.依赖
sudo yum install gcc gcc-c++ make glibc
sudo yum install netcdf netcdf-devel gdal gdal-devel gdal-python
3.X相关库——xgridedit
sudo yum install libXaw-devel
sudo yum install libICE-devel libSM-devel libX11-devel
sudo yum install libXext-devel libXmu-devel libXt-devel
4.安装
tar -xvf gmt-4.5.15-src.tar.bz2
cd gmt-4.5.15
./configure --prefix=/opt/GMT-4.5.15
make
sudo make install-all
5.安装海岸线
cd../
tar -xvf gshhg-gmt-2.3.6.tar.gz
sudo mv gshhg-gmt-2.3.6 /opt/GMT-4.5.15/share/coast
6.环境变量
向~/.bashrc加入：
export GMT4HOME=/opt/GMT-4.5.15
export PATH=${GMT4HOME}/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}:${GMT4HOME}/lib64#取决于系统版本32或64
刷新终端：
exec $SHELL-l
也可以
echo ''>>~/.bashrc
7.测试
psxy
显示：
psxy 4.5.15 [64-bit] - Plot lines, polygons, and symbols on maps
8.CentOS 下查找哪个软件包提供某个特定库文件：
yum provides libICE.so.6
2.1 pssac安装
# 下载基于 GMT4.0 的 pssac 包
$ wget http://www.eas.slu.edu/People/LZhu/downloads/pssac.tar
$ tar -xvf pssac.tar# 解压
# 下载基于 GMT4.5 的 pssac 源码
$ wget http://www.eas.slu.edu/People/LZhu/downloads/pssac.c
$ mv pssac.c pssac/# 用基于 GMT4.5 的 pssac.c 替换基于 GMT 4.0 的 pssac.c
$cd pssac
修改Makefile：GMTHOME改为自己的路径
GMTHOME=/opt/GMT-4.5.15
GMT_INC=-I${GMTHOME}/include
GMT_LIBS=-L${GMTHOME}/lib -lgmt -lpsl -lgmtps -lnetcdf -lm
CFLAGS = -O ${GMT_INC}
pssac: pssac.o sacio.o
$(LINK.c) -o $@ [email protected] sacio.o $(GMT_LIBS) #此行前要制表符，删除本注释
clean:
rm -f pssac *.o#此行前要制表符，删除本注释
再make一下，编译完pssac复制到gmt环境变量中，比如：
sudo cp pssac /opt/GMT-4.5.15/bin/
直接执行pssac可见参数提示。
3.GMT5的安装
为了使用最新版本的 GMT，建议用户从源码编译 GMT。
3.1依赖关系
#必须安装的包：
$ sudo yum install gcc gcc-c++ cmake make glibc
$ sudo yum install ghostscript
$ sudo yum install netcdf-deve
l# 可选包
$ sudo yum install gdal-devel gdal-python
$ sudo yum install lapack64-devel lapack-devel
$ sudo yum install glib2-devel
$ sudo yum install pcre-devel
$ sudo yum install fftw-devel
确认netCDF 支持 netCDF-4/HDF5 格式:若输出为yes则可正常安装 GMT，否则无法正常安装。
$ nc-config --has-nc4
yes
3.2源文件下载：科大镜像
GMT源码：http://mirrors.ustc.edu.cn/gmt/gmt-5.3.3-src.tar.gz
全球海岸线数据GSHHG：http://mirrors.ustc.edu.cn/gmt/gshhg-gmt-2.3.6.tar.gz
全球数字图表DCW：http://mirrors.ustc.edu.cn/gmt/dcw-gmt-1.1.2.tar.gz
3.3安装
# 解压三个压缩文件
$ tar -xvf gmt-5.3.3-src.tar.gz
$ tar -xvf gshhg-gmt-2.3.6.tar.gz
$ tar -xvf dcw-gmt-1.1.2.tar.gz
# 将gshhg和dcw数据复制到gmt的share目录下
$ mv gshhg-gmt-2.3.6 gmt-5.3.3/share/gshhg
$ mv dcw-gmt-1.1.2 gmt-5.3.3/share/dcw-gmt
# 切换到gmt源码目录下
$cdgmt-5.3.3
新建用户配置文件
$ vi cmake/ConfigUser.cmake
向其中写入：
set(CMAKE_INSTALL_PREFIX"/opt/GMT-5.3.3")#设置GMT的安装路径，可以修改为其他路径。对于没有 root 权限的用户，可以将安装路径设置为/home/xxx/software/GMT-5.3.3等有可读写权限的路径；
set(GMT_INSTALL_MODULE_LINKS FALSE)#FALSE，表明不在GMT的bin目录下建立命令的软链接，也可设置为TRUE
set(COPY_GSHHG TRUE)#TRUE会将GSHHG数据复制到GMT/share/coast下
set(COPY_DCW TRUE)#TRUE会将DCW数据复制到GMT/share/dcw下
set(GMT_USE_THREADS TRUE)#表示开启某些模块的并行功能
3.4继续检查GMT的依赖关系:
# 注意，此处新建的 build 文件夹位于 gmt-5.3.3 目录下，不是 gmt-5.3.3/cmake 目录下
$ mkdir build
$cdbuild/
$ cmake ..#检查GMT对软件的依赖关系
参考结果如下：
* Options:
* Found GSHHG database : /home/user/GMT/gmt-5.3.3/share/gshhg (2.3.6)
* Found DCW-GMT database : /home/user/GMT/gmt-5.3.3/share/dcw-gmt
* NetCDF library : /usr/lib64/libnetcdf.so
* NetCDF include dir : /usr/include
* GDAL library : /usr/lib64/libgdal.so
* GDAL include dir : /usr/include/gdal
* FFTW library : /usr/lib64/libfftw3f.so
* FFTW include dir : /usr/include
* Accelerate Framework :
* Regex support : PCRE (/usr/lib64/libpcre.so)
* ZLIB library : /usr/lib64/libz.so
* ZLIB include dir : /usr/include
* LAPACK library : yes
* License restriction : no
* Triangulation method : Shewchuk
* OpenMP support : enabled
* GLIB GTHREAD support : enabled
* PTHREAD support : enabled
* Build mode : shared
* Build GMT core : always [libgmt.so]
* Build PSL library : always [libpostscriptlight.so]
* Build GMT supplements : yes [supplements.so]
* Build GMT Developer : yes
* Build proto supplements : none
*
* Locations:
* Installing GMT in : /opt/GMT-5.3.3
* GMT_DATADIR : /opt/GMT-5.3.3/share
* GMT_DOCDIR : /opt/GMT-5.3.3/share/doc
* GMT_MANDIR : /opt/GMT-5.3.3/share/man
-- Configuring done
-- Generating done
正常情况下的检查结果应该与上面给出的类似。若出现问题，则需要检查之前的步骤是否有误。
编译和安装：
$ make
$ sudo make install
可以并行以加快速度：
$ make -j
$ sudo make -j install
3.5环境变量
$echo'export GMT5HOME=/opt/GMT-5.3.3'>> ~/.bashrc
$echo'export PATH=${GMT5HOME}/bin:$PATH'>> ~/.bashrc
$echo'export LD_LIBRARY_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}:${GMT5HOME}/lib64'>> ~/.bashrc$exec$SHELL-l
3.6测试
终端输入：
$ gmt --version
5.3.3
安装成功，命令行使用时在命令前加gmt 。
4. Paraview
4.1 下载预编译包
运行/ParaView-5.4.0-Qt5-OpenGL2-MPI-Linux-64bit/bin/paraview即可使用。
4.2 创建快捷方式
进入/usr/share/applications，将Shotwell图标复制到桌面，修改其名称指向即可，可以自己编辑图标，再复制一份到应用文件夹，这样在开始菜单的图形分类中将出现Paraview。
点击桌面图标即可使用。
当然也可以手动编辑.desktop文件，提供一份模板：
Version=1.0
Encoding=UTF-8
Name=sqldeveloper
Type=Application
Terminal=false
Name[en_US]=sqldeveloper
Exec=/u01/app/oracle/product/11.2.0/db_1/sqldeveloper/sqldeveloper.sh
Comment[en_US]=Oracle 11g R2 integrated IDE.
Comment=Oracle 11g R2 integrated IDE.
GenericName[en_US]=
Icon=/u01/app/oracle/product/11.2.0/db_1/sqldeveloper/icon.png
修改Name,Exec,Comment，Icon即可。