CentOS下安装CDO（climate data operator）

2018年2月13日更新
当使用anaconda时，可以直接使用编辑好的cdo进行安装，但这里也存在一个问题，当使用cdo处理grib1和grib2混合的文件（傲娇的欧洲中心）时会出错，这个原因也比较容易找到就是使用了不同的库处理这两种类型，eccodes或者gribapi处理grib2，另外一个库叫不上名字了处理grib1，因此除了问题，暂时也没有找到合适的解决方案。因此使用anaconda安装需要考虑到这种风险。

     conda install cdo
     # 前提是配置好国内镜像，否则只能使用官方源（只要能够忍受下载速度）
     conda install -c conda-forge cdo

1. 对于新安装的centos，需要更新系统，第一步配置国内源，推荐使用中科大或者清华，这里使用中科大。

中科大开源镜像

具体参考配置方法：CentOS配置。完成后更新系统

sudo yum update

随后加入官方额外源；可参考博客

sudo yum install epel-release

2. 上述步骤配置后安装基本包

sudo yum install nco netcdf netcdf-devel hdf hdf-devel hdf5 hdf5-devel grib_api grib_api-devel

3. 下载最新版cdo

cdo主页-进入下载链接

直接进行安装
./configure --with-netcdf=/usr --with-hdf5=/usr --with-grib_api=/usr
make; sudo make install

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完成后可直接使用，输入

cdo -V

# output
Climate Data Operators version 1.9.2 (http://mpimet.mpg.de/cdo)
Compiled: by ABCD on centos7 (x86_64-unknown-linux-gnu) Nov 25 2017 09:21:36
CXX Compiler: g++ -std=gnu++11 -g -O2 -fopenmp 
CXX version : g++ (GCC) 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-4)
C Compiler: gcc -std=gnu99 -g -O2 -fopenmp 
C version : gcc (GCC) 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-4)
F77 Compiler: gfortran -g -O2
F77 version : GNU Fortran (GCC) 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-4)
Features: 3GB Fortran DATA PTHREADS OpenMP3 HDF5 NC4/HDF5 OPeNDAP SSE2
Libraries: HDF5/1.8.12
Filetypes: srv ext ieg grb1 grb2 nc1 nc2 nc4 nc4c 
     CDI library version : 1.9.2 of Nov 25 2017 09:18:26
 CGRIBEX library version : 1.9.0 of Sep 29 2017 10:16:02
GRIB_API library version : 1.12.3
  NetCDF library version : 4.3.3.1 of Dec 10 2015 16:44:18 $
    HDF5 library version : 1.8.12
 SERVICE library version : 1.4.0 of Nov 25 2017 09:18:13
   EXTRA library version : 1.4.0 of Nov 25 2017 09:18:08
     IEG library version : 1.4.0 of Nov 25 2017 09:18:11
    FILE library version : 1.8.3 of Nov 25 2017 09:18:08