简介：
SILVA一词起源于拉丁文silva（意为forest），它是一个包含三域微生物（细菌、古菌、真核）rRNA基因序列的综合数据库，其数据库涵盖了原核和真核微生物的小亚基rRNA基因序列（简称SSU，即16S和18SrRNA）和大亚基rRNA基因序列（简称LSU，即23S和28SrRNA）。目前其最新数据库版本为SILVA SSU andLSU databases 128，更新时间为2016年9月29日，最新版本数据库包含的数据信息见下表1所示。
表1SILVA SSU andLSU databases 128数据库基本参数信息
SSU参考序列SSU非冗余参考序列LSU总序列LSU参考序列
版本128128128128
总序列1,922,213645,151735,238154,297
细菌1,719,541552,377176,194130,965
古菌64,39024,31515281271
真核140,02068,996557,76922,105
可培养36,74736,74724,6648232
模式株22,33422,33458094675
因为SILVA数据库更新比较及时，因此是目前rRNA基因高通量测序后最常选用的参考数据库之一。此外，SILVA也可被用于平时菌种鉴定时，对少量rRNA基因测序后的物种进行分类鉴定，此时主要用其SINA Alignment Service功能（https://www.arb-silva.de/aligner/），可非常方便地确定某条rRNA基因序列从门到属/种水平的分类信息并给出各分类水平相应的置信度。
主页：
https://www.arb-silva.de/
菌种鉴定方法:
1.选择序列搜索。
2.输入fasta格式的序列
3.搜索结果如下，可将结果导出，方便查看。
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