【可视作图】VMD蛋白质三级结构可视化

VMD软件下载

一 个 功 能 同 样 强 大 的 免 费蛋 白 质 三 维结 构可 视 化软 件VMD(http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd)。

VMD 由伊利诺伊大学研发。下载 VMD 需要先注册获得一个账户,之后就可以根据你的操作系统和机器配置选择合适的版本下载了。当然,如前所述,注册和下载对于非商业用途的用户都是免费的。VMD 的安装也极其简单。不需要预装任何语言环境,完全图形化安装过程,绝对可以轻松搞定。

【可视作图】VMD蛋白质三级结构可视化_第1张图片
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文件来源

导入软件安装路径下的Protein的示例文件


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3D结构展示

可以同鼠标进行拖动,缩放,旋转


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图片调整

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如按氨基酸的种类,VMW,进行示例


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如newcartoon


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图片叠加

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叠加显示4个谷氨酸


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给蛋白质外观加肉
显示GLSL显示模式


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图层增删

双击某个显示图层,则变红,隐藏。再双击则恢复


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图片保存

保存当天模式图片,保存路径全英文,vmd文件格式,为纯文本文件。


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vmd文件导入

可以直接显示已保存前的模式图片

将图片背景设为白色

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取消坐标轴

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鼠标模式设为原子

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原子标记设为黑色

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移动原子位置

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删除%a,不显示原子

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调整标签大小粗细

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