高福团队在《新英格兰医学杂志》发表新型冠状病毒论文

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2019年12月,中国武汉出现了一群与海鲜批发市场有关的不明原因导致的肺炎患者。通过对肺炎患者的样本进行全基因组测序发现了一种从未见过的乙型冠状病毒属(betacoronavirus)病毒。该病毒从感染者气道上皮细胞中分离出,随后将其命名为2019-nCoV,这种病毒归属于Sarbe病毒亚属,正冠状病毒亚科,但形成了另外一簇的进化分枝。2019-nCoV与MERS-CoV和SARS-CoV都不同,它成为可以感染人类的冠状病毒科中的第七个成员。随着新型冠状病毒进一步扩散,中国和世界各地的科学家们正齐心协力集结起来对病毒展开攻坚研究,开辟出医院以外对抗病毒的“第二战场”。

尽管2019-nCov与蝙蝠体内分离到的乙型冠状病毒相似,但是与SARS冠状病毒和MERS冠状病毒有明显不同。这3份来自武汉的2019 新型冠状病毒与2份来自蝙蝠体内的SARS样病毒株ZC45,ZXC21 形成了Sarbe 冠状病毒亚属B谱系中一个新的分枝;来自人体的SARS冠状病毒则与中国西南部蝙蝠体内分离到SARS样冠状病毒共同形成了Sarbe冠状病毒亚属的另外一个分枝。

2019-nCoV和-冠状病毒在保守区域复制酶(ORF 1ab)序列一致性方面没有达到90%,因此2019年武汉病毒性肺炎的可能病原体2019-nCov是一种新型乙型冠状病毒,属于冠状病毒科中的Sarbe冠状病毒亚属。

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2019-nCoV和正冠状病毒亚科中其他乙型冠状病毒基因系统发育树分析图

多年来,分子技术已被成功运用于鉴定感染源,全基因组高通量测序是发现病原体的有力工具。二代测序和生物信息学正在改变我们应对传染病暴发的方式,提高了我们对疾病发生和传播的理解、加速病原体的鉴别和促进数据的共享。我们在这篇报道中描述了利用分子技术和全基因组测序发现的一种新型冠状病毒,它可能是导致中国武汉3例重症肺炎的元凶。

虽然建立人气道上皮细胞培养方法是费时费力的工作,但它是分析人呼吸道病原体的重要研究工具。我们的研究表明,先在人气道上皮细胞培养物上增殖呼吸道分泌物,再用透射电镜和全基因测序分析培养上清物,成功地观察和检测到了新的人冠状病毒,这可能是传统方法无法做到的。

我们还需要进一步建立可准确、快速鉴别呼吸道未知病原体的方法。基于在此研究中得到的3条完整基因组,我们设计了几个针对2019-nCoV基因组的ORF1ab、N和E区域的特异和敏感的检测,可以检测出临床样本中的病毒RNA。引物集和标准操作程序已与世界卫生组织共享,用于在全球和中国监测和检测2019-nCoV感染。最新的数据显示,中国已有830人检测出2019-nCoV。

高效率的人传人是这一新病毒发生大规模传播的必要条件。然而,如果病毒感染不会引起严重疾病,感染者很可能不会就医。相反,他们可能会去工作和旅行,从而可能将病毒传播给接触者,甚至可能发生国际传播。如果许多感染者并无症状或仅有轻度症状(假设这些人能够传播病毒),那么确定传播链和追踪后续接触者将变得复杂得多。

目前尚不知晓在病毒人际传播能力的整个范围内,2019-nCoV新病毒落在何处。但基本上可以认定,如果该病毒可高效传播,则其相对于SARS而言看似较低的致病性可能反而会导致大规模传播。这样,在个体层面构成较低健康威胁的病毒可在人群层面构成较高风险,有可能造成全球公共卫生系统的破坏和经济损失。

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