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TCGA-204-使用firehose网页工具

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ucsc中的xena整理的数据非常全，但这个浏览器只能做感兴趣的一个一个基因，当我们没有感兴趣的基因怎么办呢？

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  • 谷歌搜索-firehose tcga-了解这个工具的用法

接下来介绍BROAD

  • 非点对点分析，把东西分析好自己观察，找到感兴趣的，同一部位的癌症有的会联合在一起（如COADREAD）。有些mormal病人也会被纳入。

  • 点击analysis下的 browse，会列出相当于xena网页工具中列出的一个基因的不同信息，包括DNA突变、拷贝数变，RNA测序的不同的不同计数的表达量。两种Browser方式（analysis和data）：如下

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  • 点击analysis下的Browse
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可以把数据下载下来作为xena数据库的补充

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同时也可以通过下面的过程看到1098个BRCA的报告

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再举个

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进入xena网页，验证一下看是否相关性这么大，回到xena

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