Varona1999预测亲本显性组合

Varona, L., and Misztal, I. 1999. Prediction of Parental Dominance Combinations for Planned Matings, Methodology, and Simulation Results. J. Dairy Sci. 82(10): 2186–2191. Elsevier. doi:10.3168/jds.S0022-0302(99)75463-9.

优势信息的最佳使用需要一个交配系统，并为每一组准父母预测具体的组合能力。目前的评估程序仅为有限的父母提供这样的预测。描述一个程序，预测任何父母的具体组合能力。在这个过程中，对于每一组父母及其祖先，加性关系矩阵被创建为一个密集矩阵。然后使用该矩阵以稀疏矩阵形式创建父母优势矩阵，其中矩阵的行对应于已经可用的预测的所有父母组合。每一个新的预测都需要方程组解的方程组，左边是父母优势矩阵。在一个模拟研究中评估了占优势的交配系统的效率。模拟的数据文件在所选择的男性和女性的比例，通过胚胎移植产生的牛的比例以及加性和显性方差中变化。父本和父母只是基于附加的优点而被预先选定的，但是基于组合的加和优势优势来安排具体的交配。考虑到优势的选择响应从一代添加剂选择的响应从3.8增加到16.6％。当加性方差较小时，显性方差较大，加性选择强度较低，全同胞比例较大。在交配系统中使用优势是可行的，并导致对选择的额外遗传响应。 （关键词：优势，遗传反应，交配系统）

介绍

数量性状的遗传变异可以分为加性和非加性效应（5）。在传统的选择方案中，加性的选择被用来改善家畜生产，选择的方法通常是基于BLUP（8）。在目前用于选择的模型中，非加性变异被忽略，因为在模型中包括这些效应的大计算需求，没有非加性遗传变异的证据，以及非加性关系的低发生率。
优势可以在选择模型中考虑。 Hoeschele和​​VanRaden（10）开发了一个程序，以相对较低的成本直接创建优势关系矩阵的逆矩阵。 Misztal（12）制定了计算优势解决方案的程序，其费用低于附加遗传评估的两倍。该过程与方法R（14）一起允许估计大数据集中的优势变异。随后的研究估计，在奶牛（13），肉牛（6）和猪（3）的类型和生产性状的表型变异的4％到12％处存在显性差异。在模型中包含显性可以提供对模型加性效应评估的边际改善（1,15），并允许通过使用特定组合能力的预测来选择个体之间的交配（4）。
组合能力的选择需要预测种群中所有可能父母的亲本组合。然而，根据目前的评估程序，只有与数据直接相关的父母组合是可用的（10,12）。这项研究的第一个目标是开发一个程序来预测以前计算的父母组合。
选择组合能力的增益取决于优势和其他方差，群体结构和选择强度。这种收益已经用父系模型（4）进行了研究，但与动物模型无关。第二个目标是通过用动物模型进行模拟来评估遗传反应的潜在增益。