明朝著作《天变邸抄》中记载了明天启六年五月初六日在北京西南隅王恭厂发生的一次神秘爆炸。据后人估算，此次爆炸的威力相当于一万至两万吨TNT，然而当时王恭厂存放的火药总数不过数万斤。那么这场爆炸的真相是怎样的呢？
这要从明朝张居正推行新政说起，在军事方面张居正启用戚继光进行军事改革，并设立专门机构对火器进行研制，负责对正德年间利用欧洲技术制造的弗朗机等火器进行改良，此神秘机构一直延续到天启四年，因为东林党人杨涟入狱，此机构失去支持，并入锦衣卫，由魏忠贤管辖。
该机构一直进行一项秘密研究，便是核试验，实验地区设立在山西大同附近。当蒙古俺答被明朝封为顺义王，明蒙之间缔结“隆庆和议”后，结束了长达二百多年的战争状态。大同地区没有了蒙古人的骚扰，并且矿产丰富，其中也包括铀矿，明朝称其为雷石，据传是几个戍边的将士发现了这种石头，以为是金矿，在进行溶质时发生爆炸，此次事件被当作地震记载下来，但万历八年(1580年)，“大同瘟疫大作，十室九病，传染者接踵而亡，数口之家，一染此疫，十有一二甚至阖门不起者”。其实这并非鼠疫，而是核爆炸后的核辐射所导致的现象，朝廷开始重视此事，并派人调查，后来发现了“铀”这种物质。此机构便一直在大同附近开采铀矿并进行秘密核试验。
此机构一直由兵部支持，在天启元年(1621)后金破沈阳，熊廷弼被召入京并被魏忠贤等阉党迫害致死后，次机构也受到沉重打击，之后天启四年杨涟参魏忠贤二十四大罪，被魏忠贤逮捕入狱，与左光斗遭酷法拷讯，五日后，惨死狱中。此机构也因失去东林党支持彻底并入锦衣卫。
锦衣卫北镇抚使许显纯令该机构上报研究成果，并将所发现的雷石(即铀)代到京城，在王恭厂密室中查看雷石时，发生了爆炸，好在所上缴的雷石很少，刚刚达到爆炸极限，所以并为引起极大损失，但知道这一秘密研究的人都在这场爆炸中丧命，使得该技术没能流传下来。不然，中国可能会提早300年成功研制出×××，但显然×××的威力不是当时人类可以控制的，如果明朝真的研制成功，用来对付蒙古，后金和倭寇，恐怕并非是一件幸事，到时候可能全人类都会受到威胁，王恭厂所发生的大爆炸，使得明朝核技术也付之一炬，塞翁失马，焉知非福，或许这爆炸是幸运才对......

    《天变邸抄》对这次灾变的描述是：天启丙寅五月初六日巳时(天启丙寅即天启六年)，天色皎洁，忽有声如吼，从东北方渐至京城西南角，灰气涌起，屋宇动荡。须臾，大震一声，天崩地塌，昏黑如夜，万室平沉。东自顺城门大街(今宣武门内大街)，北至刑部街(今西长安街)，西及平则门(今阜城门)南，长三四里，周围十三里，尽为齑粉，屋以数万计，人以万计。这次爆炸中心的“王恭厂一带糜烂尤甚，僵尸层叠、秽气熏天……”

    正在爆炸中心范围内，走在街上的官员薛风翔、房壮丽、吴中伟的大轿被打坏，伤者甚众，工部尚书董可威双臂折断，御史何廷枢、潘云翼在家中被震死，两家老小“覆入土中”，宣府杨总兵一行连人带马并长班关7人没了踪影。承恩寺街上行走的女轿，事后只见轿俱被打坏在街心，女客和轿夫都不见了。更有甚者，炸飞的“大木远落密云”，石驸马大街上有一5000斤重的大石狮竟被掷出顺成门(今宣武门)外。中心区以外也受到强烈的冲击波影响，皇上感到大震，起身便冲出乾清宫直奔交泰殿，(情急间)“内侍俱不及随，止(只)一近侍掖之而行”，这时“建极殿槛鸳瓦飞堕”，正中近侍头部、脑浆迸裂，而“乾清宫御座、御案俱翻倒”，正修建大殿的工匠，因“震而下堕者二千人，俱成肉袋”。

    小说《梼杌闲评》第四十回对这次爆炸的描绘是：到了五月六日巳刻，京师恰也作怪——京城中也自西北起，震天动地如霹雳之声，黑气冲天，彼此不辨。先是萧家堰，西至平则门、城隍庙，南至顺城门，倾颓房屋平地动摇有六七里，城楼、城墙上砖瓦如雨点飞下……