conda的安装（2018-5-24）

官方链接：https://conda.io/miniconda.html

相当于一个应用商店

1. Ubantu16.04，电脑64位，安装

wget -c  https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

2. gunzip 解压缩

3. bash 软件

4. 选项中添加环境变量选yes

5. source ~/.bashrc

使用命令

conda install --

conda remove --

conda update --

需要添加源：

conda config --add channels r

conda config --add channels bioconda

conda config --add channels conda-forge

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

之后的很多软件都是使用conda安装：

拼接工具：Trinity软件

表达定量工具：RSEM

bowties、samtools

参考：

用Miniconda，Bioconda来安装常见的生物信息学软件 | 生信菜鸟团 [http://www.bio-info-trainee.com/1906.html]；

http://www.biotrainee.com/thread-838-1-1.html。