IGC 数据库

https://db.cngb.org/microbiome/genecatalog/genecatalog_human/

人肠道参考基因集
2010年，人体肠道菌群宏基因组参考基因集的构建工作发表于 Nature 杂志。该研究从124个欧洲人肠道菌群中，一共得到了 14,048,045 个ORF，鉴定到 3.3M 个非冗余的人体肠道宏基因组参考基因。该基因集包含了该人群队列中绝大多数已知的人体肠道微生物基因和大量未知的微生物基因。根据这个基因集预估人肠道中存在约 1000 到 1150 种细菌，平均每个体内约含有 160 种优势菌种。五年后（2014），在新发布的宏基因组测序数据的基础上，研究人员根据来自三个大洲，共1267个人体肠道微生物样本，结合 511 个肠道相关的原核生物基因组信息，构建了一个包含约 9.9M 个基因的高质量人类肠道微生物基因集数据库（Integrated genecatalog, IGC）。