keaidelele
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这是很多蛋白质的文件，格式是.fa

以下是样本文件

SRS011105_WUGC_scaffold_1
AAACCGCCACTCCTTATTATTATAAAGTATATCTTGCAGAGCATGATGTAGTGACAGAAA
TGGCTCCAACCGAGCGTGCCGTTCTTTTCCGTTTCACTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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SRS011105_WUGC_scaffold_2
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TCTTCATCGACGAATACGACCACTTCACCAACG
SRS011105_WUGC_scaffold_3
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ATCCGTTTTCTATTAAAAGAAGATACAAAAACTCTTGATGAAGTGGTAGTCATTGGATAC
GGTGTACA
SRS011105_WUGC_scaffold_4
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SRS011105_WUGC_scaffold_5
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CCCACAGAAAAAGACT
SRS011105_WUGC_scaffold_6
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ATTAATCTGTCAGCACCTAAAGAA
SRS011105_WUGC_scaffold_7
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SRS011105_WUGC_scaffold_8
GGAAGTATGCCTGTTCAATATGTACTTCAGGCTACCAATTTGGAAAAGTTGGAAGAAGTG
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATATTGCTCAAACGCTGCAATATGGATTGAGCGG
TCAGCGTATGGGATATTTCTATATGAACGGTAAGCAATATGAGAT
SRS011105_WUGC_scaffold_9

Anterior_nares_Baylor.agp
在Baylor的agp下面采用了SOAPdenovo
关于SOAPdenovo的使用说明
关于SOAPdenovo的安装

Generated from SOAPdenovo assembly file/data4/HMP_BodySite_Asm/Anterior_nares/SOAP_asm/Anterior_nares_Baylor.scafSeq using script /data3/HMP_WGS_Asmpipe/bin/fasta2apg.pl

Anterior_nares_Baylor_scaffold_82 1 100 0 W Anterior_nares_Baylor_1 1 100 +
Anterior_nares_Baylor_scaffold_82 101 125 1 N 25 fragment yes
Anterior_nares_Baylor_scaffold_82 126 364 1 W Anterior_nares_Baylor_2 1 239 +
Anterior_nares_Baylor_scaffold_140 1 100 2 W Anterior_nares_Baylor_3 1 100 +
Anterior_nares_Baylor_scaffold_140 101 105 3 N 5 fragment yes
Anterior_nares_Baylor_scaffold_140 106 969 3 W Anterior_nares_Baylor_4 1 864 +
Anterior_nares_Baylor_scaffold_147 1 100 4 W Anterior_nares_Baylor_5 1 100 +
Anterior_nares_Baylor_scaffold_147 101 133 5 N 33 fragment yes
Anterior_nares_Baylor_scaffold_147 134 735 5 W Anterior_nares_Baylor_6 1 602 +
Anterior_nares_Baylor_scaffold_174 1 744 6 W Anterior_nares_Baylor_7 1 744 +
Anterior_nares_Baylor_scaffold_214 1 359 7 W Anterior_nares_Baylor_8 1 359 +
Anterior_nares_Baylor_scaffold_214 360 361 8 N 2 fragment yes
Anterior_nares_Baylor_scaffold_214 362 546 8 W Anterior_nares_Baylor_9 1 185 +
Anterior_nares_Baylor_scaffold_219 1 100 9 W Anterior_nares_Baylor_10 1 100 +
Anterior_nares_Baylor_scaffold_219 101 101 10 N 1 fragment yes
Anterior_nares_Baylor_scaffold_219 102 438 10 W Anterior_nares_Baylor_11 1 337 +

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