DISEASES | 周更的基因-疾病关联数据库

写在前面

https://diseases.jensenlab.org/Search
DISEASES 每周更新，它集成了来自自动文本挖掘、手工整理的文献、癌症突变数据和全基因组关联研究的疾病基因关联证据。

可以根据基因（疾病）名称，查询到相关的疾病（基因）。并且有相应的文献链接。有的数据来自其他数据库，有的来自文本挖掘（需要看文献确认）。
针对不同来源的数据，会给出一个统一的score值，5颗星星代表可信度最高，1颗星星则可信度最低。

简单操作

• 在网站输入基因或疾病名称，比如ApoE
  
  

  ApoE

• 点击第一个ApoE进去，可以看到该基因相关疾病、数据来源、分值。
  其中数据有三个来源，分别是Text mining (数据挖掘，需要进一步根据文献确认)、Knowledge（其他数据库）、Experiments（其他数据库）
  

  

  相关疾病
  
  
  

  相关疾病

• 点击Text Mining中对应疾病名称，可以看到疾病介绍及相关文献。建议看下文章摘要确认是否真的有相关性，如果摘要中有相应的基因名会被自动标注出来。
  

  

  文献参考

• 点击Knowledge和Experiments相应的疾病，会跳转到对应数据库。

• 同理，输入疾病名称，如Alzheimer's disease，则会出现与该疾病相关的基因名称。数据来源也是三种。
  

  

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