「Debug R」报错"unable to find an inherited method for function"是如何产生的

在一个群里看到这样一条报错，截图如下:

报错信息

当然这种问题解决起来也很快，无非就是把报错信息复制出来放在搜索引擎上，只不过你要挑选合适的搜索引擎。

百度

谷歌

必应

解决方案就是用dplyr::select。

虽然报错解决了，但是我还想着要重复出这个报错。因为只有能重复出报错，才能证明你不是运气好才解决。（就和Windows上出错靠重启，不行就重装，再不行换电脑一样）。

在他提供的代码中，我判断可能是下面两行代码导致的报错，因为这两个代码都有一个select函数，或许是R无法正确的处理应该使用哪个select.

library(AnnotationHub)
library(dplyr)

于是我找了一个最简单的例子来证明我的想法

library(AnnotationHub)
library(dplyr)

data("mtcars")
select(mtcars, mpg)

错误并没有出现。R并没有我想象的那么弱，泛型函数能够正确的根据对象选择合适的函数。

正当我一筹莫展时，突然想到，会不会是因为操作者只加载了AnnotationHub而跳过了dplyr包加载了呢？如此，select函数在命令空间中存在，但却没有适合data.frame的版本，所以报错了呢？

library(AnnotationDbi)
data("mtcars")
select(mtcars, mpg)

# 报错信息如下
Error in (function (classes, fdef, mtable)  :
  unable to find an inherited method for function 'select' for signature '"data.frame"'

结果验证了我的推测。

这也是初学者最常见的错误，忘记加载R包，或者甚至根本就没有装上这个R包。

当然还有一种可能，就是另外的R包在加载的时候将已有的函数进行了屏蔽，例如MASS

提示信息

但是报错信息不一样，他会说函数有未使用的参数。

library(dplyr)
library(MASS)
select(mtcars, mpg)
# 报错信息
Error in select(mtcars, mpg) : unused argument (mpg)

如果你在前面两个R包的基础上加载AnnotationHub时，报错又和之前一样

library(dplyr)
library(MASS)
library(AnnotationDbi)
select(mtcars, mpg)

Error in (function (classes, fdef, mtable)  : 
  unable to find an inherited method for function ‘select’ for signature ‘"data.frame"’

如果你只是调用R包，那么这种报错可以除了用dplyr::select形式，还可以用detach函数进行解决

detach("package:MASS", unload = TRUE)
detach("package:AnnotationDbi", unload = TRUE)
select(mtcars, mpg)

但是如果你准备写R包或者封装一些R脚本，那么你要特别注意这些大家特别喜欢的函数名，最好就是用packages::function的方式进行函数调用，虽然代码长了些，但是能提高稳定性。

hoptop -- 可能是中国在现场处理过R语言报错最多的人