Hadoop平台K-Means聚类算法分布式实现+MapReduce通俗讲解

    Hadoop平台K-Means聚类算法分布式实现+MapReduce通俗讲解

在Hadoop分布式环境下实现K-Means聚类算法的伪代码如下：

输入：参数0--存储样本数据的文本文件inputfile；

            参数1--存储样本数据的SequenceFile文件inputPath；

            参数2--存储质心数据的SequenceFile文件centerPath；

            参数3--存储聚类结果文件(SequenceFile文件)所处的路径clusterPath；

            参数4--类的数量k；

输出：k个类

Begin

           读取inputPath，从中选取前k个点作为初始质心，将质心数据写入centerPath；

           While 聚类终止条件不满足

                    在Mapper阶段，读取inputPath，对于key所对应的点，遍历所有的质心，选择最近的质心，将该质心的编号作为键，

                    该点的编号作为值传递给Reducer；

                    在Reducer阶段，将Mapper阶段传递过来的值根据键归并输出，结果写入clusterPath；

                    读取clusterPath，重新计算质心，将结果写入centerPath；

           EndWhile

End

判断聚类效果好坏的常见指标是下述的准则函数值：

有理由认为上述值越小，聚类效果越好，随着循环的不断进行，上述准则函数值会收敛到一个很小的值，所以可以用这个值不再明显变化作为聚类循环的终止条件。

在map 主要做的是计算各个数据点与聚类中心的距离并且找出与样本对应的最近中心。 计算新的聚类中心 输入key MApreduce默认格式 ，即当前样本相对于输入数据文件其实点的偏移量， value 是当前样本各维度的值组成的字符串。输出：  key‘是距离最近簇下标，value’是 样本点。

reduce 阶段：根据map阶段的重新计算聚类中心,更新聚类中心。输出：

           注：在map阶段，减少数据通信，需要在本地map做一次conbine(),减少数据大小，具体是根据key，相加value的每个维度，并记录count。

MapReduce通俗讲解

Hadoop就是一个实现了Google云计算系统的开源系统，包括并行计算模型Map/Reduce，分布式文件系统HDFS，以及分布式数据库Hbase，同时Hadoop的相关项目也很丰富，包括ZooKeeper，Pig，Chukwa，Hive，Hbase，Mahout，flume等.

这里详细分解这里面的概念让大家通过这篇文章了解到底是什么hadoop：



1.什么是Map/Reduce，看下面的各种解释：

(1)MapReduce是hadoop的核心组件之一，hadoop要分布式包括两部分，一是分布式文件系统hdfs,一部是分布式计算框，就是mapreduce,缺一不可，也就是说，可以通过mapreduce很容易在hadoop平台上进行分布式的计算编程。

(2)Mapreduce是一种编程模型，是一种编程方法，抽象理论。

(3)下面是一个关于一个程序员是如何个妻子讲解什么是MapReduce？文章很长请耐心的看。

我问妻子：“你真的想要弄懂什么是MapReduce？” 她很坚定的回答说“是的”。 因此我问道：

我： 你是如何准备洋葱辣椒酱的？（以下并非准确食谱，请勿在家尝试）

妻子： 我会取一个洋葱，把它切碎，然后拌入盐和水，最后放进混合研磨机里研磨。这样就能得到洋葱辣椒酱了。


妻子： 但这和MapReduce有什么关系？

我： 你等一下。让我来编一个完整的情节，这样你肯定可以在15分钟内弄懂MapReduce.

妻子： 好吧。

我：现在，假设你想用薄荷、洋葱、番茄、辣椒、大蒜弄一瓶混合辣椒酱。你会怎么做呢？

妻子： 我会取薄荷叶一撮，洋葱一个，番茄一个，辣椒一根，大蒜一根，切碎后加入适量的盐和水，再放入混合研磨机里研磨，这样你就可以得到一瓶混合辣椒酱了。

我： 没错，让我们把MapReduce的概念应用到食谱上。Map和Reduce其实是两种操作，我来给你详细讲解下。
Map（映射）: 把洋葱、番茄、辣椒和大蒜切碎，是各自作用在这些物体上的一个Map操作。所以你给Map一个洋葱，Map就会把洋葱切碎。 同样的，你把辣椒，大蒜和番茄一一地拿给Map，你也会得到各种碎块。 所以，当你在切像洋葱这样的蔬菜时，你执行就是一个Map操作。 Map操作适用于每一种蔬菜，它会相应地生产出一种或多种碎块，在我们的例子中生产的是蔬菜块。在Map操作中可能会出现有个洋葱坏掉了的情况，你只要把坏洋葱丢了就行了。所以，如果出现坏洋葱了，Map操作就会过滤掉坏洋葱而不会生产出任何的坏洋葱块。


Reduce（化简）:在这一阶段，你将各种蔬菜碎都放入研磨机里进行研磨，你就可以得到一瓶辣椒酱了。这意味要制成一瓶辣椒酱，你得研磨所有的原料。因此，研磨机通常将map操作的蔬菜碎聚集在了一起。

妻子： 所以，这就是MapReduce?

我： 你可以说是，也可以说不是。 其实这只是MapReduce的一部分，MapReduce的强大在于分布式计算。

妻子： 分布式计算？ 那是什么？请给我解释下吧。

我： 没问题。

我： 假设你参加了一个辣椒酱比赛并且你的食谱赢得了最佳辣椒酱奖。得奖之后，辣椒酱食谱大受欢迎，于是你想要开始出售自制品牌的辣椒酱。假设你每天需要生产10000瓶辣椒酱，你会怎么办呢？

妻子： 我会找一个能为我大量提供原料的供应商。

我：是的..就是那样的。那你能否独自完成制作呢？也就是说，独自将原料都切碎？ 仅仅一部研磨机又是否能满足需要？而且现在，我们还需要供应不同种类的辣椒酱，像洋葱辣椒酱、青椒辣椒酱、番茄辣椒酱等等。

妻子： 当然不能了，我会雇佣更多的工人来切蔬菜。我还需要更多的研磨机，这样我就可以更快地生产辣椒酱了。
我：没错，所以现在你就不得不分配工作了，你将需要几个人一起切蔬菜。每个人都要处理满满一袋的蔬菜，而每一个人都相当于在执行一个简单的Map操作。每一个人都将不断的从袋子里拿出蔬菜来，并且每次只对一种蔬菜进行处理，也就是将它们切碎，直到袋子空了为止。
这样，当所有的工人都切完以后，工作台（每个人工作的地方）上就有了洋葱块、番茄块、和蒜蓉等等。

妻子：但是我怎么会制造出不同种类的番茄酱呢？

我：现在你会看到MapReduce遗漏的阶段—搅拌阶段。MapReduce将所有输出的蔬菜碎都搅拌在了一起，这些蔬菜碎都是在以key为基础的 map操作下产生的。搅拌将自动完成，你可以假设key是一种原料的名字，就像洋葱一样。 所以全部的洋葱keys都会搅拌在一起，并转移到研磨洋葱的研磨器里。这样，你就能得到洋葱辣椒酱了。同样地，所有的番茄也会被转移到标记着番茄的研磨器里，并制造出番茄辣椒酱。

（4）上面都是从理论上来说明什么是MapReduce，那么咱们在MapReduce产生的过程和代码的角度来理解这个问题。
如果想统计下过去10年计算机论文出现最多的几个单词，看看大家都在研究些什么，那收集好论文后，该怎么办呢？ 

　　方法一：
      我可以写一个小程序，把所有论文按顺序遍历一遍，统计每一个遇到的单词的出现次数，最后就可以知道哪几个单词最热门了。 这种方法在数据集比较小时，是非常有效的，而且实现最简单，用来解决这个问题很合适。 

　方法二：
       写一个多线程程序，并发遍历论文。 
　　这个问题理论上是可以高度并发的，因为统计一个文件时不会影响统计另一个文件。当我们的机器是多核或者多处理器，方法二肯定比方法一高效。但是写一个多线程程序要比方法一困难多了，我们必须自己同步共享数据，比如要防止两个线程重复统计文件。 

方法三：
      把作业交给多个计算机去完成。 
　　我们可以使用方法一的程序，部署到N台机器上去，然后把论文集分成N份，一台机器跑一个作业。这个方法跑得足够快，但是部署起来很麻烦，我们要人工把程序copy到别的机器，要人工把论文集分开，最痛苦的是还要把N个运行结果进行整合（当然我们也可以再写一个程序）。 

　　方法四：
      让MapReduce来帮帮我们吧！ 

　　MapReduce本质上就是方法三，但是如何拆分文件集，如何copy程序，如何整合结果这些都是框架定义好的。我们只要定义好这个任务（用户程序），其它都交给MapReduce。


map函数和reduce函数　　


map函数和reduce函数是交给用户实现的，这两个函数定义了任务本身。 

　　map函数：接受一个键值对（key-value pair），产生一组中间键值对。MapReduce框架会将map函数产生的中间键值对里键相同的值传递给一个reduce函数。 

　　reduce函数：接受一个键，以及相关的一组值，将这组值进行合并产生一组规模更小的值（通常只有一个或零个值）。 

　　统计词频的MapReduce函数的核心代码非常简短，主要就是实现这两个函数。 

　　map(String key, String value): 

　　// key: document name 

　　// value: document contents 

　　for each word w in value: 

　　EmitIntermediate(w, "1"); 

　　reduce(String key, Iterator values): 

　　// key: a word 

　　// values: a list of counts 

　　int result = 0; 

　　for each v in values: 

　　result += ParseInt(v); 

　　Emit(AsString(result)); 

　　在统计词频的例子里，map函数接受的键是文件名，值是文件的内容，map逐个遍历单词，每遇到一个单词w，就产生一个中间键值对，这表示单词w咱又找到了一个；MapReduce将键相同（都是单词w）的键值对传给reduce函数，这样reduce函数接受的键就是单词w，值是一串"1"（最基本的实现是这样，但可以优化），个数等于键为w的键值对的个数，然后将这些“1”累加就得到单词w的出现次数。最后这些单词的出现次数会被写到用户定义的位置，存储在底层的分布式存储系统（GFS或HDFS）。 



工作原理

 

　　上图是论文里给出的流程图。一切都是从最上方的user program开始的，user program链接了MapReduce库，实现了最基本的Map函数和Reduce函数。图中执行的顺序都用数字标记了。

　　1.MapReduce库先把user program的输入文件划分为M份（M为用户定义），每一份通常有16MB到64MB，如图左方所示分成了split0~4；然后使用fork将用户进程拷贝到集群内其它机器上。 

　　2.user program的副本中有一个称为master，其余称为worker，master是负责调度的，为空闲worker分配作业（Map作业或者Reduce作业），worker的数量也是可以由用户指定的。 

　　3.被分配了Map作业的worker，开始读取对应分片的输入数据，Map作业数量是由M决定的，和split一一对应；Map作业从输入数据中抽取出键值对，每一个键值对都作为参数传递给map函数，map函数产生的中间键值对被缓存在内存中。 

　　4.缓存的中间键值对会被定期写入本地磁盘，而且被分为R个区，R的大小是由用户定义的，将来每个区会对应一个Reduce作业；这些中间键值对的位置会被通报给master，master负责将信息转发给Reduce worker。 

　　5.master通知分配了Reduce作业的worker它负责的分区在什么位置（肯定不止一个地方，每个Map作业产生的中间键值对都可能映射到所有R个不同分区），当Reduce worker把所有它负责的中间键值对都读过来后，先对它们进行排序，使得相同键的键值对聚集在一起。因为不同的键可能会映射到同一个分区也就是同一个Reduce作业（谁让分区少呢），所以排序是必须的。 

　　6.reduce worker遍历排序后的中间键值对，对于每个唯一的键，都将键与关联的值传递给reduce函数，reduce函数产生的输出会添加到这个分区的输出文件中。 

　　6.当所有的Map和Reduce作业都完成了，master唤醒正版的user program，MapReduce函数调用返回user program的代码。 

　　所有执行完毕后，MapReduce输出放在了R个分区的输出文件中（分别对应一个Reduce作业）。用户通常并不需要合并这R个文件，而是将其作为输入交给另一个MapReduce程序处理。整个过程中，输入数据是来自底层分布式文件系统（GFS）的，中间数据是放在本地文件系统的，最终输出数据是写入底层分布式文件系统（GFS）的。而且我们要注意Map/Reduce作业和map/reduce函数的区别：Map作业处理一个输入数据的分片，可能需要调用多次map函数来处理每个输入键值对；Reduce作业处理一个分区的中间键值对，期间要对每个不同的键调用一次reduce函数，Reduce作业最终也对应一个输出文件。