R语言小白来求助各位！！！
求助啊各位大神 哭 伤心 大哭 不开心 流泪 桑心哭 伤心 大哭 不开心 流泪 桑心哭 伤心 大哭 不开心 流泪
老师让我用Decipher包酶切一段fasta序列，用三个酶切，然后找出目标片段的长度（一头是酶1一头是酶3和一头是酶2一头是酶3的，然后他给了我思路，我自己编写了前半段，总报错，后半段完全没思路。各位大神能帮我看看吗？感觉要被锤了崩溃 抓狂 疲惫 苦逼）
崩溃 抓狂 疲惫 苦逼
打开文件
seq<-’’
i<-0
while （读一行）{
if (这一行以>起始){
if(seq不为空)
#print（seq）
处理序列（酶切，保存结果）
i<-i+1
if (i 被100整除){print(i)}
seq<-’’
序列名<-行
#print(序列名)
}else{
paste(行，seq)
}
}
处理序列（酶切，保存结果）
关闭文件
data frame
mei pos
ECOR 345
NehI 342
result[[序列名]]<-data frame
cutlength<-
for (序列名){
x<-result[[序列名]]
x<-x[order(xKaTeX parse error: Expected '}', got 'EOF' at end of input: …]){ if( ((xmei[i]==mei1|xKaTeX parse error: Expected 'EOF', got '&' at position 14: mei[i]==mei2)&̲ xmei[i+1]==mei3)|
((x m e i [ i + 1 ] = = m e i 1 ∣ x mei[i+1]==mei1|x mei[i+1]==mei1∣xmei[i+1]==mei2)& xKaTeX parse error: Expected '}', got 'EOF' at end of input: …mei3)){ xpos[i+1]-x$pos[i]+1
}
}
}
这是他的思路。
library(DECIPHER)
data(RESTRICTION_ENZYMES)
RESTRICTION_ENZYMES
#library(Biostrings)
#seq<-readDNAStringSet(“C:/Users/pc-1/Desktop/COX1.fasta”)
sites <- RESTRICTION_ENZYMES[c(“XbaI”, “NheI”, “EcoRI”)]
con <-file(“C:/Users/pc-1/Desktop/COX1.fasta”)
sites
dna<-seq
i<-0
pos<-list()
while (readLines(con)){
if(str_detect(seq,">",Negate = FALSE )){
if(is.null(seq[[i]])){
print(seq[[i]])
}
d <- DigestDNA(sites, dna,strand = "both",type = "position")
i<-i+1
if(i%%100 =0){
print(seq)
}
}
else{
paste(str_detect(seq[i],sep = “/n”))
}
ext <- (d[[i]]$top)
pos[[i]] = ext
}
close(con)
这是我写的部分。
求助哭 伤心 大哭 不开心 流泪 桑心
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如何插入一段漂亮的代码片
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// An highlighted block
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|---|---|
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| 导管 | $1 |
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使用:---------:居中
使用:----------居左
使用----------:居右
| 第一列 | 第二列 | 第三列 |
|---|---|---|
| 第一列文本居中 | 第二列文本居右 | 第三列文本居左 |
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| TYPE | ASCII | HTML |
|---|---|---|
| Single backticks | 'Isn't this fun?' |
‘Isn’t this fun?’ |
| Quotes | "Isn't this fun?" |
“Isn’t this fun?” |
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– is en-dash, — is em-dash |
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Gamma公式展示 Γ ( n ) = ( n − 1 ) ! ∀ n ∈ N \Gamma(n) = (n-1)!\quad\forall n\in\mathbb N Γ(n)=(n−1)!∀n∈N 是通过欧拉积分
Γ ( z ) = ∫ 0 ∞ t z − 1 e − t d t . \Gamma(z) = \int_0^\infty t^{z-1}e^{-t}dt\,. Γ(z)=∫0∞tz−1e−tdt.
你可以找到更多关于的信息 LaTeX 数学表达式here.
新的甘特图功能，丰富你的文章
- 关于 甘特图 语法，参考 这儿,
UML 图表
可以使用UML图表进行渲染。 Mermaid. 例如下面产生的一个序列图：
这将产生一个流程图。:
- 关于 Mermaid 语法，参考 这儿,
FLowchart流程图
我们依旧会支持flowchart的流程图：
- 关于 Flowchart流程图 语法，参考 这儿.
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