【机器学习系列3】K近邻算法KNearestNeignbors——思路推导和纯Numpy实现

目录

  • 思路推导
    • kNN的思想
  • 手动实现kNN
    • 计算距离 distant
      • 思路
      • 代码实现
    • 预测器 predict
      • 思路
      • 代码
    • 评价器 evaluation
      • 思路
      • 代码
    • 交叉验证 validation
      • 思路
      • 代码
    • 与sklearn比较
      • k的影响
      • 预测效果
  • 完整代码

这一系列是学习公众号“机器学习实验室”的笔记,跟着大佬的脚步一个个实现,今天实现的是kNN,kNN是一个思想比较简单的监督算法,没有数学推导,计算的东西比较多,因此我将数学推导换成思路推导来考虑怎么写代码。

思路推导

kNN的思想

没有预训练这些过程,kNN单纯是暴力求距离,然后统计k个距离近的样本的标签,谁多听谁的,显而易见这是个近邻匹配的思想。我之前总结过优化思想和出发点:

优化思想 出发点
最小二乘法 最小均方差
最大似然法 最大似然概率

近邻匹配的出发点就是用相似的个体进行投票,我们把重点放在代码上。

手动实现kNN

首先分析有几个部分:KNearestNeignbors作为一个类,应该满足喂入训练数据x和y,然后放入要预测的测试样本,并不经过训练,直接计算这个样本和所有训练样本的距离,统计k个距离最近的样本的标签,最多的标签设为该样本的标签。值得注意的是,我们在计算距离的时候是放入整个矩阵的,因此这个地方需要设计计算的代码。
由此我们可以很快想到造一个计算距离distant、一个预测器predict和一个评价器evaluation,在这里我还加入了一个交叉验证validation
代码如果有不对的还请指正。

计算距离 distant

思路

  1. 在这里我设计了两个距离,一个是向量2-范数,一个是余弦相似度cosine。
  2. 这两个公式都比较熟悉, l 2 = ( x − y ) 2 l_2=\sqrt{(x-y)^2} l2=(xy)2 ,在矩阵中则需要一些技巧。首先先考虑两个矩阵计算,最后我们想要得到的是 n 1 × n 2 n_1\times n_2 n1×n2大小的矩阵,分别为测试集和训练集的大小,因为从测试集 n 1 n_1 n1出发要知道和每一个训练集样本的距离。
    • 分解后先是求 x − y x-y xy,因为一共需要求 n 1 × n 2 n_1\times n_2 n1×n2个距离,我分别把两个矩阵扩展到这个大小,直接减后再reshape。以测试集为例,大小为 n 1 × d n_1\times d n1×d,先是reshape为 ( n 1 , 1 , d ) (n_1, 1,d) (n1,1,d)的张量,这样用tile扩展的时候就可以形成连续相同样本。
      例:

      a = a r r a y ( [ 1 , 2 , 3 ] , [ 4 , 5 , 6 ] ) ( 2 × 3 ) a = array([1,2,3],[4,5,6])\quad (2\times 3) a=array([1,2,3],[4,5,6])(2×3)
      b = a r r a y ( [ 1 , 2 , 1 ] , [ 6 , 7 , 9 ] , [ 8 , 2 , 0 ] , [ 7 , 1 , 4 ] , [ 9 , 3 , 1 ] ) ( 5 × 3 ) b = array([1,2,1],[6,7,9],[8,2,0],[7,1,4],[9,3,1])\quad (5\times 3) b=array([1,2,1],[6,7,9],[8,2,0],[7,1,4],[9,3,1])(5×3)
      t i l e ( a , ( 5 , 1 ) ) = a r r a y ( [ 1 , 2 , 3 ] , [ 4 , 5 , 6 ] , [ 1 , 2 , 3 ] , [ 4 , 5 , 6 ] , [ 1 , 2 , 3 ] , [ 4 , 5 , 6 ] , [ 1 , 2 , 3 ] , [ 4 , 5 , 6 ] , [ 1 , 2 , 3 ] , [ 4 , 5 , 6 ] ) ( 10 × 3 ) tile(a, (5,1))=array([1,2,3],[4,5,6],[1,2,3],[4,5,6],[1,2,3],[4,5,6],[1,2,3],[4,5,6],[1,2,3],[4,5,6])\quad (10\times 3) tile(a,(5,1))=array([1,2,3],[4,5,6],[1,2,3],[4,5,6],[1,2,3],[4,5,6],[1,2,3],[4,5,6],[1,2,3],[4,5,6])(10×3)
      转换为 a r r a y ( [ [ [ 1 , 2 , 3 ] ] , [ [ 4 , 5 , 6 ] ] ] ) array([[[1,2,3]], [[4,5,6]]]) array([[[1,2,3]],[[4,5,6]]])
      t i l e ( a , ( 1 , 5 , 1 ) ) = a r r a y ( [ [ 1 , 2 , 3 ] , [ 1 , 2 , 3 ] , [ 1 , 2 , 3 ] , [ 1 , 2 , 3 ] , [ 1 , 2 , 3 ] ] , [ [ 4 , 5 , 6 ] , [ 4 , 5 , 6 ] , [ 4 , 5 , 6 ] , [ 4 , 5 , 6 ] , [ 4 , 5 , 6 ] ] ) ( 2 × 5 × 3 ) tile(a, (1,5,1))=array([[1,2,3],[1,2,3],[1,2,3],[1,2,3],[1,2,3]],[[4,5,6],[4,5,6],[4,5,6],[4,5,6],[4,5,6]])\quad (2\times 5\times 3) tile(a,(1,5,1))=array([[1,2,3],[1,2,3],[1,2,3],[1,2,3],[1,2,3]],[[4,5,6],[4,5,6],[4,5,6],[4,5,6],[4,5,6]])(2×5×3)

    • 这样直接扩展训练集为 ( n 1 ∗ n 2 ) × d (n_1 * n_2 )\times d (n1n2)×d,相减在reshape就可以得到 n 1 × n 2 n_1\times n_2 n1×n2的矩阵,每一行是一个测试样本与所有训练样本的距离。

  3. 再看余弦相似性 x ⃗ ⋅ y ⃗ ∥ x ∥ ∥ y ∥ \frac{\vec{x}\cdot\vec{y}}{\|x\|\|y\|} xyx y ,上面的部分是一个向量点积,用dot可以实现,下面是一个常数。我们看 ∥ x ∥ \|x\| x可以写成这个向量每个值先平方,然后按行方向求和,同理求得 ∥ y ∥ \|y\| y,分别按行和按列扩展至大小一致,相减完事了!
    【机器学习系列3】K近邻算法KNearestNeignbors——思路推导和纯Numpy实现_第1张图片

代码实现

def distant(self, x_tr, x_test, dis_type):
	if dis_type == 'l2':
        dim_tr = x_tr.shape[0]
        dim_te = x_test.shape[0]
        dim_feature = x_tr.shape[1]

        # l2 = ((x - y)**2)**0.5
        # expand_tr = x_tr.reshape((-1, dim_te))
        ## calculate x - y through tile(), and the square root of sum
        expand_te = np.tile(x_test.reshape((dim_te,1,-1)), (1 ,dim_tr,1))
        expand_te = expand_te.reshape((-1, dim_feature))
        expand_tr = np.tile(x_tr,(dim_te,1))
        dist_xy = np.sum((expand_te - expand_tr)**2, axis=1)
        dist_mat = (dist_xy**0.5).reshape((dim_te,-1))
        return dist_mat

    if dis_type == 'cosine':
        # dimension of sets
        dim_tr = x_tr.shape[0]
        dim_te = x_test.shape[0]

        # cos = A.T.dot(B) / ((A**2)**0.5 + (B**2)**0.5)
        ## calculate the dot product, and the sqaure root of x and y
        frac_u = np.dot(x_test, x_tr.T)
        sub_tr = (x_tr**2).sum(axis=1).reshape((-1,1))
        sub_tr = np.tile(sub_tr.T**0.5,(dim_te, 1))
        sub_te = (x_test**2).sum(axis=1).reshape((-1,1))
        sub_te = np.tile(sub_te**0.5,(dim_tr))
        frac_d = sub_tr * sub_te
        return frac_u / frac_d

预测器 predict

思路

在这里调用distant计算距离,然后对每一行利用argsort排序,函数将排名和索引联系起来了。对每一个测试样本,取前k个的索引,查看其标签,将标签放入字典中。对着k个统计完后,计算字典里的最多投票。这个结构要清晰:

initialize prediction list
for sample in shape[0]:
	initialize dictionary
	for i in range(k):
		look up labels
		put into dictionary
	sort dictionary
	append the label into the prediction list
return prediction list

代码

def predict(self, x_tr, y_tr, x_test, y_test, k):
    dist_mat = self.distant(x_tr, x_test, 'cosine')
    dist_k = dist_mat.argsort(axis=1)
    y_predict = np.array([])
    
    for sample in range(dist_k.shape[0]):
        class_count = {}
        for i in range(k):
            vote_label = int(y_tr[dist_k[sample][i]])
            class_count[vote_label] = class_count.get(vote_label, 0) + 1

        final_vote = sorted(class_count.items(), 
            key=operator.itemgetter(1), reverse=True)
        y_predict = np.append(y_predict, final_vote[0][0])

    y_predict = y_predict.reshape((-1,1))
    return y_predict

评价器 evaluation

思路

和逻辑回归的一样,都是分类的评价标准:准确率,精确率,召回率。

代码

def evalution(self, y_predict, y):
	y_test = y_test.ravel()
	y_predict = y_predict.ravel()
	
	num_test = y_test.shape[0]
	# succeed: 0  fail: 1,-1
	outcome = y_predict - y_test
	# succeed: 0  fail: 1
	outcome[outcome == -1] = 1
	
	Counter(outcome)
	Counter(y_predict)
	num_tp_tn = sum(outcome==0)
	num_fp = np.dot(y_predict.T, outcome)
	num_tp = sum(y_predict==1) - num_fp
	num_tn = num_tp_tn - num_tp
	num_fn = sum(y_predict==0) - num_tn
	
	accuracy =  num_tp_tn / num_test
	precision = num_tp / (num_tp + num_fp)
	recall = num_tp / (num_tp + num_fn)
	
	return accuracy, precision, recall

交叉验证 validation

思路

这里我加了一个交叉验证,将训练集又分为训练集和验证集。主要加深了我对numpy的array结构迭代器yield的理解,可以将这个数组分为几组(整除情况下),取其中的一个组,将剩下的concatnate起来,然后用yield返回一个迭代器,共fold个迭代器(n fold)。每个迭代器里面分别是训练集数据、标签和验证机数据、标签。

代码

def validation(self, x_train, y_train, fold):
     dims = x_train.shape[1]
     if x_train.shape[0] % fold == 0:
         x_fold = []
         y_fold = []
         x_fold = np.split(x_train, fold)
         y_fold = np.split(y_train, fold)
         for i in range(fold):
             x_tr = np.concatenate(
                 (np.array(x_fold)[:i], np.array(x_fold)[i+1:]),axis=0)
             y_tr = np.concatenate(
                 (np.array(y_fold)[:i], np.array(y_fold)[i+1:]), axis=0)
             x_val = np.array(x_fold)[i]
             y_val = np.array(y_fold)[i]
             x_tr = x_tr.reshape((-1,dims))
             y_tr = y_tr.reshape((-1,1))
             yield (x_tr, y_tr, x_val, y_val)
     else:
         print("Attention: vary size.")

在主代码里直接迭代使用

for i, (x_tr, y_tr, x_val, y_val) in enumerate(model.validation(x_train, y_train, 4)):
        print(i)
        y_predict = model.predict(x_tr, y_tr, x_val, y_val, k)

与sklearn比较

我加入sklearn的包来比较模型的效果,在k为10,使用l2距离和包效果一样,但是cosine距离就差很多。
l2在验证集

0
our: 0.96875 0.9634146341463414 0.9875
sklearn: 0.96875 0.9634146341463414 0.9875
1
our: 0.96875 0.9767441860465116 0.9767441860465116
sklearn: 0.96875 0.9767441860465116 0.9767441860465116
2
our: 0.90625 0.9166666666666666 0.9390243902439024
sklearn: 0.90625 0.9166666666666666 0.9390243902439024
3
our: 0.8984375 0.8831168831168831 0.9444444444444444
sklearn: 0.8984375 0.8831168831168831 0.9444444444444444

cosine在验证集

0
our: 0.125 0.0 0.0
sklearn: 0.96875 0.9634146341463414 0.9875
1
our: 0.1171875 0.034482758620689655 0.011627906976744186
sklearn: 0.96875 0.9767441860465116 0.9767441860465116
2
our: 0.203125 0.0 0.0
sklearn: 0.90625 0.9166666666666666 0.9390243902439024
3
our: 0.25 0.038461538461538464 0.013888888888888888
sklearn: 0.8984375 0.8831168831168831 0.9444444444444444

k的影响

k从5到20,准确率、召回率没有变,精确率会震荡。
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预测效果

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完整代码

https://github.com/oneoyz/ml_algorithms/tree/master/k_neighbors

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