生物信息学分析常用网站

1.  BLAST（核酸蛋白序列比对）：

https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

2.  miRBase（miRNA数据库网站）：

http://www.mirbase.org/

3.  PlantCARE（启动子元件分析网站）：

    http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/

4.  Weblogo（核酸蛋白序列位点保守性分析）：

http://weblogo.berkeley.edu/logo.cgi

5.  CBS Prediction Servers（综合分析，强烈推荐）

http://www.cbs.dtu.dk/services/

其中比较常用的有：

     Promoter 2.0 Prediction Server（转录起始位点预测）

http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/

SignalP 4.1 Server（信号肽预测）

http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

  TargetP 1.1 Server（亚细胞定位预测）

http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP/

  TMHMM Server v.2.0（蛋白跨膜结构预测）

http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/

6.  SWISS-MODEL（蛋白三维建模）

https://swissmodel.expasy.org/

7.  RNA22（miRNA靶基因预测）

https://cm.jefferson.edu/rna22/

8.  PDB（蛋白质数据库）

http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

9.  RNAfold web server（RNA二级结构预测）

http://nhjy.hzau.edu.cn/kech/swxxx/jakj/dianzi/Bioinf4/miRNA/miRNA1.htm

10.TAIR（拟南芥数据库）

http://www.arabidopsis.org/

11.文献搜索（农大没有版权的文献下载）

http://www.sci-hub.cc/

12.生物序列的可视化示意图制作（IBS）

http://ibs.biocuckoo.org/

13.InterPro（蛋白质序列分析）

http://www.ebi.ac.uk/interpro/

14.RNA结合蛋白预测

RNA binding motif (RRM) containing

http://www.genenames.org/genefamilies/RBM

RBPmap

http://rbpmap.technion.ac.il/

RNApred

http://www.imtech.res.in/raghava/rnapred/help.html