Hadoop中的数据库访问
Hadoop主要用来对非结构化或半结构化（HBase）数据进行存储和分析，而结构化的数据则一般使用数据库来进行存储和访问。本文的主要内容则是讲述如何将Hadoop与现有的数据库结合起来，在Hadoop应用程序中访问数据库中的文件。
1.DBInputFormat
DBInputFormat是Hadoop从0.19.0开始支持的一种输入格式，包含在包org.apache.hadoop.mapred.lib.db中，主要用来与现有的数据库系统进行交互，包括MySQL、PostgreSQL、Oracle等几个数据库系统。DBInputFormat在Hadoop应用程序中通过数据库供应商提供的JDBC接口来与数据库进行交互，并且可以使用标准的SQL来读取数据库中的记录。在使用DBInputFormat之前，必须将要使用的JDBC驱动拷贝到分布式系统各个节点的$HADOOP_HOME/lib/目录下。
在DBInputFormat类中包含以下三个内置类：
1．protected class DBRecordReader implements RecordReader
2．public static class NullDBWritable implements DBWritable, Writable：主要用来实现DBWritable接口。
3．protected static class DBInputSplit implements InputSplit：主要用来描述输入元组集合的范围，包括start和end两个属性，start用来表示第一条记录的索引号，end表示最后一条记录的索引号。
其中DBWritable接口与Writable接口比较类似，也包含write和readFields两个函数，只是函数的参数有所不同。DBWritable中的两个函数分别为：
public void write(PreparedStatement statement) throws SQLException;
public void readFields(ResultSet resultSet) throws SQLException;
这两个函数分别用来给java.sql.PreparedStatement设置参数，以及从java.sql.ResultSet中读取一条记录，熟悉Java JDBC用法的应该对这两个类的用法比较了解。
2．使用DBInputFormat读取数据库表中的记录
上文已经对DBInputFormat以及其中的相关内置类作了简单介绍，下面对怎样使用DBInputFormat读取数据库记录进行详细的介绍，具体步骤如下：
1．使用DBConfiguration.configureDB (JobConf job, String driverClass, String dbUrl, String userName, String passwd)函数配置JDBC驱动，数据源，以及数据库访问的用户名和密码。例如MySQL数据库的JDBC的驱动为“com.mysql.jdbc.Driver”，数据源可以设置为“jdbc:mysql://localhost/mydb”，其中mydb可以设置为所需要访问的数据库。
2．使用DBInputFormat.setInput(JobConf job, Class inputClass, String tableName, String conditions, String orderBy, String... fieldNames)函数对要输入的数据进行一些初始化设置，包括输入记录的类名（必须实现了DBWritable接口）、数据表名、输入数据满足的条件、输入顺序、输入的属性列。也可以使用重载的函数setInput(JobConf job, Class inputClass, String inputQuery, String inputCountQuery)进行初始化，区别在于后者可以直接使用标准SQL进行初始化，具体可以参考Hadoop API中的讲解。
3．按照普通Hadoop应用程序的格式进行配置，包括Mapper类、Reducer类、输入输出文件格式等，然后调用JobClient.runJob(conf)。
3．使用示例
假设MySQL数据库中有数据库school，其中的teacher数据表定义如下：
DROP TABLE IF EXISTS `school`.`teacher`;
CREATE TABLE `school`.`teacher` (
`id` int(11) default NULL,
`name` char(20) default NULL,
`age` int(11) default NULL,
`departmentID` int(11) default NULL
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=latin1;
首先给出实现了DBWritable接口的TeacherRecord类：
public class TeacherRecord implements Writable, DBWritable{
int id;
String name;
int age;
int departmentID;
@Override
public void readFields(DataInput in) throws IOException {
// TODO Auto-generated method stub
this.id = in.readInt();
this.name = Text.readString(in);
this.age = in.readInt();
this.departmentID = in.readInt();
}
@Override
public void write(DataOutput out) throws IOException {
// TODO Auto-generated method stub
out.writeInt(this.id);
Text.writeString(out, this.name);
out.writeInt(this.age);
out.writeInt(this.departmentID);
}
@Override
public void readFields(ResultSet result) throws SQLException {
// TODO Auto-generated method stub
this.id = result.getInt(1);
this.name = result.getString(2);
this.age = result.getInt(3);
this.departmentID = result.getInt(4);
}
@Override
public void write(PreparedStatement stmt) throws SQLException {
// TODO Auto-generated method stub
stmt.setInt(1, this.id);
stmt.setString(2, this.name);
stmt.setInt(3, this.age);
stmt.setInt(4, this.departmentID);
}
@Override
public String toString() {
// TODO Auto-generated method stub
return new String(this.name + " " + this.age + " " + this.departmentID);
}
}
利用DBAccessMapper读取一条条记录：
public class DBAccessMapper extends MapReduceBase implements
Mapper
@Override
public void map(LongWritable key, TeacherRecord value,
OutputCollector
throws IOException {
// TODO Auto-generated method stub
collector.collect(new LongWritable(value.id),
new Text(value.toString()));
}
}
Main函数如下：
public class DBAccess {
public static void main(String[] args) throws IOException {
JobConf conf = new JobConf(DBAccess.class);
conf.setOutputKeyClass(LongWritable.class);
conf.setOutputValueClass(Text.class);
conf.setInputFormat(DBInputFormat.class);
FileOutputFormat.setOutputPath(conf, new Path("dboutput"));
DBConfiguration.configureDB(conf,"com.mysql.jdbc.Driver",
"jdbc:mysql://localhost/school","root","123456");
String [] fields = {"id", "name", "age", "departmentID"};
DBInputFormat.setInput(conf, TeacherRecord.class, "teacher",
null, "id", fields);
conf.setMapperClass(DBAccessMapper.class);
conf.setReducerClass(IdentityReducer.class);
JobClient.runJob(conf);
}
}
该示例从teacher表中读取所有记录，并以TextOutputFormat的格式输出到dboutput目录下，输出格式为<”id”, “name age departmentID”>。
4．使用DBOutputFormat向数据库中写记录
DBOutputFormat将计算结果写回到一个数据库，同样先调用DBConfiguration.configureDB（）函数进行数据库配置，然后调用函数DBOutputFormat.setOutput (JobConf job, String tableName, String... fieldNames)进行初始化设置，包括数据库表名和属性列名。同样，在将记录写回数据库之前，要先实现DBWritable接口。每个DBWritable的实例在传递给Reducer中的OutputCollector时都将调用其中的write(PreparedStatement stmt)方法。在Reduce过程结束时，PreparedStatement中的对象将会被转化成SQL语句中的INSERT语句，从而插入到数据库中。
5．总结
DBInputFormat和DBOutputFormat提供了一个访问数据库的简单接口，虽然接口简单，但应用广泛。例如，可以将现有数据库中的数据转储到Hadoop中，由Hadoop进行分布式计算，通过Hadoop对海量数据进行分析，然后将分析后的结果转储到数据库中。在搜索引擎的实现中，可以通过Hadoop将爬行下来的网页进行链接分析，评分计算，建立倒排索引，然后存储到数据库中，通过数据库进行快速搜索。虽然上述的数据库访问接口已经能满足一般的数据转储功能，但是仍然存在一些限制不足，例如并发访问、数据表中的键必须要满足排序要求等，还需Hadoop社区的人员进行改进和优化。