利用Pajek软件批量处理excel数据，批量生成网络关系图

利用Pajek软件批量处理excel数据，批量生成网络关系图

 

         Pajek软件大家想必都不陌生，但是我很陌生，因为我用它不是进行网络分析，而是用它来画关系图（类似网络图）。但是Pajek软件手工操作时一次只能导入一个数据文件（如:.net文件）生成相应的1张关系图，而我需要生成450张关系图，逐个数据文件手工操作是不现实的。查阅资料显示R语言或Python与Pajek混合编程可能实现这种功能，但是笔者不会R语言也不会Python语言，只会c++和java语言，而任务又赶的紧，来不及去get R语言调用方式（主要还是相关资料太少）。笔者下面描述下我的实现方式：

 

第一步：数据转换，即由Excel数据转为.net数据。（.net是Pajek支持的数据格式之一，这一步任何语言都可实现，笔者利用的是java语言的POI的jar包实现的）

下图是其中一个excel文件里的数据，值为0表示无关，值大于0表示相关（对角线的数据是笔者的其它用途，读者可忽略）。

下图①是生成的.net数据，图②是数据格式的简单说明（不懂的可以去查），这种数据可以直接利用Pajek生成图并保存（步骤可以到网上查找）。

          

Java代码如下：这一步只是文件的读写操作，很简单，不赘述，如下图。

 

第二步：生成并修改.log文件。下图是Pajek的安装目录，细心的读者会发现，安装目录里有许多的.log文件，这些文件是每次运行Pajek软件留下的，接下来我们就可以在.log文件上做文章。这个过程中，我们不必明白Pajek过多细节的操作，.log会指导我们如何来用。Pajek软件启动时会检查是否存在Pajek.log文件，如果存在便执行.log里面的操作（默认安装目录里是没有Pajek.log文件的,笔者是做过文章的）。

⑴        运行Pajek软件，按下图步骤打开.net文件并保存图片。（可设Layout->Energy->Kamada-Kawai->Free后面保存）

⑵        关闭Pajek软件，打开最新生成的.log文件，如下图：

下图是针对log文件的说明，我们只需要明白“源文件的绝对路径”和“目标文件的绝对路径”。

⑶        把上述文件的“源文件的绝对路径”的“目标文件的绝对路径”分别更改为我们的第二个.net文件和第二个.jpg文件的路径，并在最后添加一行为“EXIT”(如下图)。并更改此.log文件的名字为Pajek.log，保存。

⑷        运行Pajek，发现软件一闪而过（上面添加的”EXIT”,使软件运行完便退出，以后若想正常运行Pajek软件需要把Pajek删除或者改名），在目标路径生成了新的图。

 

第三步：把第二步的（3）（4）用C++程序循环执行。其实对于（3）用什么语言是无所谓的，但是（4）需要用批处理文件来执行，java似乎不可以执行批处理文件。

⑴   创建批处理文件“runPajek.bat”，内容如下图：

⑵   编写C++程序，循环控制重新生成.log文件并执行runPajek.bat。内容如下图：

完结。450多张图几分钟后便可全部生成。

结语：这是笔者发的第一个博客，漏洞很多，望需要者找到自己需要get的点，并希望大家批评指正笔者小新。