娱乐版HLA分型网页升级了

之前做了一个简单的网页，使用23andme格式+snp2hla软件获得hla分型数据，当然准确性不咋的，也就玩玩，上线后为大约100+人提供了服务，这是伯值得骄傲的事，因为第一次能为大家提供服务。代码我是放在了gitHub的，数据是脚本处理完后自动删除。看网页是不是有点眼熟，这是谷歌中国网页框架，直接搬来的。

2020.6.20更新了合并后的参考数据集，据论文说准确度有一定程度提高，欢迎测试交流！放在了另一个南京的腾讯云服务器，地址：https://dna.zd200572.com/hla/

    

2020.2.12修复完成！再次提醒，娱乐水平，请勿用于其他用途，不做任何保证和承担任何责任。如果你的HLA分型比较罕见，那么准确率将低到离谱，也就是说如果你的祖源比较特别的话，不推荐使用。

2020.2.11发现运行脚本故障，紧急修复中。由于本人几乎没有前端和后台水平，所以应用相当简陋，请谅解。请把数据命名为邮箱地址.txt,如[email protected]    请选择并上传你的芯片数据文件（及扩展数据，可选）即可完成HLA分型。使用的建站gcloud进行的，配置只有单核1.6G，HLA分型器会耗时30min左右，请耐心等待,结束后以结果以邮件形式发送到你的邮箱.  

其他公司格式转换工具，这里推荐一个：http://joshua.galaxy.42dna.com/wgto23/

怎么样，有没有兴趣做一下基因检测，看下自己的HLA分型呢？阅读原文是新版本地址，旧版正常服务，可以对比下哪个结果好。

这是之前网页的信息：

• 是采用大神开发的snp2hla进行分型的，具体过程可参考我的博客：https://jiawen.zd200572.com/431.html
  snp2hla是大名鼎鼎的Broad研究所开发的，通过snp分型数据来获得HLA分型信息的软件。它的准确度主要依赖于一个尽可能大的，针对特定民族人群的参考数据集。这个网页采用的是2014年发表的东亚人群的参考数据集，部分准确度约为80%。由于不同芯片的数据中HLA区域位点的数目不同，可能获得的结果有n多候选，请悉知。下图是参考数据集的人数与各个基因座准确度的关系，可以看出，在400人左右的参考数据集时（这个网页采用的），准确度因基因座不同而不同。

• 做这个纯属个人爱好，原始数据和结果将在得出结果后删除。也可以按软件说明自己搞，也挺简单的。

• 又做了个R版本的，方法和准确度有区别，可以参考下，现在只能使用23andme数据，其他公司格式建议使用转换工具转成23andme格式后使用https://shiny.zd200572.com/HLA-HIBAG