caffe Linux 配置

1、安装CUDA，CUDA安装在系统目录下，用root账号安装,用root安装！！用root安装！！
CUDA从nvidia官网上下载，这里下载的是rpm包（cuda-repo-rhel7-7-5-local-7.5-18.x86_64.rpm）安装CUDA之前需要安装dkms
从 http://fedoraproject.org/wiki/EPEL 网址下载 epel-release-latest-7.noarch.rpm
用命令$rpm  -ivh  epel-release-latest-7.noarch.rpm 安装源包，
再更新yum源 $yum  repolist
再安装 $yum  install　dkms libvdpau*.x86_64  freeglut*.x86_64
安装cuda：1、 rpm -i cuda-repo-rhel7-7-5-local-7.5-18.x86_64.rpm
          2、 yum clean all
          3、 yum install cuda
          
2、安装matlab

note:下边的$HOME=/home/yszhu
3、anaconda
    bash Anaconda2-4.0.0-Linux-x86_64.sh
    中间填写安装路径，安装在自己目录下的local/anaconda里
    #添加环境变量
    vi ~/.bashrc
    export LD_LIBRARY_PATH="$LD_LIBRARY_PATH:/home/yszhu/local/anaconda/lib"
    export PATH="/home/yszhu/local/anaconda/bin:$PATH"
    source ~/.bashrc

4、Install openblas
    tar -zxvf OpenBLAS-0.2.18.tar.gz
    cd OpenBLAS-0.2.18
    mkdir -p $HOME/local/OpenBLAS
    make -j8
    make PREFIX=$HOME/local/OpenBLAS install
    cd ../
    rm -rf OpenBLAS-0.2.18
    
5、Install cmake [maybe not need if exist]
    tar zxvf cmake-3.5.2.tar.gz
    cd cmake-3.5.2
    mkdir -p $HOME/local/cmake-3.5.2
    ./bootstrap --prefix=$HOME/local/cmake-3.5.2
    make -j8
    make install
    #添加环境变量
    vim ~/.bashrc
    export PATH=/home/yszhu/local/cmake-3.5.2/bin:$PATH
    source ~/.bashrc
    cd ../
    rm -rf cmake-3.5.2
    
6、Install Protobuf
    #先安装c++版
    tar zxvf protobuf-2.6.1.tar.gz
    cd protobuf-2.6.1
    ./configure --prefix=$HOME/local
    make -j8
    make install
    #继续安装Python版
    cd python
    python -V (Make sure you have Python 2.4 or newer)
    python setup.py build （Build and run the tests）
    python setup.py google_test
    python setup.py install
    cd ../../
    rm -rf protobuf-2.6.1
    
7、Install snappy
    tar zxvf snappy-1.1.3.tar.gz
    cd snappy-1.1.3
    ./configure --prefix=$HOME/local
    make -j8
    make install
    cd ../
    rm -rf snappy-1.1.3
    
8、Install leveldb
    tar zxvf leveldb-1.18.tar.gz
    cd leveldb-1.18
    make -j8
    cp -av libleveldb.* $HOME/local/lib/
    cp -av include/leveldb $HOME/local/include/
    cd ../
    rm -rf leveldb-1.18

9、Install OpenCV
    tar zxvf opencv-2.4.8.tar.gz
    cd opencv-2.4.8
    mkdir release && cd release
    cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE=RELEASE -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/local -D BUILD_opencv_gpu=OFF -D CUDA_GENERATION=Kepler -D PYTHON_LIBRARY=$HOME/local/anaconda/bin ..
    make -j8
    make install
    cd ../../
    rm -rf opencv-2.4.8
    
10、Install Boost （安装旧版的没有bug）
    tar zxvf boost_1_60_0.tar.gz
    cd boost_1_60_0
    ./bootstrap.sh --prefix=$HOME/local
    ./b2 -j8
    ./b2 install
安装新版本的boost（boost_1_60_0）里面的gcc.h头文件定义存在bug，解决办法是安装完毕后：
vi $HOME/local/include/boost/config/compiler/gcc.hpp
定位到156行（#if defined(_GLIBCXX_USE_FLOAT128) && !defined(__STRICT_ANSI__)）
把156行修改为#if defined(_GLIBCXX_USE_FLOAT128) && !defined(__STRICT_ANSI__) && !defined(__CUDACC__)即可，不需要重新编译

安装旧版本的boost_1_55_0.tar不存在这个问题（建议安装旧版的）：
    tar zxvf boost_1_55_0.tar.gz
    cd boost_1_55_0
    ./bootstrap.sh --prefix=$HOME/local
    ./b2 -j8
    ./b2 install
    cd ../
    rm -rf boost_1_55_0

11、Install google-glog 
    tar zxvf glog-0.3.4.tar.gz
    cd glog-0.3.4
    ./configure --prefix=$HOME/local
    make -j8
    make install
    cd ../
    rm -rf glog-0.3.4
    
12、Install gflags
    tar zxvf gflags-2.1.2.tar.gz
    cd gflags-2.1.2
    mkdir build && cd build
    CXXFLAGS="-fPIC" cmake -D CMAKE_INSTALL_PREFIX=$HOME/local ..
    make -j8
    make install
    cd ../
    rm -rf gflags-2.1.2
    
13、Install lmdb 
    tar zxvf lmdb-LMDB_0.9.18.tar.gz
    cd lmdb-LMDB_0.9.18/libraries/liblmdb
    make -j8
    make prefix=$HOME/local install
    cd ../../../
    rm -rf lmdb-LMDB_0.9.18
    
14、Install hdf5
    tar zxvf hdf5-1.8.14.tar.gz
    cd hdf5-1.8.14
    ./configure --prefix=$HOME/local
    make -j8
    make check  -j8              # run test suite.
    make install
    make check-install -j8       # verify installation.
    cd ../
    rm -rf hdf5-1.8.14

15、Install cuDNN
    tar zxvf cudnn-7.0-linux-x64-v3.0-prod
    cd cuda
    cp -av lib64/*  ~/local/lib
    cp -av include/*  ~/local/include
    cd ../
    rm -rf cuda
    
## add path to ~/.bashrc

    #CUDA
    export PATH=/ycs/local/cuda/bin:$PATH
    export LD_LIBRARY_PATH=/ycs/local/cuda/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
    #for OpenBLAS
    export LD_LIBRARY_PATH=/home/ycs/local/OpenBLAS/lib:$LD_LIBRARY_PATH
    export OPENBLAS_NUM_THREADS=20
    #for ~/local 
    export LD_LIBRARY_PATH=/home/ycs/local/lib:$LD_LIBRARY_PATH
    export PATH=/home/ycs/local/bin:$PATH
    source ~/.bashrc